| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,034,672 | A→G | 8.1% | L187P (CTG→CCG) | PP_2647 ← | MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,034,672 | 0 | A | G | 8.1% | 210.3 / 7.1 | 74 | L187P (CTG→CCG) | PP_2647 | MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/27); new base G (4/2); total (45/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.49e-01 | |||||||||||
GCGCCAGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGTCAGGTGCCAGGC > NC_002947/3034523‑3034816 | gcgcCAGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACca < 1:1491485/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcag < 2:638410/150‑1 (MQ=255) gcCAGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagt < 2:722091/150‑1 (MQ=255) gcCAGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagt < 2:669040/150‑1 (MQ=255) aGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAACCCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATTCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgca < 1:1343369/150‑1 (MQ=255) aGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgca < 2:1198745/150‑1 (MQ=255) aGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgca < 1:649895/150‑1 (MQ=255) gCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgcagt > 2:1921687/1‑150 (MQ=255) gATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGAc > 2:1640536/1‑150 (MQ=255) aTCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcag > 1:1179943/1‑140 (MQ=255) aTCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcag < 2:1179943/140‑1 (MQ=255) tCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCa < 2:1587467/150‑1 (MQ=255) ccAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCa < 2:2312136/149‑1 (MQ=255) aGCACCACGGCCATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGGACGCCGCTGGGAGGTCGCGGATGCGGGGGGCTTTTTCCGGCAGCGGCCGGGGCAGCAGGATCACCTGTGCCAGCAGTACCGGTACGCTTACCAGTGCAGTGACCAgg < 2:1572401/150‑1 (MQ=255) aaCACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAAc < 2:1573905/150‑1 (MQ=255) acacGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACg > 2:1209163/1‑150 (MQ=255) acGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTc < 2:1655206/150‑1 (MQ=255) ggCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgca > 1:138226/1‑133 (MQ=255) ggCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgca < 2:138226/133‑1 (MQ=255) cGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATgc < 2:1251951/150‑1 (MQ=255) gATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATgcg > 2:1082312/1‑150 (MQ=255) gATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATgcg > 2:275304/1‑150 (MQ=255) gATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATgcg > 1:1186554/1‑150 (MQ=255) aaaCCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAg > 1:1712335/1‑150 (MQ=255) ccccGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATc < 2:2286840/149‑1 (MQ=255) cGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAgg > 2:2071681/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCa > 1:1626661/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCACCAGCCCCGGTCTGGCTGGGAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCa > 1:145467/1‑150 (MQ=255) gggTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGc < 1:1117908/150‑1 (MQ=255) ggTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGcc > 1:1717507/1‑150 (MQ=255) gTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCa < 2:714070/113‑1 (MQ=255) gTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCa > 1:714070/1‑113 (MQ=255) gTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTCCAGTGACCAGGAATGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCa > 1:1322077/1‑150 (MQ=255) atgaACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTg > 1:972407/1‑150 (MQ=255) aacaacGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCg > 1:1587346/1‑150 (MQ=255) caacGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGAc > 1:673737/1‑150 (MQ=255) aacGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACa < 2:1210716/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTCGCGGATGCGGCTGGCCAATTCCCGCGTCAACGTTGTCAGGAGGGACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGc < 2:261116/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGa < 2:2280407/97‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGa > 1:2280407/1‑97 (MQ=255) tGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgcag < 1:2083484/92‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACcagtgcag > 2:2083484/1‑92 (MQ=255) gTCGCGGAGGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCAc < 2:314963/150‑1 (MQ=255) tCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATgc > 1:1049732/1‑103 (MQ=255) tCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATgc < 2:1049732/103‑1 (MQ=255) atgcggatgGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTc < 1:1209163/150‑1 (MQ=255) gatgGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAg > 2:2136890/1‑150 (MQ=255) atgGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAgg > 1:588099/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGt > 2:2109859/1‑150 (MQ=255) gCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTGCCGTCGCCAGGGtt > 1:1075596/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGCCCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTa > 2:1123332/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAg < 1:1659314/100‑1 (MQ=255) ccTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAg > 2:1659314/1‑100 (MQ=255) cTTTTCCGGCATCAGCCGCGGGAGTAGGAACACCTGTGCCAGCAGCGCCGGTACGCCTACCAGCGCAGTGACCAGGAACGTCATGAGCACGCCAATCAGGACACTCAGCAAGGTGCCGGGGTGCACGCCCGGGTCCGTCGCCAGGGTTAc < 2:1207771/150‑1 (MQ=255) cTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTAc > 1:1012872/1‑150 (MQ=255) cTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTAc < 2:1186554/150‑1 (MQ=255) cTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTAc > 1:475305/1‑150 (MQ=255) cGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCAATCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTAcgcccgc > 1:744478/1‑150 (MQ=255) cATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCat < 1:961797/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCAGCAGGAACACCCGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCatgatgat < 1:1965191/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCatgatgatg < 1:1640536/150‑1 (MQ=255) cgGCAGCAGGCACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACACCCGCCATGATGATGGa < 1:587997/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGt < 2:1824255/150‑1 (MQ=255) agcagGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttg > 2:1087802/1‑150 (MQ=255) gcagGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAg < 1:771937/121‑1 (MQ=255) gcagGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAg > 2:771937/1‑121 (MQ=255) gAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttggcttt > 1:247168/1‑150 (MQ=255) gAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttggcttt > 1:194890/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGcc < 1:1425000/84‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGcc > 2:1425000/1‑84 (MQ=255) cTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTAc > 1:2038647/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTCTGGCTAc < 1:1082312/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGAGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATTATGATGGAGTTGGCTTTGCCTAc > 2:8656/1‑150 (MQ=255) gtgCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGc > 2:946719/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCACCGGTACGCCTACCGGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCa > 2:1190622/1‑150 (MQ=255) tgcaCTGGTAGGCGTACCGGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttggctttggc > 2:275612/2‑137 (MQ=255) tgcaCTGGTAGGCGTACCGGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttggctttggc < 1:275612/136‑1 (MQ=255) tgcaCTGGTAGGCGTACCGGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCg > 2:1439588/2‑150 (MQ=255) gcaNCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGt > 2:1501262/1‑150 (MQ=255) gcaCTGGTAGGCGTACCGGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttggctttgg < 1:1867535/135‑1 (MQ=255) gcaCTGGTAGGCGTACCGGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGttggctttgg > 2:1867535/1‑135 (MQ=255) gcaCCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGt > 1:262691/1‑150 (MQ=255) gcaCCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGt > 2:1004865/1‑150 (MQ=255) gTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGTCAGGTg > 1:1603553/1‑150 (MQ=255) gTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGTCAGGTg > 1:1504603/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGTCAGGTGCCAGGc > 2:1873699/1‑150 (MQ=255) tACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAgg < 1:854773/43‑1 (MQ=255) tACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAgg > 2:854773/1‑43 (MQ=255) | GCGCCAGGCCGATCAGCAACACGGCGATCAAACCGACCCGTGCTTGCGGGTTGATGAACAACGCTGGCAGGTCGCGGATGCGGATGGCCTTTTCCGGCATCAGCCGCGGCAGCAGGAACACCTGTGCCAGCAGCACCGGTACGCCTACCAGTGCAGTGACCAGGAACGTCATGCGCCAGCCCATCAGGCCACTCAGCCAGGTGCCGACAGGCACGCCCACTACCGTCGCCAGGGTTACGCCCGCCATGATGATGGAGTTGGCTTTGGCTACGCCCATTCCGTCAGGTGCCAGGC > NC_002947/3034523‑3034816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |