| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,171,893 | Δ1 bp | 9.2% | coding (465/1836 nt) | glmS ← | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,171,893 | 0 | G | . | 9.2% | 202.9 / 15.1 | 65 | coding (465/1836 nt) | glmS | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/30); new base . (3/3); total (32/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
TCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATG > NC_002947/6171750‑6172042 | tCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGCCGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGCGCTACCCCTGCGTGTTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑gg < 2:303983/150‑1 (MQ=255)tCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑gg > 2:115015/1‑150 (MQ=255)tCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑gg > 1:771946/1‑150 (MQ=255) tAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTACTGCAACCAGGCGATCCAGCTACTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCt > 1:520267/1‑150 (MQ=255) aaCCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCAATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCtt > 1:792043/1‑150 (MQ=255) accgaaCGCAGCGCCAGCTGGTCCGACGCCAGGAAGTCCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGGGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTc < 2:413530/145‑1 (MQ=255) cTGACGCAGCGCCAGCTGTACCGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCC‑TGCACGGCGCttacg < 1:56431/150‑4 (MQ=255) cTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCAc > 2:775502/1‑150 (MQ=255) tGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCAcc > 2:763225/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCAATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCAccgc < 2:792043/150‑1 (MQ=255) aGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCgccgcc < 2:771946/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTaa < 1:1116248/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATCACCAGCGGACTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAg < 1:1098438/150‑1 (MQ=255) tCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCg > 1:962476/1‑150 (MQ=255) cGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAg < 1:321710/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑g > 1:399992/1‑114 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑g < 2:399992/114‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTc > 2:884857/1‑150 (MQ=255) aGTTCTCGCCAAGGCCCAGGACGATAACCAGCGGGTTATCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGaa < 2:336100/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATg > 2:86507/1‑150 (MQ=255) ttCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATg < 1:971519/150‑1 (MQ=255) tcGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGctc > 1:454628/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCa > 1:57938/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCa > 2:771058/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAg > 2:474453/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGgtgt < 2:961874/150‑1 (MQ=255) ggCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt < 2:962476/150‑1 (MQ=255) gCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggtg < 1:267132/150‑1 (MQ=255) ccGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGtggtgg < 1:61034/150‑1 (MQ=255) aCCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAgg < 1:316027/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGt > 2:183447/1‑150 (MQ=255) aCCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGAc < 1:771058/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGTCGGAAGCGCC‑TGCACGGCGCttac < 1:813114/76‑3 (MQ=25) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGTCGGAAGCGCC‑TGCACGGCGCttac > 2:813114/1‑74 (MQ=25) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAgg > 2:1004058/1‑135 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAgg < 1:1004058/135‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg > 1:690874/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCC‑TGCACGGCGCttacg > 2:802210/1‑74 (MQ=38) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCC‑TGCACGGCGCttacg < 1:802210/77‑4 (MQ=38) gTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTAt < 2:26447/150‑1 (MQ=255) gctgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCg < 1:115015/150‑1 (MQ=255) tgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGCGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGt < 1:1061959/150‑1 (MQ=255) ccaccaGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCt < 1:884857/150‑1 (MQ=255) gTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATc > 2:1029310/1‑135 (MQ=255) gTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATc < 1:1029310/135‑1 (MQ=255) gctgctTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGACGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACAt > 1:754176/1‑150 (MQ=255) tGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCa < 2:57938/150‑1 (MQ=255) gCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt < 2:906225/94‑1 (MQ=255) gCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt > 1:906225/1‑94 (MQ=255) cACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGc > 2:751564/1‑150 (MQ=255) tGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCt > 2:1124948/1‑150 (MQ=255) gATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCtt < 2:435418/150‑1 (MQ=255) gATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCtt > 2:463322/1‑150 (MQ=255) aTCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTa > 2:738272/1‑114 (MQ=255) aTCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTa < 1:738272/114‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGc > 1:709738/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAGGCCGTAAGAGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGc > 2:739354/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGct > 1:74234/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGa > 1:1018917/1‑98 (MQ=255) cAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGa < 2:1018917/98‑1 (MQ=255) aGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTcg < 1:474453/150‑1 (MQ=255) gCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt < 1:1061833/77‑1 (MQ=255) gCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggt > 2:1061833/1‑77 (MQ=255) ccGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCgcgc < 2:520267/150‑1 (MQ=255) gtgaaGCGCC‑TGCACGGCGCTTCACCGCCCCCTTACGGGCGTCGGTCAGGTCTGGACTGCTCTTCCGAGTGTGGTGGATCAGGTGGCCGATGCCTTCGGTATCGGTCTGCGACGTGAACACATCGCCCCGGCCCTTCAGCTCTTCgcgcc > 2:424310/4‑149 (MQ=255) gTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATg < 1:739354/150‑1 (MQ=255) | TCAGTAACCTGACGCAGCGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATG > NC_002947/6171750‑6172042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |