New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1320348 | 38 (0.880) | 3 (0.070) | 3/242 | NT | 7.3% | coding (2389/2586 nt) | PP_1154 | sensory box protein |
? | NC_002947 | = 1320381 | 40 (0.970) | coding (2356/2586 nt) | PP_1154 | sensory box protein |
CCTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATGCGCC > NC_002947/1320236‑1320528 | ccTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcagg < 1:771900‑M2/150‑5 (MQ=255) ttGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggcc < 2:887592‑M2/150‑7 (MQ=255) ttCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGATTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGTCCCATCGCCTCGCCCAGGTGGTTGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtgtt > 2:503743/1‑148 (MQ=255) aGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCt < 2:547555/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGta < 1:927689/150‑2 (MQ=255) cTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGAt > 2:347558/1‑150 (MQ=255) ccAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGa < 2:998042/150‑1 (MQ=255) aGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATg > 2:950397/1‑150 (MQ=255) gATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACgggg > 2:868364/1‑149 (MQ=255) gATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTAGCCAAGGGTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggt > 1:307550/1‑150 (MQ=255) aTGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggta > 1:59658/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTCGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggtag < 1:347558/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCGGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGggtag < 1:338754/150‑1 (MQ=255) gTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACg < 1:797959/144‑1 (MQ=255) gTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACg > 2:797959/1‑144 (MQ=255) ttCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATg > 1:675336/1‑133 (MQ=255) ttCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATg < 2:675336/133‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGt > 2:906028/1‑136 (MQ=255) tCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGt < 1:906028/136‑1 (MQ=255) aCGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCGGCTAGTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGTACGGGGTGGTACGCAGGTAg > 1:20445/1‑150 (MQ=255) ttCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCaa > 1:491752/1‑150 (MQ=255) tgtcactgtcaGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtg < 2:666554/88‑1 (MQ=255) tgtcactgtcaGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCtg > 1:666554/1‑88 (MQ=255) cactgtcaGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGTCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATa > 2:1411/1‑150 (MQ=255) gCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGCAGGCGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGc > 1:560254/1‑150 (MQ=255) ccccATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAGCGACGAATAGCCGGTGcc > 1:90557/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGaaa > 1:58190/1‑150 (MQ=255) cctcgccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGccc < 2:621044/122‑1 (MQ=255) cctcgccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGccc > 1:621044/1‑122 (MQ=255) cctcgccCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAgtcat < 2:491752/150‑1 (MQ=255) gTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAg > 1:206402/1‑150 (MQ=255) tgatgGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCa > 1:990325/1‑150 (MQ=255) tgGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCCTGTTCAGGCGCAccc > 1:953855/1‑150 (MQ=255) cTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggccatcatcaacctgggcgaggcgatggggctgacagtga < 1:536765‑M2/79‑44 (MQ=255) cTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggccatcatcaacctgggcgaggcgatggggctgacagtga > 2:536765‑M2/1‑36 (MQ=255) cTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAg > 1:347979/1‑150 (MQ=255) ggACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTcaggccatcatcaacctgggcgaggcgatggggctgacagtcagcgtgaaaagagtggaaagcgaacatcaactcaagtcgctggaaaaggaccgctgccatgaagtgcaaggcta < 1:569827‑M2/150‑117 (MQ=255) aCCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGTAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTg < 2:554455/69‑1 (MQ=255) aCCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTg > 1:554455/1‑69 (MQ=255) ccACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCt > 1:139460/1‑150 (MQ=255) cgGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGAc < 1:887592/150‑1 (MQ=255) ggTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACa < 2:139460/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCATCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATg < 2:59658/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATg < 2:347979/150‑1 (MQ=255) ccgccgTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTg > 1:820116/1‑150 (MQ=255) cgccgTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGc < 1:548333/150‑1 (MQ=255) gccgTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGcc < 2:58190/150‑1 (MQ=255) ttgttgttCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAAt < 2:820116/150‑1 (MQ=255) ttgntCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATgcg > 2:700703/1‑150 (MQ=255) tgttCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATgcgc > 2:885481/1‑150 (MQ=255) gttCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACCGGAAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGCAACCATACATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATGCGcc > 1:757828/1‑150 (MQ=255) | CCTTGCACTTCATGGCAGCGGTCCTTTTCCAGCGACTTGAGTTGATGTTCGCTTTCCACGCCTTCGGCTGTCACTGTCAGCCCCATCGCCTCGCCCAGGTTGATGATGGCCTGGACCACAGCGCGGTCGCTGCCGCCGTTGTTGTTCAGGCCGCTGATGAAGCGCTTGTCGATCTTGATGCTGTCGAACGGGTAGGTACGCAGGTAGCCCAACGACGAATAGCCGGTGCCGAAATCATCCATGTTCAGGCGCACCCCTAGCTCCTTGAGCGACAGCATGGTGCCTAATGCGCC > NC_002947/1320236‑1320528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |