Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,109,576:1 | +C | 7.0% | coding (237/651 nt) | PP_0969 → | GntR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,109,576 | 1 | . | C | 7.0% | 217.8 / 10.8 | 57 | coding (237/651 nt) | PP_0969 | GntR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (24/29); new base C (2/2); total (26/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.65e-01 |
GGTCAGCGCCTGCCTACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTACGGGATGCCCTGGAAGGCAGT > NC_002947/1109427‑1109723 | ggtcAGCGCGTGCATACAGAGCAAGCGATTCAACAGCAGCTAGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCg < 2:10513/150‑1 (MQ=255) ggtcAGCGCCTGCCTACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCg < 1:723047/150‑1 (MQ=255) ggtcAGCGCCTGCCTACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCg > 1:406678/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCCTACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCa < 2:470769/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCTACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAAGTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCa > 2:678650/1‑150 (MQ=255) gcctgcctACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAgg < 1:70422/150‑1 (MQ=255) aCCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCAc > 2:415614/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCAGAGCGTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCCACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCGGGTAGACATTCCCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCAcg < 1:559540/150‑1 (MQ=255) aGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGa < 2:1126341/150‑1 (MQ=255) ccAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATg > 2:906407/1‑150 (MQ=255) aagagCTTGCCGTGCAGCTTGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTGTTCGAGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGt < 1:68791/149‑1 (MQ=255) gagCTTGCCTTGCAGCTGGGTATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCGCCTGCAgcgggtc > 2:492198/1‑133 (MQ=255) gagCTTGCCTTGCAGCTGGGTATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCGCCTGCAgcgggtc < 1:492198/139‑7 (MQ=255) gagCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCGCCTGCAgcgggtc < 1:1067992/139‑7 (MQ=255) gagCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCGCCTGCAgcgggtc > 2:1067992/1‑133 (MQ=255) ttgccttgcAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCCGCTACCTGCGCACTGCCCAGGAGCCG‑GGGCTGGCAGTTTACGCGATGTCCCGgt < 2:852496/150‑1 (MQ=255) gccttgcAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGgtgt > 2:187990/1‑150 (MQ=255) gccttgcAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGgtgt > 2:188048/1‑150 (MQ=255) cttgcAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTAc > 2:1075627/1‑150 (MQ=255) cttgcAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTAc < 2:721706/150‑1 (MQ=255) gcAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGcc < 1:678650/150‑1 (MQ=255) ggCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCCTGCCCGTGCTGGCGGTCAGTGGCCGGGTGGAAATTCGCCAGGGCGATGAAGAATTTGAACCCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGGACGCCCGAGCAg > 1:252696/1‑150 (MQ=255) aTCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGcc > 1:780303/1‑150 (MQ=255) tCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGccc < 2:933539/150‑1 (MQ=255) gCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGaaa < 1:415614/150‑1 (MQ=255) aaCACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAAcc < 2:252696/150‑1 (MQ=255) aaCACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCATGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAAcc > 1:251950/1‑150 (MQ=255) cacCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGGTCGGTGGCCGGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACGGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGGGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCg < 2:261501/150‑1 (MQ=255) ccGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGcc < 2:522647/150‑1 (MQ=255) ccGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGcc > 1:522647/1‑150 (MQ=255) ggCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAAGTAGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCAGACATATTCTCGa > 1:808569/1‑150 (MQ=255) cgcgTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGCCGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGACACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAg > 1:75881/1‑150 (MQ=255) gcgTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAgg < 2:780303/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCCGTTACCTGCGCCCTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGNGGc < 2:700515/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTc < 1:1075627/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCg < 2:981683/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGGGGCGGAGGCCGTCgg > 1:873993/1‑150 (MQ=255) ggCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCgg < 1:947371/150‑1 (MQ=255) gTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCt > 1:195675/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGCAATTAGACAGGGCGACGGCGGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTg > 2:243649/1‑150 (MQ=255) gtggAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAg < 1:697174/90‑1 (MQ=255) gtggAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAg > 2:697174/1‑90 (MQ=255) aaaTTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGAGGTATCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTa > 1:840585/1‑150 (MQ=255) aaTTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTAc < 1:887608/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCg > 2:139317/1‑150 (MQ=255) gCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAAGCCGCCGGGCTGGCGGCCTTACGCCGTACCGATg > 2:128660/1‑150 (MQ=255) ggCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGAc < 2:251950/150‑1 (MQ=255) cgatgccAGCTACCTGCCCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGCCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCt < 2:840585/144‑1 (MQ=255) gCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAg < 1:906407/150‑1 (MQ=255) aGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAgcg > 2:249999/1‑150 (MQ=255) tACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTa > 1:666655/1‑150 (MQ=255) aCCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTAc < 1:188048/150‑1 (MQ=255) aCCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTAc < 1:187990/150‑1 (MQ=255) aCCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTAc < 1:139317/150‑1 (MQ=255) cTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATACCGACCTGCAAGCGCTACgg < 2:195675/150‑1 (MQ=255) ccAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCa < 1:528127/51‑1 (MQ=255) ccAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCa > 2:528127/1‑51 (MQ=255) aCCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTACGGGATGCCCTGGAAGGCa < 1:364108/150‑1 (MQ=255) ccG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCCGGGCAGTCTCACGCCCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTACGGGATGCCCTGGAAGGCAGt > 2:830957/1‑150 (MQ=255) ccG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTACGGGATGCCCTGGAAGGCAGt > 1:914010/1‑150 (MQ=255) | GGTCAGCGCCTGCCTACCGAGCCAGAGCTTGCCTTGCAGCTGGGCATCAGCCGCAACACCGTGCGTGAGGCCATGCGCGTGCTGGCGTTCAGTGGCCTGGTGGAAATTCGCCAGGGCGACGGCAGCTACCTGCGCACTGCCCAGGACCCG‑CTGCAGGCGGTGCACGCGATGTCCCGGTGTACGCCCGAGCAGGCCCGTGAAACCCGCCATATTCTCGAGGCGGAGGCCGTCGGGCTGGCGGCCTTGCGCCGTACCGATGCCGACCTGCAAGCGCTACGGGATGCCCTGGAAGGCAGT > NC_002947/1109427‑1109723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |