Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,850,958 | T→A | 100% | M1K (ATG→AAG) † | relA → | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,850,958 | 0 | T | A | 100.0% | 168.7 / NA | 50 | M1K (ATG→AAG) † | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (27/23); total (27/23) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
AGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTAGAGAAAA > NC_002947/1850817‑1851104 | aGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCGAGCGTACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAgg > 2:770685/1‑150 (MQ=255) gACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCAAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGt < 1:798908/150‑1 (MQ=255) cGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTCATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTCAAACAACGAACGTACAGGTga < 2:565275/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTgaga < 1:165537/150‑1 (MQ=255) gcATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGATACGGTTACCAATAAAGGGCGGCGGCTCGGTGATTGTCAGCACTCTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAAACATGTAGGTACAGGTGagagg > 1:607415/1‑149 (MQ=255) cATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCAAGAAGGAGCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTg < 2:651261/150‑1 (MQ=255) aGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGGATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGc < 2:56067/150‑1 (MQ=255) gCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCg < 2:723807/150‑1 (MQ=255) ccATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCgg < 2:1099523/150‑1 (MQ=255) cATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGt < 2:757274/150‑1 (MQ=255) cATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGt < 2:1013566/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTc > 2:116053/1‑150 (MQ=255) gCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAac > 2:96893/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGAc > 2:889495/1‑150 (MQ=255) tGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCg > 2:394179/1‑150 (MQ=255) gCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCAt > 1:797234/1‑150 (MQ=255) cccTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATgg > 1:389144/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgt > 2:6852/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgt > 2:512439/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgt < 1:889495/150‑1 (MQ=255) ttGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgtg < 1:580625/150‑1 (MQ=255) gCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGt < 1:770685/150‑1 (MQ=255) gCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGt < 1:116053/150‑1 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAac < 1:696130/104‑1 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAac > 2:696130/1‑104 (MQ=255) gcggcCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGt < 1:955628/145‑1 (MQ=255) gcggcCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGt > 2:955628/1‑145 (MQ=255) gcggcCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGAtt > 1:811367/1‑150 (MQ=255) ccAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCgg > 1:992944/1‑135 (MQ=255) ccAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCgg < 2:992944/135‑1 (MQ=255) acTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGaa > 1:692297/1‑150 (MQ=255) tCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGa < 1:87554/147‑1 (MQ=255) tCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGa > 2:87554/1‑147 (MQ=255) tCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaag > 1:8985/1‑150 (MQ=255) tCGTATGGTGTGCTACAGTTAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaag > 1:879254/1‑150 (MQ=255) gTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaagaa < 1:6852/150‑1 (MQ=255) gcATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGttt < 2:797234/150‑1 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTg > 2:137231/1‑150 (MQ=255) gAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGAACGCAGTAGCAATCTCGAAGCATGGGTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGctct > 1:412010/1‑150 (MQ=255) aGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGa < 1:512439/150‑1 (MQ=255) gTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAgg > 2:887568/1‑150 (MQ=255) tAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGAtt < 2:73221/98‑1 (MQ=255) tAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGAtt > 1:73221/1‑98 (MQ=255) tAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGt > 2:194465/1‑150 (MQ=255) tAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCCAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGCAAGAAGCCTGCGCGTTTGCTCTCGAggg > 1:847488/1‑149 (MQ=255) aaaCAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAgcg > 1:722763/1‑116 (MQ=255) aaaCAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAgcg < 2:722763/116‑1 (MQ=255) aaaGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCaa > 2:921610/1‑54 (MQ=255) aaaGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCaa < 1:921610/54‑1 (MQ=255) aGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGAATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTAGAGaaaa > 2:195549/1‑150 (MQ=255) | AGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATGGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTAGAGAAAA > NC_002947/1850817‑1851104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |