New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4848823 | 52 (1.200) | 6 (0.140) | 6/244 | NT | 10.7% | coding (78/1383 nt) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4848848 | 50 (1.200) | coding (103/1383 nt) | hemN | oxygen‑independent coproporphyrinogen III dehydrogenase |
CAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCAT > NC_002947/4848675‑4848972 | cAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCaa < 1:258694/150‑1 (MQ=255) aaaTCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAAc > 2:441955/1‑150 (MQ=255) aTCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAAccg > 1:482470/1‑150 (MQ=255) tCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAAccgc > 1:172178/1‑150 (MQ=255) aaCACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAAccgccg > 1:418358/1‑150 (MQ=255) tttCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCCAcctcgctgtgcag > 1:994634‑M1/1‑137 (MQ=255) tACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGcacc > 2:730030/1‑149 (MQ=255) aCGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAg < 2:401252/150‑1 (MQ=255) gCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtg < 1:85943‑M2/150‑3 (MQ=255) ccATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTGCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGACCTCTCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgg > 1:198440‑M2/1‑147 (MQ=255) cATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtggg < 2:706225‑M2/150‑5 (MQ=255) cATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtggg < 2:276946‑M2/150‑5 (MQ=255) tAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTACCCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggt < 2:994634‑M1/150‑31 (MQ=255) aCTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaaga > 2:136881‑M1/1‑116 (MQ=255) cTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagag < 1:136881‑M1/150‑36 (MQ=255) tCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGgttcgttc < 2:418358/150‑1 (MQ=255) ggTGCACTTCTGCTCTTTCCGTTTACTACCCTCATGCTCTACGACCTCCTTTGGGATACCTACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCTGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCTCCGTGCAACTGCACAGCGAGTTGGTTTCGTTCGAc < 2:785212/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc < 2:611175/150‑1 (MQ=255) tgctgcTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCa > 1:313670/1‑150 (MQ=255) ctctTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGcaca < 2:963918/118‑1 (MQ=255) ctctTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGcaca > 1:963918/1‑118 (MQ=255) tttCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgg > 1:490981‑M1/1‑96 (MQ=255) tttCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgg < 2:490981‑M1/124‑29 (MQ=255) tttCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTg > 1:451226/1‑150 (MQ=255) ggggACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCga < 2:818233/150‑1 (MQ=255) ggACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCgaga < 1:320802/150‑1 (MQ=255) aCCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGa < 2:482470/150‑1 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACg < 1:706225/150‑1 (MQ=255) ccTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACg < 2:172178/150‑1 (MQ=255) cTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACgg > 1:327573/1‑150 (MQ=255) tCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCTACggg > 2:205738/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGcc > 2:287828/1‑150 (MQ=255) gCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGt > 1:665616/1‑150 (MQ=255) gCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGt < 1:276946/150‑1 (MQ=255) gacgacCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTC‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTgcgc < 1:802327/150‑1 (MQ=255) ccTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCTACGGGCCGTGCGCCcgct < 1:205738/150‑1 (MQ=255) cTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctg > 2:550235/1‑150 (MQ=255) gTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctgtcgc > 1:863693/1‑150 (MQ=255) ggATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTa > 2:481770/1‑150 (MQ=255) aTACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCGACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc < 1:376368/99‑1 (MQ=255) aTACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACg > 1:722779/1‑150 (MQ=255) aTACCGACCTGATCAGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGc > 2:376368/1‑99 (MQ=255) tACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGt < 2:247759/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGt > 2:742086/1‑150 (MQ=255) ccgccgCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGtt > 1:1098531/1‑150 (MQ=255) ccgcTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTg < 2:85943/150‑1 (MQ=255) ctactaTCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgcgc > 2:469379/1‑150 (MQ=255) cTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCATTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCACTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgcgc > 2:1119396/1‑150 (MQ=255) tACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctgtcgctg < 1:744118/126‑1 (MQ=255) tACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCcgctgtcgctg > 2:744118/1‑126 (MQ=255) tcGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCt > 1:612984/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGc < 2:327573/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGc < 1:550235/150‑1 (MQ=255) gggCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGGCCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGctac < 2:313670/150‑1 (MQ=255) gggCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGctac < 2:715124/150‑1 (MQ=255) ccACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCtactac < 2:612984/150‑1 (MQ=255) cACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTactact > 2:1975/1‑150 (MQ=255) aCGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTg > 2:682414/1‑150 (MQ=255) gCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTgcg > 1:905503/1‑150 (MQ=255) gCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTgcg > 1:702658/1‑150 (MQ=255) cTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGcc < 1:443605/67‑1 (MQ=255) cTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGcc > 2:443605/1‑67 (MQ=255) ctctTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggag < 1:136881‑M2/150‑116 (MQ=255) ctctTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGcaa > 1:882183/1‑150 (MQ=255) tctTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagt > 2:136881‑M2/1‑34 (MQ=255) tctTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgc > 2:547883/1‑120 (MQ=255) tctTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTgc < 1:547883/120‑1 (MQ=255) tA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAg < 1:742086/150‑1 (MQ=255) a‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtggggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtcta < 2:994634‑M2/150‑121 (MQ=255) a‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAgg > 2:467540/1‑150 (MQ=255) cccAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatg < 2:706225‑M1/150‑147 (MQ=255) cccAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatg < 2:276946‑M1/150‑147 (MQ=255) ccAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggagaggtcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggcaagagcagcagtgcaccggagtctatgg > 1:198440‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaa < 2:490981‑M2/124‑97 (MQ=255) ccAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGtgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaa > 1:490981‑M2/1‑28 (MQ=255) cAcctcgctgtgcagttgcacggcggttgggtaagaggtgtagcgtggcccggcgagatcgtagcggcggatcaggtcggtatcccaacggaggtcgtcgagcatgagggtagtccccggaaagagcagcagtgcaccggagtctatggc < 1:85943‑M1/150‑149 (MQ=255) aaCCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGtcat > 1:745323/1‑150 (MQ=255) | CAAATCAACACAGTTTCCTACAGACGGCCATAGACTCCGGTGCACTGCTGCTCTTTCCGGGGACTACCCTCATGCTCGACGACCTCCGTTGGGATACCGACCTGATCCGCCGCTACGATCTCGCCGGGCCACGCTACACCTCTTA‑CCCAACCGCCGTGCAACTGCACAGCGAGGTGGGTTCGTTCGACCTGCTCAACGCCCTGCGCGAGAGCCGACGGGCCGTGCGCCCGCTGTCGCTGTACGTGCATGTGCCGTTCTGCGCCAACATCTGCTACTACTGCGCCTGCAACAAGGTCAT > NC_002947/4848675‑4848972 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |