New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1000644 | 48 (0.980) | 7 (0.150) | 7/238 | NT | 13.4% | coding (302/681 nt) | PP_0862 | PKHD‑type hydroxylase |
? | NC_002947 | = 1000655 | 45 (0.960) | coding (313/681 nt) | PP_0862 | PKHD‑type hydroxylase |
ATCGGCACTGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCTGTACCC > NC_002947/1000508‑1000803 | aTCGGCACTGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCATAAGGTGTGCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAag > 1:1185064‑M2/1‑148 (MQ=255) cGGCACTGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGACAGCCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAaggg > 1:655874‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGcc < 1:517309/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAag > 2:1280459‑M2/1‑140 (MQ=255) tGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAag < 1:1280459‑M2/142‑3 (MQ=255) cTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAg < 2:528513/150‑1 (MQ=255) gATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCg < 1:788128/150‑1 (MQ=255) aTCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATTCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCgg < 1:1266151/150‑1 (MQ=255) aTCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCgg < 2:5398/150‑1 (MQ=255) tCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCggg > 1:1083516/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAaggg > 2:161803‑M2/1‑129 (MQ=255) aCCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAaggg < 1:161803‑M2/133‑5 (MQ=255) ccTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGCGCAGCTCGGAGCGGGTGCGTAc < 2:327790/150‑1 (MQ=255) tgGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGAc > 1:109971/1‑150 (MQ=255) gAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAACCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCt > 1:304384/1‑150 (MQ=255) aGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGt < 2:1083516/150‑1 (MQ=255) cccGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTc > 2:484439/1‑150 (MQ=255) ttCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTg < 2:1041150/150‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTCTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTc > 1:440321/1‑148 (MQ=255) gTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTCTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTc < 2:440321/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCa < 1:1273086/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAg < 2:1220295/150‑1 (MQ=255) gCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCa < 1:899645/137‑1 (MQ=255) gCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCa > 2:899645/1‑137 (MQ=255) gCACAAGGTGTTCCCCCCGCTGATCAACTGCGACAGCGATGGCGGCAACTTTGGTGTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAg > 2:656596/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTacga > 2:753970/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTacga > 2:1263814/1‑150 (MQ=255) gtgtTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACGTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCCAGGGCAGCCCGGAGCGCGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCCGCGACCCGCCAAGCTacgac > 2:205526/1‑150 (MQ=255) ccgccgCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAGGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGt < 1:1047968/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTacg > 1:1260061/1‑142 (MQ=255) ccgccgCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTacg < 2:1260061/142‑1 (MQ=255) ccgccgCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGAcggcg > 1:1036981/1‑148 (MQ=255) ccgccgCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGAcggcg < 2:1036981/148‑1 (MQ=255) gcTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCt > 2:222900/1‑150 (MQ=255) gATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCAACTGTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGt > 1:461966/1‑150 (MQ=255) aTCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTg > 2:698447/1‑150 (MQ=255) tCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGa > 2:1025029/1‑150 (MQ=255) cTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCa < 1:1025029/150‑1 (MQ=255) cgcgATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACAcc > 1:610006/1‑150 (MQ=255) cgATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTa > 1:885120/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATg > 2:405828/1‑150 (MQ=255) ggcggcAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGc < 2:992122/150‑1 (MQ=255) cggcAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGt < 1:10539/150‑1 (MQ=255) ttCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTGCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGcagcaggtcgag < 2:304384/150‑7 (MQ=255) tCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGc > 1:1064534/1‑150 (MQ=255) aTCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacaccttgtgcggcaaggctgccgacatgaagcgcggggtcttccacaggcggtcgatcag < 2:131313‑M2/150‑126 (MQ=255) tCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTgca > 1:923328/1‑133 (MQ=255) tCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTCTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTgca < 2:923328/133‑1 (MQ=255) aCAATGCCCTGCGCCATCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacacc > 1:477376‑M2/1‑21 (MQ=255) aCAATGCCCTGCGCCAGCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacacc < 2:477376‑M2/90‑70 (MQ=255) aCAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGccgccg < 2:1064534/150‑1 (MQ=255) cAATGCCCTGCGCCAGCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacacctt < 2:827201‑M2/91‑72 (MQ=255) cAATGCCCTGCGCCAGCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacacctt > 1:827201‑M2/1‑20 (MQ=255) tGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGa < 1:484439/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacaccttgtgcggcaaggctgccgacatgaagcgcggggtcttccacaggcggtcgatcagcgcagtgccga < 2:407656‑M2/150‑137 (MQ=255) cTGCGCCAGCCCAagggcattgtcgatgtggaaaccaaagttgccgccatcgcggtagcagttgatcagcggcgggaacaccttgtgcggcaaggctgccgacatgaagcgcggggtcttccacaggcggtcgatcagcgcagtgccgat > 1:407656‑M2/1‑13 (MQ=255) ccAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGCTCGCGACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCt < 1:222900/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCt < 1:820127/150‑1 (MQ=255) cAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGCCCTCTTTGAAAAACATCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCTg > 1:926004/1‑150 (MQ=255) ccAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCTGTAcc > 2:669106/1‑150 (MQ=255) ccAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCTGTAcc > 2:834996/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCTGTAccc > 2:441527/1‑150 (MQ=255) | ATCGGCACTGCGCTGATCGACCGCCTGTGGAAGACCCCGCGCTTCATGTCGGCAGCCTTGCCGCACAAGGTGTTCCCGCCGCTGATCAACTGCTACCGCGATGGCGGCAACTTTGGTTTCCACATCGACAATGCCCTGCGCCAGCCCAAGGGCAGCCCGGAGCGGGTGCGTACCGACCTGTCTTCCACGCTGTTCCTCAGCGACCCGGAAAGCTACGACGGCGGTGAGCTGGTGATCCAGGACACCTATGGCGTGCAGCAGATCAAGCTGGCCGCCGGTGACATGGTGCTGTACCC > NC_002947/1000508‑1000803 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |