New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5796767 | 43 (0.990) | 6 (0.150) | 6/242 | NT | 12.4% | coding (1189/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 5796785 | 44 (1.070) | coding (1171/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
CAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGA > NC_002947/5796636‑5796931 | cAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCtt < 1:222479/150‑1 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGGCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGCTTTGGCTC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACGTc < 2:715376/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa < 1:662904/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGTGCTAACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAgg < 1:389943/150‑1 (MQ=255) gggcGCGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCAAGGGCCGTGTCGGCCCGgccagatccttgccgtgga > 1:322302‑M2/2‑131 (MQ=255) cTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGcc < 1:32278/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATa > 2:244121/1‑150 (MQ=255) agccagcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATTGCCCCATACg > 2:511695/1‑150 (MQ=255) ccagcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTTGCCC‑GGGCCGACACGTCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATATCCCCATACGcc > 1:745380/1‑150 (MQ=255) ttGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTcc > 2:89348/1‑150 (MQ=255) tACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAg < 2:628025/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAgg < 1:383139/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGAGGGTGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAgg < 1:292502/150‑1 (MQ=255) gTGGCACGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGAt > 1:992659/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCCGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATg < 2:770971/150‑1 (MQ=255) ggCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATgg < 1:1087433/150‑1 (MQ=255) gcacgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGt < 2:992659/147‑1 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGa > 1:43518/1‑150 (MQ=255) gcgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGa > 2:285529/1‑150 (MQ=255) cgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGAt < 1:721335/150‑1 (MQ=255) cgACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGAt < 2:519002/150‑1 (MQ=255) gACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATg < 1:1067990/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGcc > 1:1059716/1‑111 (MQ=255) gCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGcc < 2:1059716/111‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg < 1:695018/150‑1 (MQ=255) ttGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtg < 2:43518/150‑1 (MQ=255) tGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtgg > 2:888475/1‑150 (MQ=255) tGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtgg > 2:888449/1‑150 (MQ=255) tCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtggtg < 1:244121/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCAc < 1:180124/150‑1 (MQ=255) gAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCgg < 1:89348/150‑1 (MQ=255) ggATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTTACCCAGCGCGCCGGGc < 2:325546/150‑1 (MQ=255) ggATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGc < 1:888475/150‑1 (MQ=255) ggATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGc < 1:888449/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGAcc < 1:372388/150‑1 (MQ=255) tttCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTAc > 2:983213/1‑150 (MQ=255) tCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCAATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGc > 2:747766/1‑150 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaa > 1:498692‑M2/1‑27 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaa < 2:498692‑M2/98‑72 (MQ=255) gATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATTGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACcgc < 1:511695/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccac < 1:479324‑M2/107‑82 (MQ=255) aTCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccac > 2:479324‑M2/1‑26 (MQ=255) aTCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACcgcg > 1:488199/1‑150 (MQ=255) gCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcg < 1:285529/150‑1 (MQ=255) cc‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCggg < 2:45037/110‑1 (MQ=255) cc‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCggg > 1:45037/1‑110 (MQ=255) cc‑GGGCCGACACGGCCCGgccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcgacgctg < 1:482882‑M2/150‑132 (MQ=255) ccGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCAATTTCCGAGGCGATGGTGATTTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCg < 1:747766/150‑1 (MQ=255) acacGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCgggc > 2:342792/1‑148 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCa < 1:159577/84‑1 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCa > 2:159577/1‑84 (MQ=255) cctgcTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGa > 2:683917/5‑150 (MQ=255) ctgcTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGAc < 1:683917/147‑1 (MQ=255) cggcgtGGCCAGCGCTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGGGGTGGGCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGAc < 1:127315/145‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCg < 1:1083026/140‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCg > 2:1083026/1‑140 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGa > 2:254197/1‑150 (MQ=255) | CAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCC‑GGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGA > NC_002947/5796636‑5796931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |