New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5735744 | 51 (1.040) | 5 (0.110) | 5/240 | NT | 8.9% | intergenic (‑25/+84) | hutH/hutU | histidine ammonia‑lyase/urocanate hydratase |
? | NC_002947 | = 5735771 | 53 (1.130) | intergenic (‑52/+57) | hutH/hutU | histidine ammonia‑lyase/urocanate hydratase |
CGCTGGCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCAGGTCCAGGCCCTGCTCCTTGGCGCAGTCGATGGCGATGTCATAAC > NC_002947/5735602‑5735892 | cGCTGGCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑c < 1:945830/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑cc > 2:362824/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑cc < 1:454049/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGGGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGGAGG‑‑CCCg > 1:367668/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGc < 1:445714/150‑1 (MQ=255) cGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCtt < 2:1013381/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTtg > 1:169487/1‑150 (MQ=255) cGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTtgtg < 2:209442/150‑1 (MQ=255) gATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTgg < 1:362824/150‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTgcgc < 2:1060694/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCgctc > 1:983147‑M2/1‑146 (MQ=255) cgcTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCgctc > 1:915929‑M2/1‑146 (MQ=255) tGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCgcgcaggtacccacaagcgggcctgcggctccac < 1:101778‑M1/150‑35 (MQ=255) tGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCctt > 2:809499/1‑150 (MQ=255) ggCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCcttc < 1:810250/150‑1 (MQ=255) cATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCcttctt < 2:676327/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCgcgcaggtacccacaagcgggcctgcggctccacgcga < 1:735345‑M1/150‑39 (MQ=255) aTCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCttg > 2:482457/1‑150 (MQ=255) aTCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCttg < 1:809499/150‑1 (MQ=255) ccAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCttgtt < 2:483617/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTgttgtt < 1:1130918/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTc > 2:294876/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGGTACCCACAAGCGGG‑‑CCTGCGctccacgcgatttggagta > 1:528965‑M2/1‑131 (MQ=255) gCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAg > 2:1158805/1‑150 (MQ=255) gcACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCAc < 1:294876/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCATGGATAGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCgcgcaggtacccacaagcgggcctgcggctccacg > 1:1107145‑M1/1‑92 (MQ=255) gcgcGGCATGGATAGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCgcgcaggtacccacaagcgggcctgcggctccacg < 2:1107145‑M1/127‑36 (MQ=255) cATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGt < 2:367668/150‑1 (MQ=255) gATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGa < 1:200695/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGCGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCCGCGAGCTCCTTCTTTTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATc < 1:731141/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATc > 1:341469/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCaaa < 1:951263/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGCTACGTTCCTGGTTCAAATCGCGTGGAGCCGACGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCgt < 1:927430/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCgtgg < 1:1286100/150‑1 (MQ=255) tGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCgtggt < 1:819026/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGa < 1:397319/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGAt > 2:443433/1‑135 (MQ=255) gCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGAt < 1:443433/135‑1 (MQ=255) ggtcagggtGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTAAGGATACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATAAGcc > 1:155715/1‑150 (MQ=255) caggctGCCAGTCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGt < 2:274003/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGatcat < 2:341469/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGATACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGatcatc > 1:646327/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCTGCCGGTGACCATCg > 1:62241/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTgttgtt > 2:932908/1‑90 (MQ=255) gCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTgttgtt < 1:932908/90‑1 (MQ=255) gCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCa > 1:1212070/1‑150 (MQ=255) aCGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCAGGTCCAGGCCCTGCTCCTTg < 1:1280360/150‑1 (MQ=255) actactCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCAGGTCCAGGCCCTGCTCCTTGGCGCa < 2:169487/150‑1 (MQ=255) tactCCAAATCGCGTGGAGCcgcaggcccgcttgtgggtacctgcggctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgcgatccatgccgcgcccgtgcgcctgc > 1:528965‑M1/1‑20 (MQ=255) tactCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATc > 1:531319/1‑105 (MQ=255) tactCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATc < 2:531319/105‑1 (MQ=255) cgccAAATGGCGTGGAGCCGGAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGATCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACACCTTGCAGGAGGCGATCTAATGGGTGGTAATGATACAGGGATCATCGGCATGTACAGGTCCGGCTCATGGGCGTAGTcc > 2:145481/3‑149 (MQ=255) tCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCAcccc < 2:554718/72‑1 (MQ=255) tCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCAcccc > 1:554718/1‑72 (MQ=255) cAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCgtg < 1:744505/94‑1 (MQ=255) cAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCgtg > 2:744505/1‑94 (MQ=255) aaaTCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGa < 2:795480/82‑1 (MQ=255) aaaTCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGa > 1:795480/1‑82 (MQ=255) tCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCgctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgcgatccatgccgcgcccgtgcgcctgcaactggat < 1:735345‑M2/150‑113 (MQ=255) cgTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCgctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgctatccatgccgcgc < 2:1107145‑M2/127‑93 (MQ=255) cgTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCgctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgctatccatgccgcgc > 1:1107145‑M2/1‑35 (MQ=255) cgTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCAGGTCCAGGCCCTGCTCCTTGGCGCAGTCGATGGCGATGt < 1:482457/150‑1 (MQ=255) gTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCgctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgcgatccatgccgcgcccgtgcgcctgcaactggatgcca < 1:101778‑M2/150‑117 (MQ=255) gAGCgcgcaggtacccacaagcgggcctgcggctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgcgatccatgccgcgcccgtgcgcctgcaactggatgccagcg > 1:915929‑M1/1‑4 (MQ=255) gAGCgcgcaggtacccacaagcgggcctgcggctccacgcgatttggagtagtaacgtgaccgaactcaccctcaagcctggcaccctgaccctggcccagctgcgcgcgatccatgccgcgcccgtgcgcctgcaactggatgccagcg > 1:983147‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGATACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCAGGTCCAGGCCCTGCTCCTTGGCGCAGTCGATGGCGATGTCATAAc < 2:646327/150‑1 (MQ=255) | CGCTGGCGTCGATGGCCGGTGCGGCGCTGGCATCCAGTTGCAGGCGCACGGGCGCGGCATGGATCGCGCGCAGCTGGGCCAGGGTCAGGGTGCCAGGCTTGAGGGTGAGTTCGGTCACGTTACTACTCCAAATCGCGTGGAGCCGCAGG‑‑CCCGCTTGTGGGTACCTGCGCGCTCCTTCTTGTTGTTCAGTATCACCCCTTGCAGGGTGCGATCCAAAGCGTGGTGATCAGCCGGTGATCATCGGCAGGTCCAGGCCCTGCTCCTTGGCGCAGTCGATGGCGATGTCATAAC > NC_002947/5735602‑5735892 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |