| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 276,714 | Δ1 bp | 7.0% | coding (454/1221 nt) | PP_0223 ← | DszC family monooxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 276,714 | 0 | G | . | 7.0% | 178.5 / 7.6 | 57 | coding (454/1221 nt) | PP_0223 | DszC family monooxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/25); new base . (2/2); total (30/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
TCACCTGCAGCCCCTGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCGCAGCACTTCCAGACCGTAGAA > NC_002947/276567‑276861 | tCACCTGCAGCCCCTGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGc > 2:929720/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCCCCTGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGGGTCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCa > 2:416150/1‑150 (MQ=255) cAGCCCCTGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCg > 1:361940/1‑150 (MQ=255) cccTGGCTGTCGGCCGTGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTGACGGCTCAGGCGggtg < 2:569062/150‑1 (MQ=255) cccTGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGCAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGggtg > 2:733536/1‑150 (MQ=255) tGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGgtggtg > 2:649623/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTc > 1:198740/1‑150 (MQ=255) cGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGt < 2:383555/150‑1 (MQ=255) cGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTACCTGTCGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGt < 1:900635/150‑1 (MQ=255) gggACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCg < 2:1009360/150‑1 (MQ=255) aaGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGTGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTg < 2:896226/150‑1 (MQ=255) aGGCCAACTGTTGTATGACTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACg > 1:727338/1‑115 (MQ=255) aGGCCAACTGTTGTATGACTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACg < 2:727338/115‑1 (MQ=255) ggCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGt > 1:837971/1‑150 (MQ=255) aaCTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGccc > 1:849752/1‑150 (MQ=255) ttgtATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTc > 1:213343/1‑150 (MQ=255) ttgtATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTc > 1:732608/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCa > 2:89529/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAgg < 2:213343/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAgg < 1:680193/150‑1 (MQ=255) cATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGc > 2:599622/1‑150 (MQ=255) aTCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTc < 1:699773/135‑1 (MQ=255) aTCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTc > 2:699773/1‑135 (MQ=255) cACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGaa > 1:871836/1‑150 (MQ=255) aCGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCATGGCTCAGGAGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGaaa > 1:614967/1‑150 (MQ=255) cGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAAc < 1:554732/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAAcggc < 2:837971/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAAcggc > 1:1037678/1‑148 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAAcggc < 2:1037678/148‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCAC‑GCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGt < 1:1042197/115‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCAC‑GCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGt < 1:1042169/115‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCAC‑GCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGt > 2:1042197/1‑115 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCAC‑GCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGt > 2:1042169/1‑115 (MQ=255) gAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGCAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAAcggcgg < 1:733536/150‑1 (MQ=255) gAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCa < 2:732608/150‑1 (MQ=255) aGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACa < 2:170564/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCgctgt < 1:617362/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCgctgt < 1:89529/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTGGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCgctgt < 2:843014/150‑1 (MQ=255) tgtgGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCgctgttg < 2:361940/150‑1 (MQ=255) aaTAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGTCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCgctgttgctgtt < 1:416150/150‑1 (MQ=255) aaCTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCgggg > 1:271339/1‑150 (MQ=255) cgcCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCg < 1:599622/150‑1 (MQ=255) gcCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTa < 1:512178/121‑1 (MQ=255) gcCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCGTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTa > 2:512178/1‑121 (MQ=255) ccGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGTGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAg < 1:884735/80‑1 (MQ=255) ccGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGTGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAg > 2:884735/1‑80 (MQ=255) aTGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgc > 2:893350/1‑150 (MQ=255) aTGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgc > 2:330880/1‑150 (MQ=255) ggAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCCTTTCTGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgcagca > 1:347557/1‑150 (MQ=255) gAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCGCAGCAc > 2:798683/1‑150 (MQ=255) cGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgcag > 1:1051868/1‑142 (MQ=255) cGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgcag < 2:1051868/142‑1 (MQ=255) gTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGgcg > 1:88553/1‑108 (MQ=255) gTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGgcg < 2:88553/108‑1 (MQ=255) tCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGGGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCGCAGCACTTCCAGa > 2:908674/1‑150 (MQ=255) cGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgca < 1:627046/135‑1 (MQ=255) cGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCgca > 2:627046/1‑135 (MQ=255) aCGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCGCAGCACTTCCAGACCGTAGaa > 1:675106/1‑150 (MQ=255) | TCACCTGCAGCCCCTGGCTGTCGGCCGGGACGAAGGCCAACTGTTGTATGCCTTGTTCATCCACGACCGAGGTTGGAATGCGCTGGGCATAGATGGCGCCTGTGGAATAGAACTTGCGCCCGTTGATGCGGAAACCGTCGCCGTCACGGCTCAGGCGGGTGGTGCGCTCGTGGGCGGTCTTGGTGCCCAGCTCGGCCAGGGCATTGCCGAAACGGCGGCCGGCCAGCACCTCGGCGTACAGGCGCTGTTGCTGTTCGGGGCTGCCGTTTACCCGCAGCACTTCCAGACCGTAGAA > NC_002947/276567‑276861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |