New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5321962 | 42 (0.970) | 3 (0.070) | 3/236 | NT | 6.5% | coding (1338/2322 nt) | mrcB | transglycosylase/transpeptidase |
? | NC_002947 | = 5322044 | 47 (1.170) | coding (1256/2322 nt) | mrcB | transglycosylase/transpeptidase |
GAAAATGGCTCGTCCTGCACCCAACTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCT > NC_002947/5321816‑5322111 | gAAAATGGCTCGTCCTGCACCCAACTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTa > 1:4200/1‑150 (MQ=255) gCTCGTCCTGCACCCAACTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCa < 1:632858/150‑1 (MQ=255) gTCCTGCACCCAACTGGTCAGGGTGAAGTCGGTCTGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAgcgc < 2:985658/150‑1 (MQ=255) cTGCACCCAACTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTg > 2:1080782/1‑150 (MQ=255) gCACCCAACTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTa < 1:621205/150‑1 (MQ=255) aCTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCAcc > 1:568889/1‑150 (MQ=255) aCTGGTCAGGGTGTACCTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCAcc < 2:227147/150‑1 (MQ=255) tCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTAc < 2:390879/123‑1 (MQ=255) tCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTAc > 1:390879/1‑123 (MQ=255) aGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCa < 2:4200/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTc > 1:807979/1‑150 (MQ=255) gtggtCGGCTGCTCCAGCGCAGGCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTc < 2:225248/146‑1 (MQ=255) gCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCAc > 1:125068/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCAc > 2:66625/1‑150 (MQ=255) ctCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATcgc > 2:479731/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATcgcc > 1:855615/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCCGCGAAAGCGCTCCACCGGGCTCAGGGTTGGTCACGACCATcgccgc > 2:1112618/1‑150 (MQ=255) gcgcAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCtt > 2:781622/1‑150 (MQ=255) cAGTCAGGTATACCGACGACTTGACCTGCCAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGCAGTGGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCca < 1:515864/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGGACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCcaca > 1:694152/1‑150 (MQ=255) tCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCa > 2:588974/1‑119 (MQ=255) tCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCa < 1:588974/119‑1 (MQ=255) ttataCCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTc < 1:279514/149‑1 (MQ=255) gTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGGAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTc > 1:772491/1‑150 (MQ=255) gTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacag > 1:97861‑M1/1‑82 (MQ=255) cGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAg < 1:635839/110‑1 (MQ=255) cGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAg > 2:635839/1‑110 (MQ=255) gACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGccccc < 2:855615/150‑1 (MQ=255) gACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGacccc > 2:396308/1‑150 (MQ=255) gACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCc < 1:557652‑M2/150‑2 (MQ=255) gACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCc > 1:1127114‑M2/1‑149 (MQ=255) cAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCccgc < 1:47077‑M2/150‑5 (MQ=255) aaCGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCccgcc < 2:706102‑M2/150‑6 (MQ=255) aCGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCccgcca < 2:1072661‑M2/150‑7 (MQ=255) gCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggca < 2:97861‑M1/150‑93 (MQ=255) ccGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcag < 2:953945‑M1/150‑94 (MQ=255) ccGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGgcgc < 1:479731/150‑1 (MQ=255) ggCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAg < 2:568889/150‑1 (MQ=255) caGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCg > 1:359239/1‑124 (MQ=255) caGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCg < 2:359239/124‑1 (MQ=255) cATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCa < 2:807979/150‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCNCAt < 2:694152/150‑1 (MQ=255) gATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCc < 1:973278‑M2/120‑2 (MQ=255) gATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCc > 2:973278‑M2/1‑119 (MQ=255) gATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGa < 1:1072661/150‑1 (MQ=255) aTGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAg < 2:553625/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTc > 1:164379/1‑150 (MQ=255) ggTTGAAGCTGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCgg < 1:501178/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGc < 1:66625/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCTGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAgg > 2:1041678/1‑125 (MQ=255) gAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCTGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAgg < 1:1041678/125‑1 (MQ=255) ccGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATc > 1:15929/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTg < 1:706102/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCa < 2:164379/150‑1 (MQ=255) ctgcctgGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcgg < 2:953945‑M2/150‑58 (MQ=255) tgcctgGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcggc < 2:97861‑M2/150‑59 (MQ=255) tgcctgGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAgg > 2:901658/1‑150 (MQ=255) ctgGCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcg < 2:394900‑M1/85‑79 (MQ=255) ctgGCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcg > 1:394900‑M1/1‑7 (MQ=255) tgGCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcggctcgt < 2:1072661‑M1/150‑145 (MQ=255) ggCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcggctcgtt < 2:706102‑M1/150‑146 (MQ=255) gcggcTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAgg < 1:622192/144‑1 (MQ=255) gcggcTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAgg > 2:622192/1‑144 (MQ=255) gaggcAACAGATCAGCGCCTGTACCTGAACGGGCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCGTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGaa < 1:1080782/148‑1 (MQ=255) gCGGgccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcggctcgttg < 1:47077‑M1/150‑147 (MQ=255) cggcTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAg < 1:237513/150‑1 (MQ=255) ggcTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAg > 1:917451/1‑116 (MQ=255) ggcTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAg < 2:917451/116‑1 (MQ=255) ggcTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGcc > 2:550551/1‑125 (MQ=255) ggccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcggctcgttggtc < 1:557652‑M1/150‑150 (MQ=255) ggccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatcgatgctgtgcggccgatcggctcgttggtc > 1:1127114‑M1/1‑1 (MQ=255) ggccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatc < 1:973278‑M1/120‑120 (MQ=255) ggccgcaagggggcagacgatgtggaagcggcgatggtcgtgaccaaccctgagaccggtgaagtacaggcgctgatcggtagccgccaggcaggcttcgccggcttcaaccgggccatc > 2:973278‑M1/1‑1 (MQ=255) | GAAAATGGCTCGTCCTGCACCCAACTGGTCAGGGTGTACTTGCTCGGCTGCTCCAGCGCAGTCAGGTATACCGACGGCTTGACCAACGAGCCGATCGGCCGCACAGCATCGATGGCCCGGTTGAAGCCGGCGAAGCCTGCCTGGCGGCTACCGATCAGCGCCTGTACTTCACCGGTCTCAGGGTTGGTCACGACCATCGCCGCTTCCACATCGTCTGCCCCCTTGCGGCCCGCCAGGCGCTTGAAGGTCTCGCTCATCGAGGTTTCGGCCTTCATCTGCAGGATAGGGTCGAAGCT > NC_002947/5321816‑5322111 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |