Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 593,437 | A→C | 6.5% | E391A (GAG→GCG) ‡ | PP_0503 → | MFS transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 593,437 | 0 | A | C | 6.5% | 191.5 / 4.1 | 70 | E391A (GAG→GCG) ‡ | PP_0503 | MFS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/33); new base C (2/3); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
TATTCGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGTGTCGATGTCGACGTACCA > NC_002947/593292‑593584 | tATTCGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGgcc > 2:1038204/1‑150 (MQ=255) ttCNCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGgccgc > 2:696556/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGGCAGCGTTTTGGGTGCGGGGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGgccgc > 2:856147/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCTCGGCCGccc < 2:1027083/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGccc < 2:938203/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCt > 1:39636/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTTGCGAGCTGGGTGGTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCTGCCGGAGTGTGCTACTGGCTATAGCTGCAACGCGCGGGGGTGGCCGAGGATGTCCTGCAAt < 2:332148/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGt < 1:316213/150‑1 (MQ=255) cGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTc > 2:611135/1‑150 (MQ=255) gTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTTTAATGTTCAg < 2:515485/150‑1 (MQ=255) gTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAg < 2:897723/150‑1 (MQ=255) gTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAg < 2:1023172/150‑1 (MQ=255) tttGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAgg < 1:746399/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTg < 1:398563/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGCCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGTGCTAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCaa < 1:631454/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGt < 2:513525/137‑1 (MQ=255) ggTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGt > 1:513525/1‑137 (MQ=255) tgtTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCa > 2:499018/1‑150 (MQ=255) gtTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCAt > 1:256613/1‑150 (MQ=255) tttGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATg < 2:256613/150‑1 (MQ=255) tGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGta < 1:856147/150‑1 (MQ=255) cacaCTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAgaccg < 2:529727/140‑1 (MQ=255) cacaCTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAgaccg > 1:529727/1‑140 (MQ=255) acacTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCCTCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGATGCCACGGGCGAGCGGCGCAGATCCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATAc > 1:523454/1‑150 (MQ=255) acTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCATAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATAccc > 2:1082996/1‑150 (MQ=255) acTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATAccc > 1:609860/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtc > 2:456654/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtc < 2:548504/150‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgac > 2:1123574/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgt > 2:736338/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgt > 1:534742/1‑150 (MQ=255) gCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcg > 2:366447/1‑150 (MQ=255) ggTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgac > 1:615041/1‑150 (MQ=255) gtgtgtGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGtat < 2:926935/129‑1 (MQ=255) gtgtgtGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGtat > 1:926935/1‑129 (MQ=255) gtgtgGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgacgtc < 1:736338/150‑1 (MQ=255) tgGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgacgtcgac < 1:456654/150‑1 (MQ=255) tgGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgacgtcgac > 1:271376/1‑150 (MQ=255) ggCNTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCt > 2:700671/1‑150 (MQ=255) ggCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTc < 1:611135/150‑1 (MQ=255) ggCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGAGCGAGAGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTc > 2:1122098/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAGCAGTGCCGTCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTg < 2:730767/150‑1 (MQ=255) tGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGc < 1:818190/150‑1 (MQ=255) gCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCTACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGt < 2:271376/150‑1 (MQ=255) gCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGt < 2:534742/150‑1 (MQ=255) tCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGc > 2:989513/1‑150 (MQ=255) acAGTGCGGCGGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGc > 1:945291/2‑150 (MQ=255) gTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCaa > 2:428979/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAg > 1:660355/1‑150 (MQ=255) gccgccGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAgg < 1:1038204/150‑1 (MQ=255) gccgcACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACtt < 2:512467/77‑1 (MQ=255) gccgcACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACtt > 1:512467/1‑77 (MQ=255) aCTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCgg < 2:866997/150‑1 (MQ=255) tgtgCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCTACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGc > 2:1112084/1‑150 (MQ=255) tgtgCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGACGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGc > 2:234243/1‑150 (MQ=255) cTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgac > 2:529784/1‑99 (MQ=255) cTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgac < 1:529784/99‑1 (MQ=255) aTGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGc > 2:819281/1‑150 (MQ=255) cTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTg < 2:39636/150‑1 (MQ=255) cAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACgg < 2:208566/80‑1 (MQ=255) cAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACgg > 1:208566/1‑80 (MQ=255) aaCGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGgtgt < 1:499018/150‑1 (MQ=255) cgcgAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATCCCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCACGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGtgtcgat < 1:366447/150‑1 (MQ=255) cgcgAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGtgtcgat < 1:1123574/150‑1 (MQ=255) cgAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGtgtcgatgt < 1:700671/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCAc > 2:54761/1‑69 (MQ=39) aGGGCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCAc < 1:54761/69‑1 (MQ=39) aGGGCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACgg < 1:887729/71‑1 (MQ=39) aGGGCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACgg > 2:887729/1‑71 (MQ=255) cGAGCCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGTGTCGATGTCGACGTACCa < 2:523454/150‑1 (MQ=255) | TATTCGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGTGTCGATGTCGACGTACCA > NC_002947/593292‑593584 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |