| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 5,610,732 | +CTGCTG | 93.7% | coding (96/333 nt) | emrE → | small multidrug resistance protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5610732 | 3 (0.070) | 51 (1.240) +CTGCTG |
46/224 | NT | 93.7% | coding (96/333 nt) | emrE | small multidrug resistance protein |
| ? | NC_002947 | 5610733 = | 4 (0.090) | coding (97/333 nt) | emrE | small multidrug resistance protein | |||||
CCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5610588‑5610732‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGGGCAGAA > NC_002947/5610733‑5610881 |||||| CCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCT > 1:424736/1‑150 ATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGC > 2:464393/1‑150 TCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGG < 2:424736/150‑1 TAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGTTGATGGTG > 1:187311/1‑150 TAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTG > 1:77006/1‑150 ATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTG < 2:337786/150‑1 AGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCAT > 2:7249/1‑150 GTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATT < 2:77006/150‑1 GGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTT < 1:269976/150‑1 AGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGATGCCGTTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCT < 1:88782/150‑1 TCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCA‑‑‑CTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCT > 2:282749/1‑150 atcAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCGGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACG > 1:651396/4‑150 ATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGA > 1:162944/1‑112 ATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGA < 2:162944/112‑1 TGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGC > 1:359767/1‑150 GCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCA‑‑‑CTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTC > 2:134974/1‑150 CCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGG > 2:18917/1‑150 CTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGT > 2:1028466/1‑150 CTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGCTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGg > 2:689539/1‑149 CCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCA < 2:654283/150‑1 ACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCA > 2:892019/1‑150 CTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTG < 1:455446/138‑1 CTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTG > 2:455446/1‑138 GCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCG > 1:320647/1‑150 CATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGCTGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCAGTCCGGg > 2:64267/1‑149 TTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGG > 1:864299/1‑150 CATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGAT > 2:364478/1‑150 ATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATT > 2:499867/1‑150 CTGCGCCGAAGTCATCGCCCCCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGGGCACGTCGGGACCACTCCTTCTTCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGC < 1:131012/150‑1 TGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGGAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCC > 1:677252/1‑150 GTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATC < 1:1028466/150‑1 ATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGG > 1:628458/1‑150 CCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGG > 2:975111/1‑150 CGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTCC‑‑‑TGGTGGATGGCTATGGCATTGCGGTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGG > 1:412136/1‑150 GCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTG > 1:76675/1‑150 GCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTG < 1:132265/150‑1 CCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGG < 1:592279/150‑1 CTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCGGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGG > 2:15801/1‑150 AGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTNTGC < 2:698752/150‑1 AGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGC > 1:656610/1‑150 AGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGAAGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGC < 1:1081137/150‑1 GGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCT < 1:464393/150‑1 CGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGA < 1:64267/150‑1 CGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGA < 1:334943/150‑1 GGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTT < 1:955372/52‑1 GGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTT > 2:955372/1‑52 GAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCA‑‑‑CTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGT < 2:412136/150‑1 AGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGTTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGT < 2:187311/150‑1 AGGCCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGT < 1:499867/150‑1 CCTGAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGC > 2:1055/1‑150 GAGCACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGC < 2:359767/150‑1 ACGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGAGCTG > 1:1078800/1‑150 CGCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGG < 1:7249/150‑1 GCCGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGGGTTCTGGATGCTGACGCTGGTAGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGT > 2:571445/1‑150 CGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGA < 1:15801/150‑1 CGTTGCCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGA < 2:882617/150‑1 CCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTAT < 2:628458/150‑1 CCACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTAT < 1:571445/150‑1 CACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATG < 1:756426/150‑1 ACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTTGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGG < 1:277209/150‑1 ACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGG > 1:144611/1‑150 ACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGG < 2:780848/150‑1 ACTGCTGCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGG > 2:1048264/1‑150 GCTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAACATTCCGGAGGGCTTTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGGGCAGAA < 1:134974/150‑1 |||||| CCATCCAGGCAACGTCTAGAATGCCCGCTCAGTAACGGAGGATCCTGCCATGAATGCCTATACCTACCTCGCCATTGCCATCTGCGCCGAAGTCATCGCCACCGCCTCGATGAAGGCGGTGAAAGGCCTGAGCACGCCGTTGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5610588‑5610732‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGCTGCTGATGGTGGTTGGCTATGGCATTGCGTTCTGGATGCTGACGCTGGTGGTCCGCAGCATTCCGGTGGGGATTGCCTACGCCATCTGGTCGGGGCTGGGGATTGTGCTGATCAGTGTGGCGGCGCTGGTGATCTATGGGCAGAA > NC_002947/5610733‑5610881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |