| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 916,472 | C→T | 5.1% | L366L (CTG→CTA) | PP_0798 ← | GGDEF domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 916,472 | 0 | C | T | 5.1% | 232.2 / 2.4 | 79 | L366L (CTG→CTA) | PP_0798 | GGDEF domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/36); new base T (2/2); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
TCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTCGCGGCC > NC_002947/916323‑916621 | tccCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGcc > 2:958730/1‑150 (MQ=255)tccCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCAACCATCAGTATCGcc > 2:923356/1‑150 (MQ=255) ccccACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCCCCATCAGTATCGCCa < 2:1093842/150‑1 (MQ=255) ccccACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCa < 1:242336/150‑1 (MQ=255) cccACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAg > 2:538274/1‑150 (MQ=255) ccaccaTAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGc > 2:122977/1‑150 (MQ=255) gcgcgcAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACg < 1:627948/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTAc > 1:417126/1‑150 (MQ=255) gCCAGGTCCGCAGGGCGACGAACGCATGCCTCGATGGCCTTGGCAACCTCGCGCAAGGCAAGGTCGCCGCCGGCATGCCCATTGCGCTAGTTAAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGt > 2:7863/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGtt < 2:138344/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGtt > 2:1094287/1‑150 (MQ=255) aGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGTCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTgg < 2:174253/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTgg > 2:475939/1‑150 (MQ=255) ggTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTggg > 1:954603/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCgg > 2:896928/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCgg < 2:954603/150‑1 (MQ=255) gacgaATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCAtt > 2:172969/1‑150 (MQ=255) gacgaATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCAtt > 1:554677/1‑150 (MQ=255) gaATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCt > 1:275935/1‑150 (MQ=255) atgcatgcCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTgg > 1:187969/1‑150 (MQ=255) atgcCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCgg < 2:86478/134‑1 (MQ=255) atgcCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCgg > 1:86478/1‑134 (MQ=255) gcCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCgcagc > 1:508245/1‑150 (MQ=255) gcCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCgcagc > 1:200728/1‑150 (MQ=255) ccTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATACGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCgcagca < 1:923356/150‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGcac < 2:808577/150‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGcac > 1:808577/1‑150 (MQ=255) ccTTTGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCGCGGCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTGCGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCa < 1:916578/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCa > 1:517374/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGTTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAg > 2:772944/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTTAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGc < 1:1092372/150‑1 (MQ=255) ttGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGc < 1:1092486/150‑1 (MQ=255) tCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGcggcgg > 1:362844/1‑150 (MQ=255) cgcgCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTCAGTGGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGt < 1:475939/150‑1 (MQ=255) cgcgCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGt < 1:958730/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGtt < 2:200728/150‑1 (MQ=255) gcAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTgg > 2:673716/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggc < 1:929869/150‑1 (MQ=255) aaGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggcc > 2:463833/1‑150 (MQ=255) aaGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggcc > 1:973094/1‑150 (MQ=255) ggCATGTTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggccag < 1:772944/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCGCCGGCATGGACATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGAGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggccaggcc > 1:1092303/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTggccaggcca < 2:517374/150‑1 (MQ=255) ccgccgGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAgg < 1:172969/150‑1 (MQ=255) tggccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTg > 1:1013281/1‑150 (MQ=255) ccatggcGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGaa > 2:423555/1‑150 (MQ=255) gTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGc > 1:49425/1‑150 (MQ=255) gAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAg < 1:1094287/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTAGCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGt < 2:752303/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGtcttc > 1:406415/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGtcttct > 2:512667/1‑150 (MQ=255) gAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCttcttc > 2:744429/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCg < 1:423555/150‑1 (MQ=255) aaGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACAGGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCg < 2:855949/150‑1 (MQ=255) gTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACAGGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCCAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGc < 2:554677/150‑1 (MQ=255) gtccacgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTc > 2:1031379/1‑150 (MQ=255) ccacgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGt > 1:990094/1‑150 (MQ=255) ccacgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGt > 1:842186/1‑150 (MQ=255) cacgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTg < 2:990094/150‑1 (MQ=255) cacgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTg < 1:744429/150‑1 (MQ=255) cgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTggc < 2:973094/150‑1 (MQ=255) cgtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTggc < 1:538274/150‑1 (MQ=255) gtccacCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTggcg > 1:1005938/1‑150 (MQ=255) 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caTCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAACTTAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGgcggcggcg > 1:11329/1‑150 (MQ=255) aTCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGgcgc < 2:330804/150‑1 (MQ=255) tCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCa < 2:798201/150‑1 (MQ=255) tCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCa < 2:49425/150‑1 (MQ=255) aGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGt < 2:1013281/150‑1 (MQ=255) tCGCTAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAg < 2:339811/115‑1 (MQ=255) tCGCTAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAg > 1:339811/1‑115 (MQ=255) tCGCTAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAg > 1:339771/1‑115 (MQ=255) tCGCTAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAg < 2:339771/115‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTcgc < 1:774707/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTcgcg < 1:959244/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTcgcg < 2:49040/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGAGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTCGCgg > 2:126795/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTCGCGGcc > 2:828539/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTCGCGGcc > 2:85132/1‑150 (MQ=255) | TCCCCACCATAGCGCGCAGCCAGGTCCGCAGGGCGACGAATGCATGCCTCGATGGCCTTGGCCACCTCGCGCAAGGCATGGTCGCCGCCGGCATGGCCATGGCGCTGGTTGAATGCCTTGAAGTGGTCCACGTCCACCATCAGTATCGCCAGCGGCTTACGGCTACGTTGGGCGCGGGCCCATTCCTGGCGCAGCACATGGTCCAGCCTGCGGCGGTTGGCCAGGCCAGTCAGGCTATCGGTGGAAGCGAGCATGGCCAGGTCTTCTTCGGCTTCGTGGCGGCGGCGCAGTTCGCGGCC > NC_002947/916323‑916621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |