| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,909,328 | G→A | 5.4% | Q385* (CAG→TAG) ‡ | aprDA ← | alkaline protease secretion ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,909,328 | 0 | G | A | 5.4% | 311.0 / 3.6 | 104 | Q385* (CAG→TAG) ‡ | aprDA | alkaline protease secretion ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/49); new base A (3/3); total (52/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GTCCACCTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGATCAC > NC_002947/2909182‑2909475 | tctacccTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCATCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGggc > 2:473556/6‑150 (MQ=255)gTCCACCTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGggc < 1:641486/150‑1 (MQ=255) aCCTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGTCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGggccggc < 1:1889915/150‑1 (MQ=255) aCCTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGggccggc < 2:1151159/150‑1 (MQ=255) cTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCca > 2:2226397/1‑150 (MQ=255) gggCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGTGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCcaca < 2:412994/149‑1 (MQ=255) ggCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTAAACGACGAGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCacac > 1:61903/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACg > 2:1964594/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACg > 1:1770799/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTGGCCGGCCCAggccggcaaggtg < 2:1631674/150‑7 (MQ=255) cAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGc < 1:1104983/150‑1 (MQ=255) cAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGc < 2:803285/150‑1 (MQ=255) aaaGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGcc > 2:363203/1‑150 (MQ=255) aaGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCt < 1:29633/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTa < 1:952131/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTa > 1:648869/1‑150 (MQ=255) gCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTAc < 1:1371550/150‑1 (MQ=255) gggCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCa > 2:643806/1‑150 (MQ=255) gCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCCAggccggcaa < 1:735457/137‑3 (MQ=255) gCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCCAggccggcaa > 2:735457/1‑135 (MQ=255) ttttCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcgg < 2:2068683/150‑1 (MQ=255) ttttCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcgg < 1:273137/150‑1 (MQ=255) ttttCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcgg < 2:1132654/150‑1 (MQ=255) tttCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcggg > 2:1267746/1‑150 (MQ=255) tttCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcggg > 2:13668/1‑150 (MQ=255) cGGCGATGGTGCCTTCGAACCGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACTCCTACCAACAGGCGGGCGa < 2:229870/150‑1 (MQ=255) ggggATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAg < 2:647832/147‑1 (MQ=255) ggCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAg < 1:212771/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTa < 1:363203/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTa < 1:349275/150‑1 (MQ=255) tGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCCAggccggcaag > 2:1786955/1‑119 (MQ=255) tGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCCAggccggcaag < 1:1786955/122‑4 (MQ=255) ggTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGa < 1:643806/150‑1 (MQ=255) ggTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCATCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGa < 1:473556/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCTAGGGTAGAc < 2:2435753/150‑1 (MQ=255) tGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACt > 2:1160367/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACtt > 2:1363663/1‑150 (MQ=255) ttCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCGAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGcc > 1:2168537/1‑150 (MQ=255) ttCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGcc > 1:931937/1‑150 (MQ=255) gAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGa > 2:792652/1‑141 (MQ=255) gAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGa < 1:792652/141‑1 (MQ=255) cTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGGGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgaggccga < 1:2369958/150‑1 (MQ=255) cTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgaggccga > 2:1633568/1‑150 (MQ=255) tCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgaggccgag < 2:648869/150‑1 (MQ=255) cACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGTTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcgg > 1:1637497/1‑121 (MQ=255) cACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAggcgg < 2:1637497/121‑1 (MQ=255) aCGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAgggg > 2:2391549/1‑150 (MQ=255) cGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGc > 1:939234/1‑150 (MQ=255) cGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGc > 1:939787/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCTAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGa < 1:1149492/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGAc > 2:853086/1‑127 (MQ=255) cTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGAc < 1:853086/127‑1 (MQ=255) gCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGa < 1:2226397/150‑1 (MQ=255) gTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAg < 1:2188843/150‑1 (MQ=255) tccAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTg > 2:447586/2‑150 (MQ=255) ccAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGt > 1:251511/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGt > 2:1382840/1‑150 (MQ=255) ccAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATAGGCGCCGTCCAGCAGTGCCGTGCCGGCCAGATGCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGt > 1:2124619/1‑150 (MQ=255) ccACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCAcc > 2:1857164/1‑150 (MQ=255) aCGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGATACCCAGGCTGTCACCCg > 1:1341932/1‑150 (MQ=255) gggCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGCCCCCCAGGCTGTCACCCggg < 1:565539/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCt > 2:128024/1‑150 (MQ=255) gCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGAc > 1:1551362/1‑93 (MQ=255) gCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAg < 1:13668/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGTACAGCAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGCTGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCGGAAGc > 1:1002191/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGc < 1:1434979/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCAcccc > 1:1989505/1‑150 (MQ=255) aGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTgg < 2:70275/44‑1 (MQ=255) aGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTgg > 1:70275/1‑44 (MQ=255) gTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGt > 1:363202/1‑150 (MQ=255) tGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTa > 1:1364199/1‑150 (MQ=255) gAAGATATCGACACCGTCCAGGCGCAACTTGCCAGCCTGAGCCGGCCACACGCCTACTAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTAc > 2:2232515/1‑150 (MQ=255) tatCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTGGACTTGCccgag < 1:1532627/83‑1 (MQ=255) tatCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCGACCAACAGGCGGGCGAGGGTGGACTTGCccgag > 2:1532627/1‑83 (MQ=255) tCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgaggccgagg < 2:707062/88‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgaggccgagg > 1:707062/1‑88 (MQ=255) tCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCggg > 1:1281885/1‑117 (MQ=255) tCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCggg < 2:1281885/117‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTg > 1:1766514/1‑150 (MQ=255) gcCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCAcc < 1:2002944/130‑1 (MQ=255) gcCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCAcc > 2:2002944/1‑130 (MQ=255) gcCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGtgct < 2:1766514/150‑1 (MQ=255) gcttCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAAGCTGTACACCGGGGAAAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGtgctg > 1:1902170/4‑150 (MQ=255) cGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGtgctgc < 1:1160367/150‑1 (MQ=255) gTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgagg > 2:1266148/1‑74 (MQ=255) gTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCccgagg < 1:1266148/74‑1 (MQ=255) cAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCAGCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGcc > 2:1230331/1‑150 (MQ=255) aGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCt > 2:684939/1‑150 (MQ=255) gcgcACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTgg < 2:939234/150‑1 (MQ=255) gcgcACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTgg < 2:939787/150‑1 (MQ=255) gcgcACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTgg < 2:1770799/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCg < 1:1857164/150‑1 (MQ=255) tggCCGGCCCAGGCCGGCAACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCg > 1:1060655/3‑150 (MQ=255) cgtccTGGGCCGGCCACACGGCTACGATCAGGAGGGCGAGGGTAGACGTGCCCGAGGCAGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGa < 2:1086082/147‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAg < 2:1782765/40‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAg > 1:1782765/1‑40 (MQ=255) gCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGATc > 1:1540967/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGATGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGAtag > 1:1086082/1‑148 (MQ=255) cTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGATCAc < 2:2168537/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGATCAc > 1:1254165/1‑150 (MQ=255) | GTCCACCTCGGCAAAGCGGGCGATGTTTTCGGCGATGGTGCCTTCGAACAGCTCCACGTCCTGCGGCAGGTAGCCCAGCCACGGGCCCAGTTCGGCCTTGTTCCAGGTGAAGATATCGGCGCCGTCCAGGCGCACCTTGCCGGCCTGGGCCGGCCACACGCCTACCAACAGGCGGGCGAGGGTAGACTTGCCCGAGGCCGAGGGGCCGATGACACCCAGGCTGTCACCCGGGGCCAGGCTGAAGCTCACCCCGCGTACGATGCTGGTGCTGCTGCCTGGGGCGCCGGCGATCAC > NC_002947/2909182‑2909475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |