New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1359309 = | 51 (1.180) | 4 (0.100) | 4/240 | NT | 7.5% | coding (709/798 nt) | PP_1184 | dienelactone hydrolase family protein |
? | NC_002947 | 1359350 = | 50 (1.220) | coding (668/798 nt) | PP_1184 | dienelactone hydrolase family protein |
CAGGCGCTAAGGGAGGTGGCGTGGTAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTGACCATGCTGTCCG > NC_002947/1359161‑1359452 | aacctggcgtggtgcgggccgatatcctggtcgagcatggtgcggcggacagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtattgaaggggccaagcacggGt > 2:354455‑M1/149‑150 (MQ=255) ctggcgtggtgcgggccgatatcctggtcgagcatggtgcggcggacagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtattgaaggggccaagcacggGTTCa > 2:574981‑M1/146‑150 (MQ=255) ctggcgtggtgcgggccgatatcctggtcgagcatggtgcggcggacagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtatcgacggggccaaggagggGTTCa < 2:508491‑M1/5‑1 (MQ=255) gTGGCGTGGTAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGc < 1:437496/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTGGTAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGc > 1:80054/1‑150 (MQ=255) tGGTAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCg < 2:956637/150‑1 (MQ=255) ggTAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCgg > 2:880981/1‑150 (MQ=255) tAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCa > 1:268400/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCTAAACACTCTCGTCCGCTGCCATCTTATAGACAATGTCCAGCTCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCgg > 1:625210/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCgg > 2:170869/1‑150 (MQ=255) tcgagcatggtgcggcggacagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtattgaaggggccaagcacggGTTCACCGTGGCTCCGCCGATCGGCATCgggg < 1:70214‑M1/32‑1 (MQ=255) ctTTCCCACAACGATCGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCGGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCGTGTTATAGTCAATGTCCGGCCCCCCATTTTCACCGTGGCTCAGCCGTTCGGCATCGGGGTTg < 1:221400/150‑1 (MQ=255) gtgcggcggacagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtattgaaggggccaagcacggGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAAc > 2:70214‑M1/110‑150 (MQ=255) cacaACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAAc < 2:178559/150‑1 (MQ=255) aTTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCt > 1:305142/1‑150 (MQ=255) gCAGAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCTCCCCATGTTCAACTTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTgg < 1:635489/150‑1 (MQ=255) cagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtattgaaggggccaagcacggGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAAccc < 1:409868‑M1/43‑1 (MQ=255) cagcatggtcaccccacagcaggtggaggcatttaaggccgagatggatgcggccaaggtcaactaccagttcgtcagtattgaaggggccaagcacggGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAAccc > 2:409868‑M1/100‑142 (MQ=255) tttATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCaa < 2:625210/150‑1 (MQ=255) tATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATa < 2:80054/150‑1 (MQ=255) tGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGa < 2:956829/150‑1 (MQ=255) cacCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCCATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGaa < 2:186196/150‑1 (MQ=255) cacCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCtt > 1:1106617/1‑129 (MQ=255) cacCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCtt < 2:1106617/129‑1 (MQ=255) cttcttGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTgg > 2:831560/1‑88 (MQ=255) cttcttGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTgg < 1:831560/88‑1 (MQ=255) cttcttGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGc < 1:568605/124‑1 (MQ=255) cttcttGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGc > 2:568605/1‑124 (MQ=255) ttGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAg < 1:880981/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCACTACTGACGAACTGGTAGtt > 2:1099614/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGtt > 2:725834/1‑150 (MQ=255) gaagaaCGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCAGTGCTTGGCCCCTCCAATACTGACCAACTGGTCGtt > 2:177126/1‑150 (MQ=255) agaaCGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGACTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGa < 1:14467/150‑1 (MQ=255) ccTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTgg < 1:443566/150‑1 (MQ=255) cTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGc > 1:792245/1‑150 (MQ=255) gCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCg > 1:405911/1‑150 (MQ=255) cccAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCAtct < 2:268400/150‑1 (MQ=255) ccAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCAtctc > 2:952548/1‑150 (MQ=255) aaCGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGTGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCAtct < 2:1057669/144‑1 (MQ=255) aaCGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCAtct > 1:1057669/1‑144 (MQ=255) cTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGca < 2:792516/125‑1 (MQ=255) cTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGca > 1:792516/1‑125 (MQ=255) gCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCAcc > 2:878718/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACct > 1:508491/1‑150 (MQ=255) taGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTggg < 1:1059633/150‑1 (MQ=255) taGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTggg < 1:878718/150‑1 (MQ=255) taGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTggg < 1:725834/150‑1 (MQ=255) aGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTgggg > 2:672411/1‑150 (MQ=255) ccAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGa > 2:17792/1‑100 (MQ=255) ccAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGa < 1:17792/100‑1 (MQ=255) ccAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTg > 1:482143/1‑150 (MQ=255) aaTGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGCACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGCTGAc > 1:455061/1‑150 (MQ=255) aaTGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCtt < 2:537125/123‑1 (MQ=255) aaTGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCtt > 1:537125/1‑123 (MQ=255) gTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTGACCAt < 2:305142/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCTAATGTTCATCGTTGTGCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTGACCATGCt < 2:476277/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTGACCATGCt < 1:952548/150‑1 (MQ=255) ccccATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTGACCATGCTGTccg > 1:294572/1‑150 (MQ=255) cccATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCaa < 2:406977/65‑1 (MQ=255) cccATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCaa > 1:406977/1‑65 (MQ=255) aTGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGa < 1:679523/83‑1 (MQ=255) aTGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGa > 2:679523/1‑83 (MQ=255) | CAGGCGCTAAGGGAGGTGGCGTGGTAACGCCTCCTTTCCCACAACGATTGCACAATCTTTTATTTGAACACCTTCTTGAAGAACGCCTGCATATCTGCCCAGGAACGCTCGTCCGCTGCCTTGTTATAGCCAATGTCCGGCCCCCCATGTTCACCGTGGCTCAGCCGATCGGCATCGGGGTTGGTGAACCCGTGCTTGGCCCCTTCAATACTGACGAACTGGTAGTTGACCTTGGCCGCATCCATCTCGGCCTTAAATGCCTCCACCTGCTGTGGGGTGACCATGCTGTCCG > NC_002947/1359161‑1359452 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |