| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,902,419 | G→A | 6.4% | L486L (TTG→TTA) | quiC → | 3‑dehydroshikimate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,902,419 | 0 | G | A | 6.4% | 205.7 / 2.6 | 71 | L486L (TTG→TTA) | quiC | 3‑dehydroshikimate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/30); new base A (3/2); total (39/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATTGTGACGACATCTTCCGCGAA > NC_002947/2902273‑2902557 | gtGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTgcgc > 1:938014/2‑150 (MQ=255)cTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTgcgc > 1:1408988/1‑150 (MQ=255)cTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTgcgc > 1:1598487/1‑150 (MQ=255) tGCGCCGCATCGACCACATGGGCCTAGCCTTGCTGGCCGAGTCGCTGGGCAGCTGGGTGTTTTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCa < 2:672330/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCa < 1:2014372/150‑1 (MQ=255) gccgcATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGcc < 2:1573492/150‑1 (MQ=255) cgcATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAg < 2:1747925/150‑1 (MQ=255) aCCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGCTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCa > 1:1807385/1‑150 (MQ=255) aCCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGAACGACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTACGCAGCCAGTGCGGCa > 1:436545/1‑150 (MQ=255) aCCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGCGCTATACTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTACGCAGCCAGTGCGGCa > 1:436071/1‑150 (MQ=255) ccACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCGGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCAc > 1:1707640/1‑150 (MQ=255) tGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTgc < 1:763691/150‑1 (MQ=255) ccTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCt < 2:76340/150‑1 (MQ=255) cTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTg > 2:604940/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGc < 1:1978268/129‑1 (MQ=255) ttGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGc > 2:1978268/1‑129 (MQ=255) tGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGa < 2:598701/150‑1 (MQ=255) gccggccgAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGaa > 1:1661233/1‑150 (MQ=255) ccggccgAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGCTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCCCTGAAc < 2:1807385/150‑1 (MQ=255) cggccgAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACa > 2:2347676/1‑150 (MQ=255) ccgAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtct < 2:215877/150‑1 (MQ=255) cgAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTCCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtctc < 2:1408988/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGa < 2:1586631/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGa > 2:871961/1‑150 (MQ=255) tCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGaa > 1:1579109/1‑150 (MQ=255) gCTGGACCGCTCGATGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTACGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGgaaa < 2:436071/150‑1 (MQ=255) gCTGGACAGCTGGGTGCGGGGCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTACGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGaaaa < 2:436545/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAAcc < 2:384423/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAAcc < 1:604940/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCa < 1:964815/150‑1 (MQ=255) tGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGc > 2:1016758/1‑137 (MQ=255) tGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGc < 1:1016758/137‑1 (MQ=255) ttCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGcc > 1:426932/1‑150 (MQ=255) ttCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAAAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGc < 1:2016726/135‑1 (MQ=255) ttCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAAAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGc > 2:2016726/1‑135 (MQ=255) tACAAGAGCTTGTACGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGc > 1:1859452/1‑109 (MQ=255) tACAAGAGCTTGTACGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGc < 2:1859452/109‑1 (MQ=255) agCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTg < 2:1661233/150‑1 (MQ=255) ttGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGTAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCa > 2:1691998/1‑150 (MQ=255) ttGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCa < 2:1579109/150‑1 (MQ=255) gTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAg > 1:1632320/1‑150 (MQ=255) gTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAg > 2:358507/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGTACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTg < 2:1185664/150‑1 (MQ=255) cgccgACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTc > 2:1825959/1‑150 (MQ=255) cgccgACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGACCTAAACCGCCAGTACGGCGCTCTTCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTc > 1:2123066/1‑150 (MQ=255) gaGGTGGTGCTGCCCGACAAGTATGTCCTAGTCAATATCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCACTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCAt > 2:1970590/1‑150 (MQ=255) aGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAAAACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATc < 1:1760780/150‑1 (MQ=255) gctgcCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGc < 1:1933871/150‑1 (MQ=255) tgcCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCAGCACTTTGCGCCGGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCtt > 2:1324798/1‑150 (MQ=255) cccGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTc > 1:2023855/1‑150 (MQ=255) cccGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAAATCGGAAAACCGCAACACAGCCAAAGATCATGAAAACGTTAA‑CTTC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTc > 1:2377715/1‑150 (MQ=255) ccGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCg < 1:2232651/77‑1 (MQ=255) ccGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCg > 2:2232651/1‑77 (MQ=255) ccGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAA‑CGAGGTTCGGTCGTGCATCACATCGCTTTCg > 2:2359050/1‑150 (MQ=255) cGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGa > 2:117947/1‑150 (MQ=255) ccGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATtgt > 1:2365952/1‑150 (MQ=255) ccGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATtgt < 1:358507/150‑1 (MQ=255) cGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGTCACCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATtgtg < 2:584735/150‑1 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cTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATTGTGACGACATc > 1:2129685/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATTGTGACGACATc > 1:226944/1‑150 (MQ=255) tGGTCAAGACCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATTGTGACGACATCt > 1:918900/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtctc < 2:702184/58‑1 (MQ=255) tCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACAtctc > 1:702184/1‑58 (MQ=255) tCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCgg < 1:675363/111‑1 (MQ=255) tCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCgg > 2:675363/1‑111 (MQ=255) aaGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTg > 2:1216454/1‑103 (MQ=255) aaGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTg < 1:1216454/103‑1 (MQ=255) agCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATTGTGACGACATCTTCCGCGaa > 1:865485/1‑150 (MQ=255) | CTGCGCCGCATCGACCACATGGCCCTAGCCTTGCCGGCCGAGTCGCTGGACAGCTGGGTGCTGTTCTACAAGAGCTTGTTCGACTTCGCCGCCGACGACGAGGTGGTGCTGCCCGACCCGTATGGCCTGGTCAAGAGCCGCGCCTTGCGCAGCCAGTGCGGCACTTTGCGCCTGCCGCTGAACATCTCGGAAAACCGCAACACCGCCATCGCCCATG‑CGCTGTCAAGCTAC‑CGTGGTTCGGGCGTGCATCACATCGCTTTCGATTGTGACGACATCTTCCGCGAA > NC_002947/2902273‑2902557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |