| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,195,808 | A→T | 5.7% | L101Q (CTG→CAG) | dhaT ← | 1,3‑propanediol dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,195,808 | 0 | A | T | 5.7% | 271.1 / 6.2 | 87 | L101Q (CTG→CAG) | dhaT | 1,3‑propanediol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/39); new base T (2/3); total (45/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.14e-01 | |||||||||||
GCCGGCCGTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTCCAGCAGGCCTGCT > NC_002947/3195663‑3195954 | gccggccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑cggcag < 1:7035/150‑1 (MQ=255) ccggccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGNTGGCCTNGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCNgg < 1:2064457/150‑1 (MQ=255) ccggccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAgg > 2:579528/1‑150 (MQ=255) ccggccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAgg > 2:2291390/1‑150 (MQ=255) cggccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGc > 2:2203109/1‑150 (MQ=255) ccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGt < 1:764155/150‑1 (MQ=255) ccgTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGAACAACACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGt < 1:145809/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACACTGCGGAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CTGCTGGCCGtgg < 2:566167/150‑3 (MQ=255) gATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGt > 2:1778369/1‑150 (MQ=255) gATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGt < 2:2204135/150‑1 (MQ=255) gacgaTGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCg > 1:922927/1‑150 (MQ=255) ggCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAgcgc > 2:1667923/1‑150 (MQ=255) gCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCt > 2:2174874/1‑150 (MQ=255) gATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGc > 2:2279545/1‑150 (MQ=255) ggCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGCTAGCGCTGGGCGgt < 2:1851992/150‑1 (MQ=255) ggCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGgt > 2:349854/1‑150 (MQ=255) aTGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTTTGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGtgtg > 2:2301362/1‑150 (MQ=255) tGGGTAAGAGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCGGCAGGCTACTGGCCGTGGCCGCATCTAATGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTgg < 1:168755/150‑1 (MQ=255) gggTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGt < 2:1258556/150‑1 (MQ=255) aaGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGAt < 2:922927/150‑1 (MQ=255) cGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATgtc > 1:170080/1‑150 (MQ=255) tGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTgg > 1:2124163/1‑140 (MQ=255) tGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTgg < 2:2124163/140‑1 (MQ=255) gACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTg > 1:1809116/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTgcgc < 1:160883/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTgcgc > 2:2196935/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTgcgc > 1:2404356/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTATAGACATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTgcgc > 2:1401794/1‑150 (MQ=255) ttCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATa < 1:422631/100‑1 (MQ=255) ttCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATa > 2:422631/1‑100 (MQ=255) ttCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGAt < 2:934356/135‑1 (MQ=255) ttCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGAt > 1:934356/1‑135 (MQ=255) tCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGt < 2:2308662/124‑1 (MQ=255) tCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGt > 1:2308662/1‑124 (MQ=255) tCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGcc > 2:905289/1‑150 (MQ=255) cTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCtt < 2:1809116/150‑1 (MQ=255) cTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCtt > 2:932482/1‑150 (MQ=255) tCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGa > 1:851756/1‑124 (MQ=255) tCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGa < 2:851756/124‑1 (MQ=255) gATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGcccc < 1:584779/98‑1 (MQ=255) gATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGcccc > 2:584779/1‑98 (MQ=255) cGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTcc < 1:2291390/150‑1 (MQ=255) ggCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCg > 1:16551/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCg > 1:826502/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGACGCGACGATCTCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCg > 2:1902802/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGc < 2:2077535/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGc < 1:905289/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGc < 1:579528/150‑1 (MQ=255) cgtcgtGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCa < 1:2083132/150‑1 (MQ=255) gtcgtGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCAc > 2:1569947/1‑150 (MQ=255) gtcgtGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCAc < 2:452206/150‑1 (MQ=255) gtGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTc < 2:962079/150‑1 (MQ=255) gtGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATAGAGCTGAAG‑AGCACACGTCTGAGCAGGCGTTCCGGACCCTGGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTc > 1:1487631/1‑150 (MQ=255) tGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTcc < 1:2196935/150‑1 (MQ=255) tGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTcc < 1:1989993/150‑1 (MQ=255) gggTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGt > 1:1281179/1‑105 (MQ=255) gggTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGt < 2:1281179/105‑1 (MQ=255) 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atcGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAg < 2:2046766/150‑1 (MQ=255) atcGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAg > 1:312234/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTacaca > 2:603777/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACg > 2:603497/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCTGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGAGGCATGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGt < 1:983259/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGt > 1:195923/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGt > 1:632174/1‑150 (MQ=255) cacccacGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGGCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTCcagca < 1:2174874/150‑1 (MQ=255) acccacGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTCcagcag < 2:826502/150‑1 (MQ=255) gacGGC‑CTGCTGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCtt > 1:2099277/2‑81 (MQ=255) gacGGC‑CTGCTGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCtt < 2:2099277/80‑1 (MQ=255) cacGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTc < 1:238558/141‑1 (MQ=255) cacGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTc > 2:238558/1‑141 (MQ=255) gC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTCCAGCAGGCctgct > 1:2227877/1‑150 (MQ=255) | GCCGGCCGTGGTCGGGATGGCGACGATGGGCGGGATGGCATGGGTAAGCGTGAACGACCCTTCGTAGTCCTCGATACGGCCGTCGTGGGTGAGCAGCAGGCTGATGGCCTTGGCCGCATCCATCGCGCTGCCGCCACCCACGGC‑CAGCAGGCCGTCGATACCCGTGCCCCGATAGCGCTGGGCGGTGTGGTTGATGTCGTCACTGCGCGGGTTGGCCTTGATGTCCGCCACTTCCTCGTAGGCGATACCGGCCTTGTCGAGGCTGGCGTAGACGCTGTCCAGCAGGCCTGCT > NC_002947/3195663‑3195954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |