Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,556,306 | C→T | 8.5% | A79T (GCC→ACC) | zwfB ← | glucose 6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,556,306 | 0 | C | T | 8.5% | 126.2 / 2.6 | 47 | A79T (GCC→ACC) | zwfB | glucose 6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (20/23); new base T (2/2); total (22/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
ATAGAAAATGGCATTGCCGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGCGCGG > NC_002947/4556166‑4556452 | aTAGAAAATGGCATTGCCGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGGCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCTAGGCGCTTGGCCAGACGGGCCCATAGCTGCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTc > 2:379772/1‑150 (MQ=255) aaTGGCATTGCCGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCgccgcc < 2:864943/150‑1 (MQ=255) aaTGGCATTGCCGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCgccgcc > 1:133507/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTAACAGGATCGTGAATGTGACACGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCa > 2:942818/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGc < 2:315669/150‑1 (MQ=255) gCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAAGGACGTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGAc > 1:336453/1‑150 (MQ=255) ggTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCAt > 1:1049207/1‑150 (MQ=255) ggTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCAt < 2:844865/150‑1 (MQ=255) gATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTg < 2:78181/150‑1 (MQ=255) gATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTg < 1:632796/150‑1 (MQ=255) gATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTAGTATGCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCGCGCTCGACCATGAACGCGTg < 1:562152/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGgcgcg < 1:277747/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCgcggcg < 2:659284/150‑1 (MQ=255) gCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCgg < 2:710129/145‑1 (MQ=255) gCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCgg > 1:710129/1‑145 (MQ=255) gCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTg > 2:753304/1‑150 (MQ=255) tCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGGTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCCAGCGTGGGTATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCggg < 1:476335/150‑1 (MQ=255) gagaAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATACCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCTCGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGtt < 2:584703/150‑1 (MQ=255) aaaGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTCCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATg < 2:857354/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCa > 2:363974/1‑150 (MQ=255) gTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCTCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCt > 1:629489/1‑121 (MQ=255) gTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCt < 2:629489/121‑1 (MQ=255) gTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGTGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGAt > 1:134815/1‑150 (MQ=255) gTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGTGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGAt > 1:134687/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATgcg > 1:926214/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAg < 1:1075095/150‑1 (MQ=255) gcTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTAc > 2:213167/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACg < 1:753304/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTc < 2:1064210/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTc < 1:213167/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCa > 1:415296/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAg > 2:1084804/1‑150 (MQ=255) aGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGc > 2:424082/1‑150 (MQ=255) gggCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGAGCAGGTTACGGTCCAGCAAAc > 1:126676/1‑150 (MQ=255) ccATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTc > 1:123125/1‑150 (MQ=255) aTAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGt > 2:285432/1‑66 (MQ=255) aTAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGt < 1:285432/66‑1 (MQ=255) aTAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCAc < 2:1049207/150‑1 (MQ=255) cTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGcc > 2:131128/1‑149 (MQ=255) tctcGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGa > 2:72690/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAgcgc > 1:271677/1‑150 (MQ=255) ttGGTGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGcgcg < 2:134687/150‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGcgcg < 2:134815/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGcgcg < 1:1084804/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAGAGCCTCGGCGCTGGCCCGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCGAACCGTCACGGATGAGGTTGTACAGCGCgg < 2:515976/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGAGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGCGCgg < 2:126676/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGCGCgg < 1:338357/149‑1 (MQ=255) | ATAGAAAATGGCATTGCCGTGGCGGGTCTTGTCGATGCGCCTGGCCAGGGCCTGGTAGGTGGCCGGATCGAGAAAGTCGCCCGTCTGGTAATCGAGGCGCTTGGCCAGGCGGGCCCATAGCTTCTCGTCCAGGCACTTGGCGCTGCCCTCGCCGCCTTTGTCACGCTCGACCATGAACGCGTGCAGGCGCGCGGCGAAATCCTCGGCGCTGGCCGGGTTATGGTCAACGCCGACGATGCGCAGGTTACGGTCCAGCAAACCGTCACGGCTGAGGTTGTACAGCGCGG > NC_002947/4556166‑4556452 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |