| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4586100 | 9 (0.210) | 7 (0.230) | 7/178 | NT | 51.3% | intergenic (+139/+78) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| ? | NC_002947 | = 4586128 | 7 (0.230) | intergenic (+167/+50) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
GGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAA > NC_002947/4585979‑4586277 | ggCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTCTGTATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGc < 1:851034/150‑1 (MQ=255) cggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGnccc > 2:696034‑M1/82‑150 (MQ=255) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccct > 1:1024709‑M2/1‑146 (MQ=255) ggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCt > 1:693542‑M1/81‑150 (MQ=255) tgaagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGa > 2:104218‑M1/74‑150 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgg > 2:930498‑M2/1‑135 (MQ=255) ggcgctGCTCCATTGAAAGGTGGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCCG‑CATTCAAGTCCGGCACGGTccctggtaggagcgggt > 2:216517‑M2/2‑133 (MQ=255) gcgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtt > 1:429885‑M2/1‑132 (MQ=255) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctg > 2:47918‑M2/1‑130 (MQ=255) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctg < 1:47918‑M2/135‑6 (MQ=255) tgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacc > 1:223273‑M2/1‑128 (MQ=255) atcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACTAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggcc > 2:359796‑M1/51‑150 (MQ=255) tGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcc > 1:880602‑M2/1‑112 (MQ=255) ggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:284063‑M1/91‑1 (MQ=255) ggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:284063‑M1/31‑121 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAc < 1:896789/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt < 1:828131‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt < 2:145268‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATGAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc < 1:291305‑M1/150‑1 (MQ=255) cTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgc < 2:767067‑M2/141‑105 (MQ=255) cTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgc > 1:767067‑M2/1‑37 (MQ=255) CTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAcc < 2:480876‑M1/150‑1 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccagtcatcctcaacctttcaat > 1:878916‑M2/1‑36 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccagtcatcctcaacctttcaat < 2:878916‑M2/130‑95 (MQ=255) ACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCtt > 1:145268‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcgatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagctcagctgtt < 2:214094‑M2/150‑117 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagctgttc < 1:658460‑M2/150‑118 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcatcgacctttcaatggagcagcgcagatgagctgttc < 1:5798‑M2/150‑118 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgat < 2:466500‑M2/75‑43 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgat > 1:466500‑M2/1‑33 (MQ=255) CAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCca > 1:517291‑M1/1‑114 (MQ=255) CAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCca < 2:517291‑M1/114‑1 (MQ=255) AGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCacctttcc < 1:484710‑M1/150‑4 (MQ=255) ggCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacgg < 2:828131/149‑1 (MQ=255) ccTTGAA‑TGAGGCGATGCACCTGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCg > 2:1123051/1‑150 (MQ=255) ttGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCggg > 2:143011/1‑150 (MQ=255) ttGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCggg > 1:324194/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc > 2:976920/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtc > 2:281519/1‑150 (MQ=255) ccccTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACaaaa < 1:281519/150‑1 (MQ=255) | GGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAA‑TGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAA > NC_002947/4585979‑4586277 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |