| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 272,981 | G→C | 6.5% | H263D (CAC→GAC) | metNB ← | methionine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 272,981 | 0 | G | C | 6.5% | 280.5 / 9.3 | 93 | H263D (CAC→GAC) | metNB | methionine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/45); new base C (3/3); total (44/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.74e-01 | |||||||||||
GAACAGGGCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGTTGATA > NC_002947/272832‑273126 | gAACAGGGCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTg < 2:926846/150‑1 (MQ=255) agtgCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTGCGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTCCGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGATAGCTTGTCCT‑GCAAAGGGACGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCTTGACGa < 2:1124714/147‑1 (MQ=255) aGGGCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGa < 2:1980369/150‑1 (MQ=255) gggCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAg < 2:920192/150‑1 (MQ=255) gCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGt < 1:1111753/150‑1 (MQ=255) aCAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGAGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAAc > 2:45292/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAacac > 2:2294680/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACAcc > 2:1884217/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACAccc > 1:1515365/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACAccc < 1:1658382/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCaaa < 1:2446450/141‑1 (MQ=255) gCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCaaa > 2:2446450/1‑141 (MQ=255) gAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCGATGAGGGGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGAc < 2:2433252/150‑1 (MQ=255) cACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTc < 2:646776/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGc < 1:1051715/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGc > 1:1800986/1‑150 (MQ=255) cGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGcc > 2:813568/1‑150 (MQ=255) cGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGcc > 2:1522175/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGccc > 1:1559564/1‑150 (MQ=255) gTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCt < 2:2310017/150‑1 (MQ=255) tttCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGTTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGGGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTc > 2:1326275/1‑150 (MQ=255) tCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GAACCCAGTGGAGCAGGCTGCGGGGAGGCGCGTGACGAGGTGACCCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCaa > 1:1223545/1‑150 (MQ=255) aGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAAcc > 1:1194723/1‑150 (MQ=255) cTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTTCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACTCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTg < 2:1255024/150‑1 (MQ=255) tACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTgc > 1:1752852/1‑150 (MQ=255) tACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTgc > 1:1173345/1‑150 (MQ=255) tACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTCACGAGGttac < 1:1942473/112‑4 (MQ=255) tACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTCACGAGGttac > 2:1942473/1‑109 (MQ=255) gcTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAAc > 2:1611060/1‑138 (MQ=255) gcTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAAc < 1:1611060/138‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTcc > 1:1762846/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCa < 1:1522175/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCGGGTGGGCCTGGGGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGCGCAGGGTGCGGGTAACCTCGAGACGCGGTAAACCACACGCCCGGGTTTCTTCGCGCTGTTCAATCAGTGCGCCGCGTTCCAGc < 2:1206725/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAAc > 2:1172948/1‑125 (MQ=255) gCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAAc < 1:1172948/125‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCgg < 1:813568/150‑1 (MQ=255) gggCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGt < 1:951703/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGTTTAGCACGCCGACGAATA‑TGTGCGGGTAACCCCGAGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTg > 1:414434/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTg < 1:2294680/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTg < 1:690344/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCa < 1:705398/150‑1 (MQ=255) gctggctTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTc > 1:409170/1‑150 (MQ=255) tggctTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGc < 1:2016367/141‑1 (MQ=255) tggctTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGc > 2:2016367/1‑141 (MQ=255) tggctTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTcgc < 1:710718/150‑1 (MQ=255) ggctTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTcgcg > 2:1061652/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCa > 1:184393/1‑150 (MQ=255) aGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCAcc < 2:1194723/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCAcc > 2:780130/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGGTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCg > 1:1592277/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGAAGGGTGAAGCTTATCACCTGACGAGGTGAACCAAACCCACGCCATACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGc < 1:534649/150‑1 (MQ=255) ggTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCg < 2:2113591/150‑1 (MQ=255) gTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGACCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGt > 2:1623916/1‑150 (MQ=255) tAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCCCCGACATCTCGTg < 2:1173345/150‑1 (MQ=255) tAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTg < 2:276500/150‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTgg < 2:1800986/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTg > 2:2215708/1‑148 (MQ=255) gCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTg < 1:2215708/148‑1 (MQ=255) cTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGt < 2:360004/150‑1 (MQ=255) ttGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGAATCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTg > 1:324158/1‑150 (MQ=255) tGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGa < 2:706486/150‑1 (MQ=255) gCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGaa > 2:68809/1‑48 (MQ=255) gCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGaa < 1:68809/48‑1 (MQ=255) ccT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCa < 2:1368324/135‑1 (MQ=255) ccT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCa > 1:1368324/1‑135 (MQ=255) ccT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCa < 1:1623916/150‑1 (MQ=255) cT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAg > 1:1476775/1‑150 (MQ=255) gCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTcg > 1:1170653/1‑119 (MQ=255) gCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTcg < 2:1170653/119‑1 (MQ=255) cAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCAc < 2:184393/150‑1 (MQ=255) aaGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTggg < 2:388141/138‑1 (MQ=255) aaGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTggg > 1:388141/1‑138 (MQ=255) aGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTTACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGAt < 2:933798/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGcc > 2:1970865/1‑150 (MQ=255) aGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGcccc > 2:2108882/1‑150 (MQ=255) gggTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCa < 2:1476775/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACTCCCGCCAGACCTCGCCCTGCACAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACCATGGTCAGCCCCAGgc < 1:1326275/150‑1 (MQ=255) gggTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGGTCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCt < 1:1884217/150‑1 (MQ=255) ttcaCCTCGTCACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGTCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTgg < 2:2029239/114‑1 (MQ=255) ttcaCCTCGTCACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGTCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTgg > 1:2029239/4‑117 (MQ=255) ttcaCCTCGTCACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTgg > 2:2372518/4‑150 (MQ=255) gTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGt > 1:1819133/1‑119 (MQ=255) gTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGt < 2:1819133/119‑1 (MQ=255) caCCTCGTCACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGtt < 1:2372518/149‑1 (MQ=255) ccTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGTTGa < 2:1752852/150‑1 (MQ=255) cTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATg > 2:1804930/1‑127 (MQ=255) cTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATg < 1:1804930/127‑1 (MQ=255) tCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGa > 2:256275/1‑85 (MQ=255) tCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGa < 1:256275/85‑1 (MQ=255) tCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGTTGata > 1:1469445/1‑150 (MQ=255) tCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGTTGata > 1:2291977/1‑150 (MQ=255) tCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGGTGata > 1:630526/1‑150 (MQ=255) tGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCgg < 2:494146/75‑1 (MQ=255) tGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCgg > 1:494146/1‑75 (MQ=255) | GAACAGGGCAGACAGCTCTGGCTCGCCGAGCACCGTCAGTTTCAGCACTACGGCGCTGTTGCCGCTCGCCGGGTGGGCCTGGAGGCTGGCTTGCAGTGCGGCGGGTAGCTTGGCCT‑GCAAAGGGGCGAGCAGGGTGCGGGTAACCTCGTGACGAGGTGAACCAAACACCCGCCAGACCTCGCCCTGCTCAACCACTGCGCCGCGTTCCAGCACCACTACCCGGTGGCAGATGTCGCGAATCACCGCCATTTCGTGGGTGATCAGCACGATGGTCAGCCCCAGGCGCTGGTTGATA > NC_002947/272832‑273126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |