New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3142930 = | 29 (0.590) | 4 (0.090) | 3/230 | NT | 12.0% | coding (836/1029 nt) | PP_2758 | ribose ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 3142976 = | 32 (0.710) | coding (882/1029 nt) | PP_2758 | ribose ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CTTGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGA > NC_002947/3142781‑3143073 | cTTGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAAtt > 2:835585/1‑150 (MQ=255) tGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATtgc < 2:36630/150‑1 (MQ=255) tCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATtgctgc > 2:520660/1‑150 (MQ=255) ccccAAAGGTGGGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCTAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccgg > 1:943720/1‑150 (MQ=255) ccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggca < 1:262375/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggca < 2:795311/150‑1 (MQ=255) cAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATtgc < 2:380481/134‑1 (MQ=255) cAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATtgc > 1:380481/1‑134 (MQ=255) tGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGt < 1:334704/150‑1 (MQ=255) gATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAgtggt < 1:361456/150‑1 (MQ=255) gcggcCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCGAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCGCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCgcag < 2:1248875/150‑1 (MQ=255) cTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGcc > 2:1123755/1‑150 (MQ=255) tCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGtt < 1:520660/150‑1 (MQ=255) tCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGtt < 1:835585/150‑1 (MQ=255) gCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGAt < 1:923804/150‑1 (MQ=255) tGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCa > 2:27085/1‑98 (MQ=255) tGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCa < 1:27085/98‑1 (MQ=255) gCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCg < 1:940536/150‑1 (MQ=255) aaTGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCgcg > 2:1147493/1‑148 (MQ=255) aaTGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGc > 1:558873/1‑150 (MQ=255) aaTGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGc > 2:1153736/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCg > 2:1219614/1‑150 (MQ=255) gCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCg > 2:1079751/1‑150 (MQ=255) aCGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCt < 1:1153736/150‑1 (MQ=255) ggTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtc < 1:193048/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtcgtc < 2:943720/150‑1 (MQ=255) cccGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgag > 2:370460/1‑150 (MQ=255) cccGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgag > 1:1253008/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgaga < 2:142828/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGAccc < 2:1253008/150‑1 (MQ=255) tGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCctgctg > 1:693491/1‑149 (MQ=255) tGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCctgctg < 2:693491/149‑1 (MQ=255) tGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGa > 1:181960/1‑150 (MQ=255) gAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgaga > 2:386208/1‑139 (MQ=255) gAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgaga < 1:386208/139‑1 (MQ=255) | CTTGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGA > NC_002947/3142781‑3143073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |