| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,935,901 | C→G | 6.3% | intergenic (+153/‑109) | PP_2568 → / → PP_2569 | ring‑cleaving dioxygenase/MHS family metabolite MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,935,901 | 0 | C | G | 6.3% | 246.9 / 5.8 | 79 | intergenic (+153/‑109) | PP_2568/PP_2569 | ring‑cleaving dioxygenase/MHS family metabolite MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/36); new base G (2/3); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
CCCCGCCAAAATCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGC > NC_002947/2935755‑2936046 | ccccGCCAAAATCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCg > 1:1787618/1‑150 (MQ=255) cAAAATCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCtcgt > 2:1610016/1‑150 (MQ=255) aaaaTCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCGAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGGCCGCCtcgga < 2:1235478/150‑3 (MQ=255) aaaaTCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCtcgtc > 2:1493771/1‑150 (MQ=255) aaaTCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGGCCGCCtcggat < 1:64669/150‑4 (MQ=255) aTCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTg < 1:105756/150‑1 (MQ=255) aTCGTCACCCAGCCCGCTATCGCCCGACACCCCCGTGCTGCGTTTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGCCGGGTGTATATCCAGCCAAGCCCGATTACGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTg < 1:493968/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTc > 2:273608/1‑150 (MQ=255) gCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTcgcg > 1:126075/1‑150 (MQ=255) caaaCCAGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCCCACGAAAGGCCCGACGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCCTCGTACTTCgcgc > 2:462583/3‑150 (MQ=255) aaCCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGTTAACCTGCCAATCTCTATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCaa < 1:290585/150‑1 (MQ=255) ccGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCa > 2:361732/1‑150 (MQ=255) tATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAaagc > 1:1437209/1‑150 (MQ=255) cGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAaagcaag < 1:2177000/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAaagcaagc < 2:2307479/150‑1 (MQ=255) cccGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAgcg > 2:1432352/1‑150 (MQ=255) ggCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAATCAAAGCAAGCGCCa < 1:506179/150‑1 (MQ=255) ggCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGccc > 1:2140218/1‑149 (MQ=255) ccccGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGc < 2:644079/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCt < 2:126075/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTgg < 1:1296046/150‑1 (MQ=255) gcGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGa < 1:1610016/150‑1 (MQ=255) gtcgtcCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGt > 1:227268/1‑150 (MQ=255) tcgtcCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCCGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTg > 1:312511/1‑150 (MQ=255) gccgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGtt < 1:463090/150‑1 (MQ=255) gccgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGtt < 1:1118707/150‑1 (MQ=255) gccgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGtt < 2:588135/150‑1 (MQ=255) gccgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATACCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGtt > 1:698429/1‑150 (MQ=255) cgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGCGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTtgt < 1:1352632/150‑1 (MQ=255) cgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTtgt > 1:1548513/1‑150 (MQ=255) cgccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTtgt > 1:581581/1‑150 (MQ=255) gccCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTtgtg < 1:1779412/150‑1 (MQ=255) ccTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAg < 2:227268/150‑1 (MQ=255) tctcGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGt < 1:273608/150‑1 (MQ=255) tctcGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGt > 1:1149669/1‑150 (MQ=255) tctcGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAACAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGt > 1:514716/1‑150 (MQ=255) aGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCCGCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCGTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGGGAGGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGc > 1:555624/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGcc > 2:1315961/1‑146 (MQ=255) ccGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGcc < 1:1315961/146‑1 (MQ=255) ccGGCGGCTGGATATCCAGCCACTCCCGATGATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGCCGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTa < 2:1136539/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGGTGGTTATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCAGGAACCTTGCTGCGATCCGCGGCGGCCCGCCTAGTCGTGATTCGCGCAATCAAAGCAAGCGCGAGGGCCGGGGTGCGACGGTGAAGGGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTa < 2:514716/150‑1 (MQ=255) cggcggGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTAt > 2:581283/1‑150 (MQ=255) gcggGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGa < 2:1587584/150‑1 (MQ=255) gTGGATATCCAGCTAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTgg > 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tCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACgg > 2:1904686/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCAATCCCGACTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGa < 1:721570/147‑1 (MQ=255) ccAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGa < 1:1157863/150‑1 (MQ=255) aGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCtcgtc < 2:97747/58‑1 (MQ=255) aGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCtcgtc > 1:97747/1‑58 (MQ=255) aaTCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAAc > 1:834444/1‑150 (MQ=255) aTCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAAcc > 1:860058/1‑150 (MQ=255) tCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAAccc < 1:1904686/150‑1 (MQ=255) cccGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCa < 2:834444/150‑1 (MQ=255) ccGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCAt > 1:678988/1‑150 (MQ=255) gATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATgg < 1:1493771/150‑1 (MQ=255) gATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATgg < 2:581581/150‑1 (MQ=255) ttATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCaaa > 2:1247612/1‑64 (MQ=255) ttATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCaaa < 1:1247612/64‑1 (MQ=255) ttATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGACTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCg < 2:312511/150‑1 (MQ=255) aTGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGt < 1:581283/150‑1 (MQ=255) ttCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGt < 2:1467400/91‑1 (MQ=255) ttCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGt > 1:1467400/1‑91 (MQ=255) tGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCGACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCGCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACa > 2:1231517/1‑150 (MQ=255) tGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACa > 2:241389/1‑150 (MQ=255) tGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACa < 2:1149669/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGca < 2:2321437/150‑1 (MQ=255) tgcGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCGAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCAc > 1:2389704/1‑150 (MQ=255) tgcGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGGTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCTAc > 1:560201/1‑150 (MQ=255) gcGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACg < 1:2098876/150‑1 (MQ=255) aTCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACAAATGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGc > 1:623918/1‑150 (MQ=255) gacGAGGCGGGCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGt < 1:2071/81‑1 (MQ=255) gacGAGGCGGGCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGt > 2:2071/3‑83 (MQ=255) gacGAGGCGGGCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCa > 1:361074/3‑150 (MQ=255) cGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAgc > 2:698690/1‑150 (MQ=255) gcggcCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAgcgcgc < 1:698690/150‑1 (MQ=255) | CCCCGCCAAAATCGTCAGCCAACCCGCTATCGCCCGGCACCCCGGTGCTGCGTGTCGTCCAGGCCGCCCTCTCGTGCAGGGCCCGGCGGGTGGATATCCAGCCAATCCCGATTATGCTTCATGAACCTTGCTGCGATCCGAGGCGGCCCGCCTCGTCGTGCTTCGCGCAACCAAAGCAAGCGCCAGGGCCTGGGTGCGACGGTGAAGTGGTTGTGAGGTGCTCCGGCCTGTATGACAACATGACGGAGGCAACCCATGGCGGTTCTCGACAGCACATCCACGGGCAGCGCGC > NC_002947/2935755‑2936046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |