| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,223,663:1 | +C | 8.6% | coding (314/681 nt) | PP_2824 ← | TetR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,223,663 | 1 | . | C | 8.6% | 268.1 / 19.6 | 70 | coding (314/681 nt) | PP_2824 | TetR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/32); new base C (3/3); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
GGAAGTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCACC > NC_002947/3223514‑3223811 | ggAAGTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCt < 1:816449/150‑1 (MQ=255) gTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATc > 2:318290/1‑150 (MQ=255) taGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCg > 1:1275254/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑‑AGGTCGa > 1:454500/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑‑AGGTCGac < 2:454500/150‑2 (MQ=255) gcgcTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGAt > 2:760126/1‑150 (MQ=255) ctgctTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTc > 2:56227/1‑150 (MQ=255) acTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTc > 2:1254233/1‑150 (MQ=255) tGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATAGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCC‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGa < 2:1032434/150‑1 (MQ=255) aaCGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTg > 1:1195240/1‑150 (MQ=255) aCGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGt < 1:589834/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTc < 1:56227/150‑1 (MQ=255) gggCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGGCTTTGTCGaa > 1:1154533/1‑150 (MQ=255) gggCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGaa < 2:69203/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑Ga > 1:811483/1‑109 (MQ=255) cTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑Ga < 2:811483/109‑1 (MQ=255) gTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGt < 1:318290/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTCGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGt > 2:349164/1‑150 (MQ=255) cGGGCCTGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAAGCTGATCCATTGATGCCACTGCTCAGTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTCTGTCGAACAGGGTATgg > 1:99414/1‑149 (MQ=255) cGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAg < 2:104457/107‑1 (MQ=255) cGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAg > 1:104457/1‑107 (MQ=255) cGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTgc < 2:1195240/150‑1 (MQ=255) aTGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑‑AGGTCGac < 1:341038/108‑2 (MQ=255) aTGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑‑AGGTCGac > 2:341038/1‑107 (MQ=255) gCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑‑AGGTCGaca < 1:955558/101‑3 (MQ=255) gCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑‑AGGTCGaca > 2:955558/1‑99 (MQ=255) gCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACa < 2:1276017/129‑1 (MQ=255) gCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACa > 1:1276017/1‑129 (MQ=255) ttGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCAt > 1:878807/1‑150 (MQ=255) aGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATttct > 2:1279773/1‑150 (MQ=255) aGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATttct > 1:894856/1‑150 (MQ=255) ccATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATttcttc < 2:388395/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCttg > 2:702778/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTc < 1:71210/99‑1 (MQ=255) aaGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTc > 2:71210/1‑99 (MQ=255) aGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGAAACGGCACTGACCATTTCTTCCttgttg < 2:516708/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTgg < 1:650415/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGaa < 2:878807/150‑1 (MQ=255) gTTGCATGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGCCTCGA‑AACGGCAA‑GTCCGGTTTTCGATCTCCAGCAGTTTGTCGACTTTGTCGAATAGGGTCTTCGCAACTGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGaa < 1:1254233/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAag < 1:265294/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAagtag > 2:388526/1‑150 (MQ=255) cTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAagtagt < 1:858736/150‑1 (MQ=255) ggCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGtagtag > 2:23973/1‑150 (MQ=255) gCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAgg < 1:388526/150‑1 (MQ=255) gCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAgg > 2:1119495/1‑150 (MQ=255) tCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTc > 1:758651/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCAcc > 2:1032248/1‑150 (MQ=255) gATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCtgt < 1:1032248/150‑1 (MQ=255) tCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg < 1:1119495/150‑1 (MQ=255) tCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg > 1:1221220/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATc < 2:1246833/43‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATc > 1:1246833/1‑43 (MQ=255) tGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtgc > 2:1025237/1‑150 (MQ=255) cTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCtgtg < 2:502673/133‑1 (MQ=255) cTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCtgtg > 1:502673/1‑133 (MQ=255) tCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtgctgc < 1:760126/150‑1 (MQ=255) aTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGcc > 1:361474/1‑150 (MQ=255) tAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCgcgc < 2:274085/123‑1 (MQ=255) tAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCgcgc < 2:274132/123‑1 (MQ=255) tAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCgcgc > 1:274085/1‑123 (MQ=255) tAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCgcgc > 1:274132/1‑123 (MQ=255) aCTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTgc < 1:1279773/150‑1 (MQ=255) aCTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTgc < 1:599986/150‑1 (MQ=255) ttGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGaa > 1:910527/1‑98 (MQ=255) ttGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGaa < 2:910527/98‑1 (MQ=255) tGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtgg < 1:702778/150‑1 (MQ=255) tCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtggtg > 2:349435/1‑150 (MQ=255) tCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtggtg < 2:1221220/150‑1 (MQ=255) tCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCCCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtggtg < 1:349435/150‑1 (MQ=255) aCCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACGTTGTGGAACAGGGTCTGCGCAAGGGCACTGACGTTTTCTTACTTGTCGCCGAATTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCAACCACGCACTTGGTGGCa > 1:732255/1‑150 (MQ=255) cT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCAcc < 2:361474/150‑1 (MQ=255) | GGAAGTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATC‑GAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCACC > NC_002947/3223514‑3223811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |