New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3127833 | 46 (1.060) | 3 (0.070) | 3/242 | NT | 7.1% | coding (627/897 nt) | PP_2745 | universal stress protein family protein |
? | NC_002947 | = 3127877 | 35 (0.850) | coding (583/897 nt) | PP_2745 | universal stress protein family protein |
CACCAGGTGCAGGTGATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGACCAGTATGCGCGCTGGCAGCGTCGTTTCAGC > NC_002947/3127728‑3128024 | cACCAGGTGCAGGTGATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTa < 1:671969/150‑1 (MQ=255) aCCAGGTGCAGGTGATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAg > 2:892346‑M2/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCAGGTGATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAgg < 2:259500‑M2/150‑3 (MQ=255) tgcaggtgATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTC‑AGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAggc > 2:1057304‑M2/1‑142 (MQ=255) tgcaggtgATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTC‑AGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAggc < 1:1057304‑M2/145‑4 (MQ=255) tGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAg > 1:752153/1‑150 (MQ=255) gCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGtt > 1:521448/1‑150 (MQ=255) gATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTgagc < 1:214596/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCg < 2:752153/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGtt < 1:259500/150‑1 (MQ=255) tCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCa > 2:1063042/1‑150 (MQ=255) cATGCGCTCCCCACCACGCCCGGACACTTCGTCAGCAAGTGCGTCTGGCGAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAATGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGc > 2:852789/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑Cg > 1:973881/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑Cg > 2:1023814/1‑150 (MQ=255) ccGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCg > 1:478808/1‑150 (MQ=255) ggACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGtt < 1:114715/150‑1 (MQ=255) ggACATTTCCTCGGCCAGTTTCTCAGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCATCGAAGCTTGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGtt < 2:564200/150‑1 (MQ=255) ttCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCtt < 2:478808/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCTGCAGATGCAGTTGCGACCTGCCGCGTTTTTCCAGTT‑‑CCTGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTc > 1:805644/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGAt < 2:422108/132‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGAt > 1:422108/1‑132 (MQ=255) tCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCg > 2:528072/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGAt > 2:834591/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATc > 2:18108/1‑150 (MQ=255) cAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAg > 1:881717/1‑150 (MQ=255) gtctgtcCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGTGCCTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTc < 1:996779/150‑1 (MQ=255) gtctgtcCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTc < 2:973479/150‑1 (MQ=255) ggtcCTGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCACCGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGCCGTTGAGCTTGTCGACCAGCGGGTCGTg < 2:456646/149‑1 (MQ=255) tcCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAggcctggacagacaaactggccgaggaaatgtccggtcgtgcgcgcgagcgcatggcgacgtttgg < 2:293889‑M2/118‑67 (MQ=255) tcCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAggcctggacagacaaactggccgaggaaatgtccggtcgtgcgcgcgagcgcatggcgacgtttgg > 1:293889‑M2/1‑52 (MQ=255) tcCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGGTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGCTGCGCCTTGCAACGGTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCt > 1:268622/1‑150 (MQ=255) cAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAggcctggacagacaaactggccgaggaaatgtccggtcgtgcgcgcgagcgcatggcgacgtttggcggccgttatggcatcaagccagatcacctgcac < 2:606595‑M2/150‑101 (MQ=255) ggCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGAc < 2:713230/150‑1 (MQ=255) gCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGAcc < 1:1023814/150‑1 (MQ=255) ccACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGTAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGAt < 1:1014969/109‑1 (MQ=255) ccACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGTAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGAt > 2:1014969/1‑109 (MQ=255) tGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGGTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCGGTTGCGCCTTGCAGCGGTGTGCGGCTTCACCACTACGCTCTTGCAG‑‑CG‑GTTCGTGGAGCTTGTCGATCAGCGGGCCGTGCTCGGCCAGGTCCAc > 1:130816/1‑150 (MQ=255) gcggcgGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGAAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACg < 1:121003/150‑1 (MQ=255) ggcggcATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGc < 2:521448/150‑1 (MQ=255) cggcATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGa < 1:834591/150‑1 (MQ=255) gcATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCCGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCAAGTT‑‑TGAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGAcc < 1:520136/150‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGACCAGTATgcgcgc > 2:690438/1‑150 (MQ=255) gTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGACCAGTATGCGCGCTGGCAGCGTCGttt < 1:545482/150‑1 (MQ=255) ccgggTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGACCAGTATGCGCGCTGGCAGCGTCGttt > 1:587869/5‑150 (MQ=255) gTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGACCAGTATGCGCGCTGGCAGCGTCGTTTCAGc < 1:427124/150‑1 (MQ=255) | CACCAGGTGCAGGTGATCTGGCTTGATGCCATAACGGCCGCCAAACGTCGCCATGCGCTCGCGCGCACGACCGGACATTTCCTCGGCCAGTTTGTCTGTCCAGGCCACGGGTGCGGCGGCATAGGCAACGAAGCTGGCGCTGGGTTCGTAGGCCTGCAGCAGATGCAGTTGCGCCTTGCAGCGTTGTGCCAGTT‑‑CCAGTGC‑CGATTGCAGGATGTGGTCGTTGAGCTTGTCGATCAGCGGGTCGTGCTCGACCAGGTCCACGGCGACCAGTATGCGCGCTGGCAGCGTCGTTTCAGC > NC_002947/3127728‑3128024 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |