New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4116129 = | 42 (0.970) | 3 (0.070) | 3/240 | NT | 7.6% | coding (501/2187 nt) | ycaO | ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor |
? | NC_002947 | 4116228 = | 33 (0.810) | coding (402/2187 nt) | ycaO | ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor |
AATGTTGCGCCACGAGGCGATCTCGATCTTCATCCCCAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTGGATCTTGAAGATCTG > NC_002947/4116081‑4116377 | cagaccggccctgagttcgtgatcgaagtggtcgacaacctcgatgccGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGggcatcggc > 2:72871‑M1/49‑150 (MQ=255) gccctgagttcgtgatcgaagtggtcgacaacctcgatgccGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAgg > 1:778798‑M1/42‑150 (MQ=255) cgcCACGAGGCGATCTCGATCTTCATCCCCAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAgg > 2:449931/1‑150 (MQ=255) atctcgatctTCATCCCCAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACt > 2:352558/1‑150 (MQ=255) ttCATCCCCAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACg > 2:219514/1‑150 (MQ=255) cATCCCCAACCCGGCGAGGATGCCCGACAGGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTTGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGaa < 1:539876/150‑1 (MQ=255) ccAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGa > 2:131469/1‑138 (MQ=255) ccAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAg > 2:1015140/1‑150 (MQ=255) ccAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGGCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGa < 1:131469/138‑1 (MQ=255) cctcgatgccgatgcccaagggttgctgatgccggtgtcggacaccagcacctatatccccggcaaggacctgccgctggagcagaccattgccaacatgtcgggcatcGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGc > 1:778798‑M2/110‑150 (MQ=255) gccgatgcccaagggttgctgatgccggtgtcggacaccagcacctatatccccggcaaggacctgccgctggagcagaccattgccaacatgtcgggcatcGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTg > 2:72871‑M2/103‑150 (MQ=255) GATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGcac < 1:678529‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGATCCGTTCTGCACCACCt < 2:758668‑M1/150‑1 (MQ=255) tGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCAGCATCAGCAACCCTTGGTCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTa < 2:330783/150‑1 (MQ=255) gTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTAc < 2:1114772/150‑1 (MQ=255) aaTGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCa > 2:525139/1‑150 (MQ=255) aTGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAg < 2:732868/118‑1 (MQ=255) aTGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAg > 1:732868/1‑118 (MQ=255) tGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGc < 1:194020/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATgg > 2:205681/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCa < 1:287803/150‑1 (MQ=255) cagcacctatatccccggcaaggacctgccgctggagcagaccattgccaacatgtcgggcatcGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCa < 1:72871‑M2/86‑1 (MQ=255) aGGTCCTTGGCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGGAGCCCTTGGGCATCGGCAGCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACAACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAgg > 2:365216/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGGATCAGCAACCCTTGggcatcggcat > 1:123347/1‑65 (MQ=255) gTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGGATCAGCAACCCTTGggcatcggcat < 2:123347/65‑1 (MQ=255) gTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGAt > 2:202470/1‑150 (MQ=255) tCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGAt < 2:224889/86‑1 (MQ=255) tCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGAt > 1:224889/1‑86 (MQ=255) tGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTg < 2:358285/68‑1 (MQ=255) tGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTg > 1:358285/1‑68 (MQ=255) ccGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGa < 2:1096294/150‑1 (MQ=255) ggggATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACg < 1:449931/150‑1 (MQ=255) ggggATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACg > 1:158385/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGGCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACAATTCTAACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTc < 1:758668/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCg > 1:271155/1‑150 (MQ=255) acacCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCgg < 2:271155/150‑1 (MQ=255) acacCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCgg < 2:207159/150‑1 (MQ=255) acCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCa < 1:189478/112‑1 (MQ=255) acCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCa > 2:189478/1‑112 (MQ=255) cGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACC‑TTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGt < 1:1015140/150‑1 (MQ=255) gCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCt > 1:1019836/1‑150 (MQ=255) cAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACCCCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTg > 2:212902/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGAc < 1:719898/143‑1 (MQ=255) ccTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGAc > 2:719898/1‑143 (MQ=255) ttGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTGGATCtt < 1:139174/150‑1 (MQ=255) ggcatcGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTGGATCTTGaa < 1:202470‑M2/144‑1 (MQ=255) gcatcGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCCCGACTTCTGGGCCGGTCGCAACCACCTTTATTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTGGATCTTGAAg > 1:570570‑M2/6‑150 (MQ=255) ggcatcgAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTGGATCTTGAAGATCTg < 1:886817/150‑1 (MQ=255) | AATGTTGCGCCACGAGGCGATCTCGATCTTCATCCCCAACCCGGCGAGGATGCCCGACATGTTGGCAATGGTCTGCTCCAGCGGCAGGTCCTTGCCGGGGATATAGGTGCTGGTGTCCGACACCGGCATCAGCAACCCTTGGGCATCGGCATCGAGGTTGTCGACCACTTCGATCACGAACTCAGGGCCGGTCTGCACCACCTTTTTTACCGTGCAGCGGTCGATGGAGCGCAGGATGCCTTGACGGTCCTTGTCGGAGATGTCTTCGGGCAGTTCGACCTGGATCTTGAAGATCTG > NC_002947/4116081‑4116377 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |