New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1556507 | 31 (0.630) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 11.8% | coding (369/852 nt) | purU‑II | formyltetrahydrofolate hydrolase |
? | NC_002947 | = 1556530 | 30 (0.630) | coding (392/852 nt) | purU‑II | formyltetrahydrofolate hydrolase |
TTCTCCATGACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGCA > NC_002947/1556358‑1556656 | ttCTCCATTACCTGGCGCATTACCAGCTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCAC < 1:896326‑M1/150‑1 (MQ=255) cATGACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGa > 1:559777/1‑150 (MQ=255) aTGACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGAc < 2:559777/150‑1 (MQ=255) aTGACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGAc > 1:284288/1‑150 (MQ=255) tGACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGAcc > 2:154978/1‑150 (MQ=255) ggCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCgca < 1:880284/150‑1 (MQ=255) gACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAg > 2:953071‑M2/1‑149 (MQ=255) cTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACg < 2:284288/150‑1 (MQ=255) tCAGAAAAAACGCGTGGCATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACtcgaccatgctgctcagggcgtggtggttgga > 2:852429‑M1/1‑118 (MQ=255) cAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCCCTGCCCGCCAGCTTTTCTCCACCGCTGGCACACCGATGCGCTGGACTGCGAGATCGCTTCCATTATTGCCAAGCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGt < 1:666005/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTAtt > 1:1193076/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTAtt < 1:154978/150‑1 (MQ=255) aaaaaCGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTc < 1:1237689/150‑1 (MQ=255) gcgTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGttct > 1:1153517/1‑150 (MQ=255) cgTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGttctt < 2:1153517/150‑1 (MQ=255) gTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACtcgaccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaa < 2:704603‑M1/135‑34 (MQ=255) gTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACtcgaccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaa > 1:704603‑M1/1‑102 (MQ=255) gCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTc < 2:937852/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATCGGGGAAACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACtcgaccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtcc < 1:852429‑M1/150‑58 (MQ=255) gTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCaaa > 1:774478/1‑148 (MQ=255) gTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCaaa < 2:774478/148‑1 (MQ=255) ccTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCgca > 2:251914/1‑86 (MQ=255) ccTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCgca < 1:251914/86‑1 (MQ=255) gACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCttt < 2:1193076/150‑1 (MQ=255) gACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATCAGCTGTCCGGTTTGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCttt < 2:425437/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAg < 2:625606‑M2/87‑2 (MQ=255) ttGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAg > 1:625606‑M2/1‑86 (MQ=255) gcACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGa < 1:431843/63‑1 (MQ=255) gcACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGa > 2:431843/1‑63 (MQ=255) tGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCgcgc > 2:1202443/1‑150 (MQ=255) acacCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATg < 2:652907/65‑1 (MQ=255) acacCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATg > 1:652907/1‑65 (MQ=255) acacCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTgg > 1:1139/1‑150 (MQ=255) cTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCAt < 1:1202443/150‑1 (MQ=255) ggACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtttccccgatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggc < 1:852429‑M2/150‑94 (MQ=255) gagaTCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGAc > 1:779793/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCgtg > 1:335242/1‑150 (MQ=255) gCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGGAACTTGAATTTCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGc < 2:1077824/150‑1 (MQ=255) cGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCt > 1:377300/1‑150 (MQ=255) tttCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTACGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGccc > 1:234281/1‑150 (MQ=255) ttCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaatac < 2:704603‑M2/135‑103 (MQ=255) ttCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaatac > 1:704603‑M2/1‑33 (MQ=255) tCCAACCACCACGCCCTGAGCAGCATGGTCGAgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaatgccacgcgttttttctga > 2:852429‑M2/1‑32 (MQ=255) cAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTa > 1:1064193/1‑150 (MQ=255) aaCCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTAc > 1:9351/1‑150 (MQ=255) aaCCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTAc > 1:632571/1‑150 (MQ=255) ccACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCAAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCCCGCGGGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACAt > 1:781312/1‑150 (MQ=255) ccACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCAGGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCACGCCGCCGACGTCGGGGTGCTGGCCCGCTACAt > 2:385863/1‑150 (MQ=255) acaACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGc < 2:1139/150‑1 (MQ=255) acaACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGc > 2:885163/1‑150 (MQ=255) ctcgaccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaagtctgccaggcagtgcgactcacggctggccatcaataccacgcgttttttctgagccgagtc > 2:953071‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcgaccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaa < 2:625606‑M1/87‑87 (MQ=255) ctcgaccatgctgcgcaggtcgttgtggttggaaatcacgcaagggatctcgcagtccagctcatcggtgtgccagcggtgcagcaa > 1:625606‑M1/1‑1 (MQ=255) caACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGCa < 2:234281/150‑1 (MQ=255) | TTCTCCATGACCTGGCGCATTACCGACTCGGCTCAGAAAAAACGCGTGGTATTGATGGCCAGCCGTGAGTCGCACTGCCTGGCAGACTTGCTGCACCGCTGGCACACCGATGAGCTGGACTGCGAGATCCCTTGCGTGATTTCCAACCACAACGACCTGCGCAGCATGGTCGAGTGGCACGGTATTCCGTTCTTCCATGTACCGGTCGACCCCAAAGACAAGGCCCCGGCCTTTGCCGAAGTGTCGCGCCTGGTGCAGGAGCATGCCGCCGACGTCGTGGTGCTGGCCCGCTACATGCA > NC_002947/1556358‑1556656 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |