| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 413997 = | 18 (0.510) | 12 (0.430) | 10/216 | 1.8 | 45.0% | intergenic (+14/‑189) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II |
| ? | NC_002947 | 414083 = | 15 (0.540) | intergenic (+100/‑103) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II | |||||
GTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTG > NC_002947/413852‑414144 | gtgtACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTC > 2:331765‑M1/1‑150 (MQ=255) tgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTcgc > 2:10286‑M1/144‑150 (MQ=255) tgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTcgc < 1:565578‑M1/7‑1 (MQ=255) tACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCG > 1:73696‑M1/1‑150 (MQ=255) tACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTCCTACGGCGCGG‑TCATGCTGGTGCTCAACGCCGGGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTcgcg < 1:711572/150‑1 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGG < 2:521683‑M1/150‑1 (MQ=255) tcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatatacaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCgg > 2:47677‑M1/142‑150 (MQ=255) cAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGG > 1:749725‑M1/1‑150 (MQ=255) gccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGc < 1:125070‑M1/11‑1 (MQ=255) cgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCaa > 1:283513‑M1/138‑150 (MQ=255) cGTTCCGCTCGGCCTCCCCCCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGTGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGC < 1:346019‑M1/150‑1 (MQ=255) ccccagctgggcgatttgttcagtattctcatgcttagtccagaaacgctccggcaggcaacaggccgctgtacagcccggcctcccctctttatatgcaggctatgtggcggacactgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGc > 2:404205‑M1/136‑150 (MQ=255) ttCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCC > 1:843907‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCC < 1:180327‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCCTATTCGCGG > 1:378869‑M1/1‑142 (MQ=255) ttCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCCTATTCGCGG < 2:378869‑M1/142‑1 (MQ=255) ccGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGC < 2:521712‑M1/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGACGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCC < 2:685321‑M1/150‑1 (MQ=255) gccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCcaca < 1:440146‑M1/26‑1 (MQ=255) ccTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGAACGCTCCCtcgg < 2:469444‑M1/150‑5 (MQ=255) caatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgg < 2:753099‑M1/28‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTg > 2:861929/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCG < 2:530695‑M1/122‑1 (MQ=255) gCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCG > 1:530695‑M1/1‑122 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcaca > 1:93465‑M1/1‑141 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca < 2:157509/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCt < 2:480611/150‑1 (MQ=255) tGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGTTACCGTGTTGGCTTAGTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGa < 1:787894/150‑1 (MQ=255) tGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGa < 2:73696/150‑1 (MQ=255) gcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGc < 1:275477‑M1/47‑1 (MQ=255) aaGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCTCACAGGTATTGCACAGGCCCTGGGCAgt < 2:362216/150‑1 (MQ=255) ggaggCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctc > 1:708259‑M1/1‑126 (MQ=255) ggaggCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctc < 2:708259‑M1/141‑16 (MQ=255) gaggCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGCTGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGtgtg < 2:361911/150‑1 (MQ=255) gaggCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAgtgtt < 1:815535/150‑2 (MQ=255) gaggCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGtgtg < 1:331765/150‑1 (MQ=255) gggTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcc < 1:47245‑M2/150‑3 (MQ=255) gggTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA < 2:138615‑M1/114‑1 (MQ=255) gggTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA > 1:138615‑M1/1‑114 (MQ=255) gggTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATAACGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctcagggcctgtgcagtacc < 2:93465‑M1/150‑33 (MQ=255) ggTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcct > 2:726650‑M2/1‑147 (MQ=255) tGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgt > 1:861929‑M2/1‑145 (MQ=255) tGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgt > 1:215801‑M2/1‑145 (MQ=255) tGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGCGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgt > 1:375306‑M2/1‑145 (MQ=255) aT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgg > 1:728998‑M2/1‑143 (MQ=255) cggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTgg > 2:368343‑M1/86‑150 (MQ=255) cGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctcagggcctgtgcagtacctgtggga < 2:528574‑M1/150‑40 (MQ=255) aggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacacggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCg > 2:125070‑M1/81‑150 (MQ=255) gCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgg > 2:843907‑M2/1‑137 (MQ=255) gCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgg > 1:743508‑M2/1‑137 (MQ=255) ctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGc > 2:275477‑M1/78‑150 (MQ=255) tacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCACTCCCACAGGGATTGCACAGGCCCTGAGCAgt > 2:322791‑M1/77‑126 (MQ=255) tacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCACTCCCACAGGGATTGCACAGGCCCTGAGCAgt < 1:322791‑M1/50‑1 (MQ=255) gCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCTAGCCCGCT < 2:684265‑M1/96‑1 (MQ=255) gCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCT > 1:684265‑M1/1‑96 (MQ=255) ttGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgggcttgcccgc > 2:47245‑M2/1‑127 (MQ=255) ccGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgggcttgcccgcgaa < 1:421642‑M2/150‑27 (MQ=255) cGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctcagggcctgtgcagtacctgtgggagcgg < 1:544515‑M1/136‑44 (MQ=255) cGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctcagggcctgtgcagtacctgtgggagcgg > 2:544515‑M1/1‑93 (MQ=255) aTGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAg < 1:678334/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgggctt < 2:390862‑M2/135‑18 (MQ=255) aaCGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgggctt > 1:390862‑M2/1‑118 (MQ=255) aaCGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGcc < 2:749725/150‑1 (MQ=255) ccGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCAtgt < 2:421642/150‑1 (MQ=255) cGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGa < 2:399034/100‑1 (MQ=255) cGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGa > 1:399034/1‑100 (MQ=255) tGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgg > 2:717002‑M2/1‑111 (MQ=255) tGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCcctgtgggagcgg < 1:717002‑M2/124‑14 (MQ=255) ctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATcc < 2:233999‑M1/59‑1 (MQ=255) ctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATcc > 1:233999‑M1/54‑112 (MQ=255) ctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtgtg > 1:447474‑M1/54‑117 (MQ=255) ctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtgtg < 2:447474‑M1/64‑1 (MQ=255) atattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtgtg < 1:437747‑M1/64‑1 (MQ=255) atattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtgtg > 2:437747‑M1/43‑106 (MQ=255) gggTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGC < 2:751061‑M1/42‑1 (MQ=255) gggTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGC > 1:751061‑M1/1‑42 (MQ=255) tttAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctcagggcctgtgcagtacctgtggga < 2:599546‑M1/90‑40 (MQ=255) tttAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGgattgcacactgctcagggcctgtgcagtacctgtggga > 1:599546‑M1/1‑51 (MQ=255) gCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTg < 1:795031/102‑1 (MQ=255) gCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTg > 2:795031/1‑102 (MQ=255) cTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCCCAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCCTGCGAGTGGTACACTGTCCGGCACATAGCCTGCATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTg > 1:526772/1‑150 (MQ=38) | GTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGAT‑CGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAGGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTG > NC_002947/413852‑414144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |