| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,944,468 | T→G | 5.7% | L285R (CTG→CGG) | PP_2577 → | paraquat‑inducible protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,944,468 | 0 | T | G | 5.7% | 198.9 / 4.0 | 70 | L285R (CTG→CGG) | PP_2577 | paraquat‑inducible protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/34); new base G (2/2); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
GTGCCAATGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCACCTCGATCCAGCTCGATTACGATGCTA > NC_002947/2944321‑2944608 | gTGCCAATGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGt > 2:453727/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCt > 1:662620/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTc > 2:178435/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTc > 1:1031920/1‑150 (MQ=255) tGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTcc < 1:857324/150‑1 (MQ=255) gTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAg < 2:662620/150‑1 (MQ=255) gTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTCTCGCCTCCGCATGGCCAg > 2:383311/1‑150 (MQ=255) gTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACAGCGCCATGTCGCGGTCggc < 2:720738/137‑3 (MQ=255) gTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACAGCGCCATGTCGCGGTCggc > 1:720738/1‑135 (MQ=255) tCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCa < 2:638678/142‑1 (MQ=255) tCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCa > 1:638678/1‑142 (MQ=255) tCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAgg > 1:96502/1‑150 (MQ=255) tACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCa > 1:88334/1‑150 (MQ=255) aCCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAg < 2:503070/150‑1 (MQ=255) ccGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGt < 1:1024217/150‑1 (MQ=255) ccGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGt > 2:321136/1‑150 (MQ=255) cGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTa > 1:990829/1‑150 (MQ=255) cGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTa > 1:348808/1‑150 (MQ=255) aaTCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCTCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTAcc < 2:972139/150‑1 (MQ=255) tCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTg < 2:117938/150‑1 (MQ=255) tGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGt > 1:760937/1‑150 (MQ=255) ttCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCg > 1:275903/1‑150 (MQ=255) tgttggGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGAcc > 2:1127373/4‑150 (MQ=255) ggtggGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGAATTAGCTGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCa < 2:88334/150‑1 (MQ=255) ttggcgggcTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGTGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAgg < 1:6515/148‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATgcgc < 2:228699/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCt < 1:576230/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTc < 1:393535/150‑1 (MQ=255) ccGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCa < 2:613094/124‑1 (MQ=255) ccGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCa > 1:613094/1‑124 (MQ=255) ccGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGgcg > 1:85287/1‑150 (MQ=255) gccgcGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGt > 2:1066348/1‑70 (MQ=255) gccgcGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGt < 1:1066348/70‑1 (MQ=255) gccgcGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTg > 1:387370/1‑150 (MQ=255) gccgcGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTg < 2:760937/150‑1 (MQ=255) ccgcGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTgg > 1:457605/1‑150 (MQ=255) cgcgCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGa < 1:453727/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAg > 1:536158/1‑150 (MQ=255) gcAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGtt > 2:438629/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAg < 1:42454/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAg > 2:178319/1‑150 (MQ=255) ccGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGgc > 2:999710/1‑131 (MQ=255) ccGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGgc < 1:999710/131‑1 (MQ=255) ccGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAgg < 1:178319/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGCTGCCGCCCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGTCATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGAAGTGGCGCTTCCACCTGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGgt < 2:469242/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGtgtg < 2:275903/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATgc < 1:1012466/107‑1 (MQ=255) tgctgcCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATgc > 2:1012466/1‑107 (MQ=255) tgctgcCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGa > 1:844143/1‑150 (MQ=255) gctgcCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGGGCGAGGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAg < 1:11079/150‑1 (MQ=255) gctgcCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAg > 1:133467/1‑150 (MQ=255) tgcCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGtt > 2:636983/1‑150 (MQ=255) gACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGc > 1:455767/1‑150 (MQ=255) gACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTCTGGc > 1:208912/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCgg < 2:455767/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCgg < 1:1126115/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCgg < 1:920480/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCgg < 2:407410/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCgg < 2:151760/150‑1 (MQ=255) ccGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCAc > 2:96185/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGACGGGTCAc < 2:133467/150‑1 (MQ=255) ccAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCACCTCGAt < 2:762503/150‑1 (MQ=255) cAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCACCTCGATc > 2:952758/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGACCGCGCCATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTGGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCACCTCGATCCAGCTc < 2:348808/150‑1 (MQ=255) gcGACAGCGCCATGTCGCGGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCa > 1:864908/2‑132 (MQ=255) gcGACAGCGCCATGTCGCGGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCa < 2:864908/131‑1 (MQ=255) ccGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCACCTCGATCCAGCTCGATTACGa < 1:178435/150‑1 (MQ=255) aCATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTCGCCGGGTCACCTCGATGCAGCGCGAGTACGATGcca < 2:457605/150‑3 (MQ=255) cTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTg > 2:703292/1‑106 (MQ=255) cTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTg < 1:703292/106‑1 (MQ=255) | GTGCCAATGGCCTGAAGGTCGATACCGAATCGCTGTCGTCGATTCTGGTGGGCGGGCTGGCCTTCGGCTCGCCCGATTTCGCCGCGCAAGCCGAGCCTGCTGCCGACCAGGCCCGCTTCCAGCTATTCGCCGACCGCGACATGGCGCTGTCGCCTCCGCATGGCCAGGCGCAGTACCTGCAGTTGCGCTTCGACCAGGCCATGCGCGGCCTGTCGGTGGGCGCGCCAGTGGAGTTCAAGGGTGTGGAGTTTGGCCGGGTCACCTCGATCCAGCTCGATTACGATGCTA > NC_002947/2944321‑2944608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |