New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2234970 = | 53 (1.080) | 5 (0.110) | 5/238 | NT | 8.4% | coding (38/2016 nt) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
? | NC_002947 | 2234999 = | 59 (1.260) | coding (67/2016 nt) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
CACCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGG > NC_002947/2234827‑2235113 | cACCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTTAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTGCTTCGTGTCCGAGTTCCAGCCCGTCCCACGGTGCCAGCCGGCTGCCgt > 2:538197/1‑149 (MQ=255) gcgcCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCGAGCTCGGCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAgg > 1:84724/1‑150 (MQ=255) gcgcCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAgg < 2:407625/150‑1 (MQ=255) ccagcaccagcgtcgggcgctgcacctgctggatgacgttggcaatgctgaaggtcttgcccgaaccggtcaccccgagcaacgtctggtgcgacagccccgcctcgatgccttcgaccaaCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAg > 2:868042‑M1/122‑150 (MQ=255) cagcaccagcgtcgggcgctgcacctgctggatgacgttggcaatgctgaaggtcttgcccgaaccggtcaccccgagcaacgtctggtgcgacagccccgcctcgatgccttcgaccaaCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGt < 1:393115‑M1/30‑1 (MQ=255) ttGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTc > 1:202640/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGaa > 2:902024/1‑150 (MQ=255) aGCGCCCCCGATCGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAgg < 1:449917/150‑1 (MQ=255) gggCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgggg < 1:538197/150‑1 (MQ=255) gcgcATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCt > 2:1235663/1‑150 (MQ=255) tGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCAc < 2:917046/150‑1 (MQ=255) taGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACg > 2:644627/1‑150 (MQ=255) taGACTACAGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACg > 1:754876/1‑150 (MQ=255) gACTACTGGCTAAATTTACCGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGtt > 2:656151/1‑150 (MQ=255) gACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGtt < 1:469322/150‑1 (MQ=255) gACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGACTGTCGCACCAGACGtt > 1:279745/1‑150 (MQ=255) tactGGATAAATTTACAGCTACTTCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCt > 2:955105/1‑150 (MQ=255) ctGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCg < 1:1235663/150‑1 (MQ=255) aaTTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGTTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGAc < 2:754876/150‑1 (MQ=255) aaTTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGAc > 2:613675/1‑150 (MQ=255) tttACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCg > 2:572580/1‑150 (MQ=255) tttACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCg > 2:962387/1‑150 (MQ=255) ccgaaccggtcaccccgagcaacgtctggtgcgacagccccgcctcgatgccttcgaccaaCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGt < 2:637034‑M1/34‑1 (MQ=255) ccgaaccggtcaccccgagcaacgtctggtgcgacagccccgcctcgatgccttcgaccaaCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGt > 1:637034‑M1/62‑95 (MQ=255) aGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCg > 1:737064/1‑150 (MQ=255) ctgcACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCaa < 2:737064/150‑1 (MQ=255) gcACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGa > 2:812340/1‑150 (MQ=255) cACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGAc < 1:656151/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTc < 2:871570/86‑1 (MQ=255) ccGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTc > 1:871570/1‑86 (MQ=255) ccGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCt > 2:957148/1‑150 (MQ=255) cgAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCa < 1:340381/150‑1 (MQ=255) tCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCAtt < 1:902024/150‑1 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGTCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGCGGGGGGGCTGTCGCGCCAGACGTTGCTCGGAGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGAATTgg > 1:343105/1‑149 (MQ=255) cATGTACGAGTTCCAGCTGGTCACCCTTTTCCAGACGGGTGGCGACCAGTC‑CGAGGCGATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCac < 2:279745/150‑2 (MQ=255) aTGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAAc < 1:1203321/150‑1 (MQ=255) tCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCggg < 1:1078274/125‑1 (MQ=255) tCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCggg > 2:1078274/1‑125 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGTGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCAt > 1:1138020/1‑150 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGaa > 1:365025/1‑70 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGaa < 2:365025/70‑1 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCaa > 2:1248572/1‑144 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCaa < 1:1248572/144‑1 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCAt > 1:246450/1‑150 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCAt > 1:213708/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCcagc < 1:955105/150‑1 (MQ=255) gCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGt < 1:644627/150‑1 (MQ=255) ccgcctcgatgccttcgaccaaCTGGCGGATAGCCTCG‑GGCTGGTCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTg < 2:393115‑M1/128‑1 (MQ=255) tCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAgc < 2:202640/150‑1 (MQ=255) acacGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAgcgc > 1:491951/1‑150 (MQ=255) cacGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGcc > 1:876880/1‑150 (MQ=255) cacGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGAACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAgg < 2:1275466/141‑1 (MQ=255) cacGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGAACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAgg > 1:1275466/1‑141 (MQ=255) acGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCTAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGccc > 2:181072/1‑150 (MQ=255) acGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGccc > 1:1116568/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGCTGGTGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTg < 2:1138020/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTg < 2:213708/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTgg > 1:1152904/1‑150 (MQ=255) | CACCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCC‑CGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGG > NC_002947/2234827‑2235113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |