Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 284,587 | T→A | 15.6% | intergenic (+33/+30) | betT‑II → / ← atsK | choline/carnitine/betaine transporter/alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 284,587 | 0 | T | A | 15.6% | 206.4 / 30.6 | 84 | intergenic (+33/+30) | betT‑II/atsK | choline/carnitine/betaine transporter/alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/33); new base A (4/9); total (42/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.82e-01 |
CTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTG > NC_002947/284441‑284736 | cTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGc < 1:11706/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGc > 2:1698646/1‑150 (MQ=255) aaGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGaa > 1:1574486/1‑150 (MQ=255) aaGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGaa < 2:2136019/150‑1 (MQ=255) aaGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGaa < 2:276565/150‑1 (MQ=255) aGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGT‑CTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAaga < 2:1155809/150‑1 (MQ=255) aGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGT‑CTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAaga < 2:2096121/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAaga < 1:321637/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGT‑CTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAagag < 2:1835938/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAagag < 2:1156710/150‑1 (MQ=255) gCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGcc > 2:2429064/1‑150 (MQ=255) aGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTTGCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑Ga > 1:2089135/1‑150 (MQ=255) aaCTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACa < 1:2049023/150‑1 (MQ=255) tATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGc > 1:2060842/1‑150 (MQ=255) tGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAaga < 2:89196/136‑1 (MQ=255) tGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAaga > 1:89196/1‑136 (MQ=255) gggcgtggtggGCGACGGCGAGGAGCGGATCATCAACGACATGCGCGACCAGTACGAGCGGCGCATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCCCTCCTGTCCTGGGATCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCaa < 2:730936/145‑1 (MQ=255) tACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGt < 1:1321880/150‑1 (MQ=255) tACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGt < 2:1973470/150‑1 (MQ=255) tACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCAACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTACGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGt < 1:553768/150‑1 (MQ=255) aCAGCAAGGAGCAGATCATCAACGAATTCTTCTTTCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAANGTg < 2:1495369/150‑1 (MQ=255) aaGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATcc < 1:1194042/150‑1 (MQ=255) gATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTg < 1:378987/137‑1 (MQ=255) gATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGATTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTg > 2:378987/1‑137 (MQ=255) atcatcAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATg > 1:929459/1‑150 (MQ=255) caACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGc > 1:903518/1‑150 (MQ=255) aaCGACATCCTCGACCAGTACGAGCTGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGcc < 1:1698646/150‑1 (MQ=255) aCGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGccc > 2:1375357/1‑150 (MQ=255) tCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGAAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCa > 2:983218/1‑150 (MQ=255) ccAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACccg > 2:919889/1‑150 (MQ=255) cAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAg < 1:2342523/112‑1 (MQ=255) cAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAg > 2:2342523/1‑112 (MQ=255) gTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTGGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACccgccg > 2:199530/1‑150 (MQ=255) tACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCgg > 1:89424/1‑150 (MQ=255) gAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtc > 2:1360751/1‑150 (MQ=255) aGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcg < 1:1375357/150‑1 (MQ=255) ggCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcggtc < 2:2060842/150‑1 (MQ=255) acaTGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTcggtcggt < 1:2183319/150‑1 (MQ=255) aTGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTaa < 1:80709/150‑1 (MQ=255) aTGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTaa > 2:1292151/1‑150 (MQ=255) tGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGaa > 2:379724/1‑69 (MQ=37) tGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGaa < 1:379724/69‑1 (MQ=37) gCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTACCCGCGAAGCGGAGC‑TGGGTGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAatc > 1:289855/1‑150 (MQ=255) aGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCGTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAatcat > 1:2017656/1‑150 (MQ=255) aGTACCTGCACCTGGTCCGCTGAAACATTGTTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAatcat < 1:388/150‑1 (MQ=255) ccTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCAc < 1:1468865/150‑1 (MQ=255) tGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCg > 1:173148/1‑150 (MQ=255) gagcttGGTCAGCGGACCAGGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGc > 2:1923841/6‑150 (MQ=255) ccTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGtt > 1:1665890/1‑126 (MQ=255) ccTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGtt < 2:1665890/126‑1 (MQ=255) cTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCaaaa > 1:470368/1‑150 (MQ=255) ggTCCGCTGATCAAGGTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATg > 2:1281808/1‑150 (MQ=255) cagcggaccagGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTG < 1:1923841‑M1/145‑1 (MQ=255) agcTGAACAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGG > 2:2112000‑M1/2‑150 (MQ=255) gCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGc < 2:284662/79‑1 (MQ=255) gCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGc > 1:284662/1‑79 (MQ=255) gACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCa > 2:2046853/1‑52 (MQ=255) gACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCa < 1:2046853/52‑1 (MQ=255) gACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCa > 1:2135702/1‑150 (MQ=255) aCCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCAc > 1:613887/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCAcgc > 1:1020528/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCT > 2:1990920‑M1/1‑141 (MQ=255) cAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCT < 1:1990920‑M1/141‑1 (MQ=255) cAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCGAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCCcgc > 2:383312/1‑150 (MQ=255) aGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCgg > 2:2186744/1‑150 (MQ=255) ctctCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGtt < 1:1554031/150‑1 (MQ=255) cctgtcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTcc > 1:919889‑M2/1‑148 (MQ=255) ctgtctggcctCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTccca < 1:716540‑M2/146‑5 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCa < 2:716540/150‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcggtcg < 1:293241/97‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcggtcg > 2:293241/1‑97 (MQ=255) ctTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGGACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACg > 1:1410421/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGc > 1:291293/1‑76 (MQ=255) ttCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGc < 2:291293/76‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGGACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCa > 1:829721/1‑78 (MQ=25) ttCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGGACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCa < 2:829721/78‑1 (MQ=25) ttCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTG > 1:1514632‑M1/1‑120 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTG < 2:1514632‑M1/120‑1 (MQ=255) tCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCa > 2:1993065/1‑150 (MQ=255) gcgGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCAtt < 2:1574486/150‑1 (MQ=255) gcgGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCAtt < 1:1281808/150‑1 (MQ=255) gggCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGt > 1:434992/1‑44 (MQ=255) gggCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGt < 2:434992/44‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCt < 1:2112000/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTg > 2:1383805/1‑150 (MQ=255) | CTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATTCTCCTG > NC_002947/284441‑284736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |