Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 163,717 | G→C | 6.8% | A39A (GCC→GCG) | scpC ← | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 163,717 | 0 | G | C | 6.8% | 215.1 / 4.9 | 68 | A39A (GCC→GCG) | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/30); new base C (2/3); total (35/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAACTACTG > NC_002947/163574‑163864 | ggCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGTCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCgg < 2:990302/150‑1 (MQ=255) ggCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCgg < 2:232710/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTg > 2:378009/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCCCAGGCGCGGGTGa < 2:321774/150‑1 (MQ=255) gggCCAACACACTGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATCGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaa < 2:616233/150‑3 (MQ=255) ggCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaag < 2:778225/150‑4 (MQ=255) ccGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACa < 2:233057/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCGTGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAg > 1:1123485/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAg < 2:412150/150‑1 (MQ=255) cTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCAt < 1:710316/150‑1 (MQ=255) cTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCAt > 2:756391/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGACTCCCTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGc < 1:747743/150‑1 (MQ=255) tCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGt > 2:396137/1‑150 (MQ=255) tCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGt > 1:789/1‑150 (MQ=255) tCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGt > 2:562657/1‑150 (MQ=255) aGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAATCATGCCGTcc > 1:597875/1‑150 (MQ=255) gttgttTGTCCAGGTCATTGGCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGTCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCt > 1:561872/1‑150 (MQ=255) tgtttgtCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCg < 2:789/150‑1 (MQ=255) tttgtCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGAt < 1:825284/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCCTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaag > 2:135436/1‑116 (MQ=255) tCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCCTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaag < 1:135436/119‑4 (MQ=255) ccAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGAc < 1:396137/150‑1 (MQ=255) cAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGAt > 2:143704/1‑144 (MQ=255) cAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGAt < 1:143704/144‑1 (MQ=255) aGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCa < 2:1057071/130‑1 (MQ=255) aGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCa > 1:1057071/1‑130 (MQ=255) gTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCgg > 2:224598/1‑103 (MQ=255) gTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCgg < 1:224598/103‑1 (MQ=255) tCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCa > 1:816453/1‑147 (MQ=255) tCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCa < 2:816453/147‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGc > 2:663295/1‑150 (MQ=255) ttGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCa > 1:596000/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGc > 1:641425/1‑110 (MQ=255) cAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTACTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGc < 2:641425/110‑1 (MQ=255) gcgcCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTc > 1:473888/1‑150 (MQ=255) ggTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTAc < 2:908361/150‑1 (MQ=255) caGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCt < 1:378009/150‑1 (MQ=255) ggttGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTGCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCtgt < 2:779262/147‑1 (MQ=255) gCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCtgtg > 2:1066902/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGggag < 1:663295/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGTGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGc < 1:473512/150‑1 (MQ=255) ttGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCGTCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGa > 1:1107326/1‑150 (MQ=255) tGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGAt < 1:1066902/150‑1 (MQ=255) ggCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGGCGGGCAGCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATc > 1:619140/1‑150 (MQ=255) cACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCAc > 2:840753/1‑150 (MQ=255) cACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCAc < 2:473888/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATc < 2:785363/83‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATc > 1:785363/1‑83 (MQ=255) ttCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTa > 2:997815/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTa < 1:562657/150‑1 (MQ=255) gCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATg > 1:173888/1‑150 (MQ=255) gCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATg > 1:685952/1‑150 (MQ=255) cAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGa > 1:636913/1‑150 (MQ=255) aaTGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGAt > 2:348676/1‑150 (MQ=255) atctatgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGGCAGTGGTGCCTGCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGNAtt < 2:705317/146‑1 (MQ=255) atgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTa > 1:768961/1‑150 (MQ=255) atgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTa > 2:159774/1‑150 (MQ=255) tgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCACACGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTgagat > 1:705317/1‑146 (MQ=255) ggTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACgg < 2:148058/132‑1 (MQ=255) ggTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACgg > 1:148058/1‑132 (MQ=255) ggTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTAtctc < 2:685952/150‑1 (MQ=255) gTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCCGCCGCACTCATTAcc < 2:883731/95‑1 (MQ=255) gTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTAcc > 1:883731/1‑95 (MQ=255) ccTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTAc > 1:540534/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTg > 1:127450/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGaaa < 2:173888/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAactact > 2:615483/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAACTACTg < 2:636913/150‑1 (MQ=255) | GGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAACTACTG > NC_002947/163574‑163864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |