New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5506637 | 87 (1.380) | 14 (0.280) | 12/206 | 3.4 | 19.1% | intergenic (+48/‑151) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
? | NC_002947 | = 5506650 | 51 (1.040) | intergenic (+61/‑138) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCC > NC_002947/5506490‑5506786 | gctggGGGCCATCTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGGGTTGAGGCGCCGAAGGGTCTTGGCAAGCGCTTG‑AGCCTTTTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa < 1:507448/150‑1 (MQ=38) ctggGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGTTGGATGAGAGGTTGGGGGTGGTTGGTCTGGTGGTGGGGCGCCGGAAGATC‑GGAAGAGCCCCTGTATCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCTCTCCTACGAg > 1:1534367/1‑150 (MQ=12) ctggGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAg < 2:1534367/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGt < 2:1492299/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGtt < 1:831978/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGtt < 1:954880/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGTGAGGTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGGCTTGGCCAGAGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGAGCCGCGTTgg > 1:893632/1‑149 (MQ=38) ttCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGt < 2:686472/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGt < 1:895538/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGAGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTa < 2:1433659/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGGTGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAgg < 2:350604/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAgg > 2:1319952/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAg > 1:647194/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAg < 2:647194/149‑1 (MQ=255) ggtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCg‑g < 2:1087406/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTa < 2:106617/150‑1 (MQ=255) tCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCTGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:896317/1‑117 (MQ=255) tCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCTGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:896317/117‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGTTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGt < 1:1551210/130‑1 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGTTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGt > 2:1551210/1‑130 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGa > 2:427654/1‑150 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGCA‑GGTGATCCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGATGCTCAGCGGGACCGCGTGGTAGCTTCG‑TGTTTACCCGCGa > 1:1054539/1‑150 (MQ=255) aTGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGaa < 1:914163/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGaa > 1:643829/1‑150 (MQ=255) ggtggtGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAaga < 2:893632/150‑1 (MQ=255) tggtgATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCCTATCTCATCCTGT‑TTTTCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGCGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAgg > 2:53945/1‑150 (MQ=37) ggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGa > 1:1358558/1‑150 (MQ=255) tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTa > 2:1356034/1‑111 (MQ=255) tGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTa < 1:1356034/111‑1 (MQ=255) gATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGa < 2:957645/112‑1 (MQ=255) gATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGa > 1:957645/1‑112 (MQ=255) aTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTAcc < 2:463357/122‑1 (MQ=255) aTAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTAcc > 1:463357/1‑122 (MQ=255) gTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 1:1319952/150‑1 (MQ=255) gtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGCTG‑AAGAGCGTGGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGaaaa > 2:438671/1‑150 (MQ=38) tgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAAt < 1:435209/150‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCGAGCGCTTG‑AGGCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGCCCGCGTTGTCGGAGGG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATg < 2:949680/150‑1 (MQ=38) ggCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGGGGTTGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa < 1:438671/150‑1 (MQ=37) ggCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAACGCTCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa < 1:908595/150‑1 (MQ=38) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACATGCGGAATGCTTAGCCGAAACTGCag > 2:255705/1‑150 (MQ=255) ccgccgTGTCTTGGCCAGCGCTTG‑CGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGt < 1:1277722/150‑1 (MQ=255) gccgGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTa > 1:167647/1‑87 (MQ=255) gccgGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTa < 2:167647/87‑1 (MQ=255) cgGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGAt > 1:1147705/1‑150 (MQ=255) tCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGt > 2:1277615/1‑150 (MQ=255) tCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCA‑TGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGt > 1:507177/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 1:364593/1‑106 (MQ=255) ttGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 2:364593/106‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa < 2:1029560/122‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGa > 1:1029560/1‑122 (MQ=255) ccAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCg‑g > 1:175927/1‑82 (MQ=255) ccAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCg‑g < 2:175927/82‑1 (MQ=255) cAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGccc > 1:956339/1‑150 (MQ=255) ttG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCt > 1:483996/1‑150 (MQ=255) ttG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCt < 2:483996/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAAc > 2:155252/1‑150 (MQ=255) cTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa < 1:1411939/48‑1 (MQ=255) cTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGa > 2:1411939/1‑48 (MQ=255) cTTGTGTT‑GCCTATGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGaa < 1:547470/148‑1 (MQ=255) cTTGTGTT‑GCCTATGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGaa > 2:547470/1‑148 (MQ=255) ttGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAAcgc > 2:816727/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGa < 1:574187/133‑1 (MQ=255) gCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGa > 2:574187/1‑133 (MQ=255) tgtgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGtt < 1:1163084/61‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGtt > 2:1163084/1‑61 (MQ=255) tgtgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGc > 1:463088/1‑98 (MQ=255) tgtgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGc < 2:463088/98‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCCTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGGTTtagcctagc > 1:1500453/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTg > 2:973313/1‑88 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGCCAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTg < 1:973313/88‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACa < 2:727552/75‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACa > 1:727552/1‑75 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGc < 1:963493/41‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGc > 2:963493/1‑41 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACctct > 1:1426500/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTg < 2:643829/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCgtgt > 1:554755/1‑127 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCgtgt < 2:554755/127‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGGCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaaga < 1:427654/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGAt < 2:207396/92‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGAt > 1:207396/1‑92 (MQ=255) cccGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaa > 1:827267/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaaa < 1:1456245/63‑1 (MQ=255) gCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaaa > 2:1456245/1‑63 (MQ=255) gCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGAc < 1:816727/150‑1 (MQ=255) ccccTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACt < 1:255705/148‑1 (MQ=255) cTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACt < 1:155252/150‑1 (MQ=255) tACAAGGGACCGCGTTGTACGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAg > 2:1240144/1‑150 (MQ=255) cGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGcc < 2:956339/150‑1 (MQ=255) | GCTGGGGGTGATGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTG‑AGCCTTGTGTT‑GCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGACCGCGTTGTAGGAGCG‑GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCC > NC_002947/5506490‑5506786 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |