| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,884,856 | C→G | 5.1% | P93R (CCG→CGG) ‡ | PP_2540 → | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,884,856 | 0 | C | G | 5.1% | 316.0 / 6.8 | 98 | P93R (CCG→CGG) ‡ | PP_2540 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/43); new base G (2/3); total (52/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TCTGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGGCG > NC_002947/2884707‑2885005 | tctGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGTGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGccc > 1:1323398/1‑150 (MQ=255)tctGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGccc < 2:2192956/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGc < 1:2273506/150‑1 (MQ=255) gAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCa > 1:1771902/1‑150 (MQ=255) aGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCAc > 2:598534/1‑150 (MQ=255) gACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCggc < 1:1350251/150‑2 (MQ=255) gACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCggg > 2:1580347/1‑150 (MQ=255) gACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCggg > 2:1444754/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGTGAGTTGAGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGCTCCCCAGGTGCGCCAGGCGCCGGCGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACCACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg > 1:836938/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 1:557466/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 1:2314536/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACt > 2:264912/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCggcgttgtt < 2:2119071/150‑8 (MQ=255) aGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTc < 1:1645889/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGAtt < 1:621935/150‑1 (MQ=255) cgcAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgg < 1:1667901/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTggg < 2:413031/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATATTGAGCAGCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTggg > 1:1004212/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCACCGCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgggg < 1:1330267/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTggggg > 1:2050836/1‑150 (MQ=255) ccGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgatg < 1:1393172/148‑1 (MQ=255) ccGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgatg > 2:1393172/1‑148 (MQ=255) ccGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGAc > 1:1686272/1‑150 (MQ=255) ccGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGAc > 1:1280158/1‑150 (MQ=255) cGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACt > 2:1362348/1‑150 (MQ=255) gAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGc < 2:1323398/150‑1 (MQ=255) gAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGc < 1:133450/150‑1 (MQ=255) aaTCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCt < 1:1580347/150‑1 (MQ=255) gAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACGTTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAg < 1:1347267/150‑1 (MQ=255) gAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGAc < 1:933790/141‑1 (MQ=255) gAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGAc > 2:933790/1‑141 (MQ=255) ccATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCt < 1:2235040/150‑1 (MQ=255) cATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGACCTGCCCGCAAGTCGAGGTTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGACGTCGGAACTGGCTGCAGGCGCTg > 1:722532/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAc > 1:850030‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAcgcca < 1:676314‑M2/150‑6 (MQ=255) gCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAcgccaac < 1:1770094‑M2/150‑8 (MQ=255) aGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtga > 2:1424360/1‑120 (MQ=255) aGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtga < 1:1424360/120‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATg > 1:1713630/1‑150 (MQ=255) gATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGGAGGTCGACATTCTGGTCAACACCGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTc > 2:968968/1‑150 (MQ=255) gATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTc < 2:676314/150‑1 (MQ=255) tGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCAc < 1:1444754/150‑1 (MQ=255) ttGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTggg > 1:1570177/1‑105 (MQ=255) gCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACCGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGccc < 2:1280158/150‑1 (MQ=255) cGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTgg < 2:478478/115‑1 (MQ=255) cGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTgg > 1:478478/1‑115 (MQ=255) gATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCTTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg > 2:1343050/1‑84 (MQ=255) gATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 1:1343050/84‑1 (MQ=255) gATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCTCGCCCATc > 2:1392025/1‑150 (MQ=255) gATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATc < 2:1686272/150‑1 (MQ=255) tCCCAAGGTGCGCCAGGTGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGa > 2:893393/1‑150 (MQ=255) tCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGa > 1:503402/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgat < 2:1967633/103‑1 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgat > 1:1967633/1‑103 (MQ=255) ggTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCg > 2:384729/1‑84 (MQ=255) ggTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCg < 1:384729/84‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATc < 2:1770094/150‑1 (MQ=255) gTGCGACAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATc > 2:2333748/1‑150 (MQ=255) gcCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAgg < 2:2379885/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGc > 1:1162475/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGc < 2:1713630/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCg > 1:53814/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCggt < 1:264912/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCggtg < 2:503402/150‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCggtg > 2:1653268/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAg > 1:32400/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACACTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAcgccaacagcgcctggcgcaccttgggatcggcaacatcgcctgc < 1:1146425‑M2/150‑46 (MQ=255) ttGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAcgccaacagcgcctggcgcaccttgggatcggcaacatcgcctgcc < 1:2325022‑M2/150‑47 (MQ=255) ttGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGat > 2:2020676/1‑150 (MQ=255) gcggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgat < 2:2176322/81‑1 (MQ=255) gcggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgat > 1:2176322/1‑81 (MQ=255) gcggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggc > 1:1100767/1‑150 (MQ=255) cggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggca < 1:992562/150‑1 (MQ=255) ggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcat > 2:2015383/1‑150 (MQ=255) cTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatggc > 2:1175762/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGcc > 1:359717/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGa > 2:621849/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAg > 1:2139023/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAg > 1:2153479/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAcgccaacagcgcctggcgcaccttgggatcggcaacatcgcctgccacggtatggacct > 2:2325022‑M2/1‑91 (MQ=255) cGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGttt > 2:87542/1‑150 (MQ=255) gACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAg < 2:924133/141‑1 (MQ=255) gACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAg > 1:924133/1‑141 (MQ=255) gACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGtttt > 2:732281/1‑150 (MQ=255) caacaaCGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggtggt < 2:1004212/150‑1 (MQ=255) aacaacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGgtggtg > 1:379856/1‑150 (MQ=255) aacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAat > 1:2150291/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATc < 1:2020676/150‑1 (MQ=255) cccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGACGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATc > 1:526011/2‑150 (MQ=255) ccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCa > 2:1906883/1‑150 (MQ=255) gCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcat < 2:182354/109‑1 (MQ=255) cccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggtg > 1:696259/1‑133 (MQ=255) cccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggtg < 2:696259/133‑1 (MQ=255) ccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGa > 1:1196891/1‑101 (MQ=255) ccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGa < 2:1196891/101‑1 (MQ=255) ccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGgc > 1:2170605/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGgc > 1:742338/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGgc > 2:1863663/1‑150 (MQ=255) cGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGgcg > 2:914885/1‑150 (MQ=255) cGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGgcg > 2:1233379/1‑150 (MQ=255) | TCTGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGGCG > NC_002947/2884707‑2885005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |