New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 170160 = | 46 (1.060) | 4 (0.100) | 4/246 | NT | 9.8% | coding (562/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
? | NC_002947 | 170220 = | 29 (0.690) | coding (622/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
GACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCATT > NC_002947/170072‑170366 | tacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGACATGCTG‑‑‑‑CCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCa > 1:464574‑M1/89‑150 (MQ=255) ccGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCtt < 2:611120/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGCTATTCTGATCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 2:820581/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGTGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:819674/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:852920/150‑1 (MQ=255) gTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGAGACTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGc < 1:901001/150‑1 (MQ=255) agaagGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGt < 2:839715/150‑1 (MQ=255) aGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAgg < 2:146589/150‑1 (MQ=255) tgggtgTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAAGCgg > 1:439257/1‑149 (MQ=255) ggtgTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACCGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATg < 2:772412/150‑1 (MQ=255) ccTTACCGATATTCTGACCGGGTTGCATTCCGCGGCCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGCCAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATTAACTACCt > 2:388932/2‑150 (MQ=255) aCCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGAGCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGAcc < 1:820515/150‑1 (MQ=255) cGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCAc > 2:979722/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCt > 1:573260/1‑150 (MQ=255) cGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcc < 2:980610/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGTATTCCACGGACGCCATGCTTGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcc > 2:346775/1‑150 (MQ=255) tATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACg > 2:903066/1‑132 (MQ=255) tATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACg < 1:903066/132‑1 (MQ=255) aTTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGc > 1:329284/1‑150 (MQ=255) ttCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg > 2:93312/1‑71 (MQ=255) ttCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg < 1:93312/71‑1 (MQ=255) ccGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTATGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg < 1:201849/150‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTggg > 2:379746/1‑150 (MQ=255) tgccatgtcgacatgctggccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagcatgtcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTa > 1:464574‑M2/63‑150 (MQ=255) GTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAAt > 1:979722‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgacatgctggccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagccagcatggcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCt > 2:441918‑M2/60‑91 (MQ=255) tcgacatgctggccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagccagcatggcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCt < 1:441918‑M2/32‑1 (MQ=255) gacatgctggccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagccagcatggcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATgcg > 2:944378‑M2/58‑150 (MQ=255) GCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCCGGCTGTGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATgcg < 1:243095‑M1/150‑1 (MQ=255) cATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCa < 1:574568/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATg > 1:805226/1‑45 (MQ=255) cTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATg < 2:805226/45‑1 (MQ=255) cTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTc > 1:298520/1‑150 (MQ=255) aTCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTAcc > 1:529753/1‑150 (MQ=255) ggATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGa > 2:707151/1‑150 (MQ=255) cAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACttt < 2:1055192/150‑1 (MQ=255) gACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTAGAAGAGCAGGTGGCCAGTCTGCCGAACCAGCCAATGAACTACCTGACCACGGGCGCCCCTCCCCGTCGGCTGGGCAATGCCCACCCTGACATCGTCGCTTACCAGGACTTTcc > 2:239169/1‑150 (MQ=255) aGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGCTCGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATCAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACAAGGACTTTCCGAc > 1:1018366/1‑150 (MQ=255) gggTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACgg > 2:50549/1‑150 (MQ=255) gCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATg > 1:339444/1‑150 (MQ=255) cgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCAt < 1:707151‑M2/146‑1 (MQ=255) gacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCAtt < 1:944378‑M2/147‑1 (MQ=255) | GACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCATT > NC_002947/170072‑170366 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |