New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3387448 | 48 (0.980) | 5 (0.110) | 5/234 | NT | 9.4% | coding (186/795 nt) | PP_2989 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 3387482 | 52 (1.130) | coding (220/795 nt) | PP_2989 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
TCGCCCGTCGTGGCCACGATCTCATCCTTGTGGCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCGCTGCTGCA > NC_002947/3387333‑3387628 | tCGCCCGTCGTGGCCACGATCTCATCCTTGTGGCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGaaa < 2:708126/150‑1 (MQ=255) cACGATCTCATCCTTGTGGCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGcgac > 1:503109/1‑150 (MQ=255) cATCCTTGTGGCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTCTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCaa > 1:206156/1‑150 (MQ=255) ttGTGGCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCg > 1:21380/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCgt < 2:503109/150‑1 (MQ=255) gcgcgACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGtt > 1:753558/1‑150 (MQ=255) gACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATc < 2:968244/150‑1 (MQ=255) acacATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCCTAAAATGCGGCGGCGCGACGACGCGAATATCGGCGTGTTGATca > 2:280546/1‑150 (MQ=255) gcgcATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAAcgc < 1:704731/150‑1 (MQ=255) cgcATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAAcgcg < 1:365518/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTAt < 2:1068969/150‑1 (MQ=255) cTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATcaa < 2:284065/131‑1 (MQ=255) cTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATcaa > 1:284065/1‑131 (MQ=255) cATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCgtgt < 2:985860/120‑1 (MQ=255) cATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCgtgt > 1:985860/1‑120 (MQ=255) ttACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGggt > 2:1235358/1‑150 (MQ=255) tCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGggt < 2:1187544/145‑1 (MQ=255) tCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGggt > 1:1187544/1‑145 (MQ=255) cgcgAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTg > 2:820213/1‑150 (MQ=255) cgAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGa < 2:21380/150‑1 (MQ=255) cgAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGa < 1:1006158/150‑1 (MQ=255) aGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGAcc > 2:68580/1‑150 (MQ=255) aTGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTg > 2:495690/1‑150 (MQ=255) tgtgGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGa < 1:1235358/150‑1 (MQ=255) gTTGAGGTGCTGCCAGCCGATCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCgg > 1:100561/1‑103 (MQ=255) gTTGAGGTGCTGCCAGCCGATCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCgg < 2:100561/103‑1 (MQ=255) tGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAATTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGa < 1:726679/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGggt > 2:10578/1‑108 (MQ=255) ccAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGggt < 1:10578/108‑1 (MQ=255) ccAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTg > 1:1045175/1‑130 (MQ=255) ccAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTg < 2:1045175/130‑1 (MQ=255) ggCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAGAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGGCCGCTGAAGCTATTGGGCGCCTTGTCAc > 2:321755/2‑150 (MQ=255) aGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGTCAggtcggctggcagcacctcaacggccacatggctttcctcgcgcagacgtaatgcaagcgcctccatgcgcgatgtgtcgcgcgccacaaggatgagatcgtggccacg < 1:420655‑M2/150‑110 (MQ=255) aGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCAc > 2:950876/1‑150 (MQ=255) gCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAgtcggctggcagcacctcaacggccacatggctttcctcgcgcagacgtaatgcaagcgcctccatgcgcgatgtgtcgcgcgccacaaggatgagatcgtggccacgac < 1:1056122‑M2/150‑111 (MQ=255) gCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACg > 1:1061626/1‑150 (MQ=255) tGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGTCAggtcggctggcagcacctcaacggccacatggctttcctcgcgcagacgtaatgcaagcgcctccatgcgcgatgtgtcgcgcgccacaaggatgagatcgtggccacgacgggcga > 2:420655‑M2/1‑33 (MQ=255) aCAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAgtcggctggcagcacctcaacggccacatggctttcctcgcgcagacgtaatgcaagcgcctccatgcgcgatgtgtcgcgcgccacaaggat < 1:25811‑M2/124‑94 (MQ=255) aCAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAgtcggctggcagcacctcaacggccacatggctttcctcgcgcagacgtaatgcaagcgcctccatgcgcgatgtgtcgcgcgccacaaggat > 2:25811‑M2/1‑31 (MQ=255) aaGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGGCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTAc > 1:211322/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACCACGCTGGTATGGCGTTACGGGTTTGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTCCcg > 2:39510/1‑150 (MQ=255) cTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCACATGCAGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGAGCTGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACcgc > 1:997112/1‑150 (MQ=255) cTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACcgc < 1:68580/150‑1 (MQ=255) gCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTg > 2:1168987/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGAc < 1:1147909/93‑1 (MQ=255) cTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGAc < 1:1148273/93‑1 (MQ=255) cTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGAc > 2:1148273/1‑93 (MQ=255) cTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGAc > 2:1147909/1‑93 (MQ=255) cTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCgg < 1:495690/150‑1 (MQ=255) cTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCgg < 1:950876/150‑1 (MQ=255) gTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCt > 1:1274551/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCg > 2:923953/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCg > 2:923963/1‑150 (MQ=255) cGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATc < 1:895908/49‑1 (MQ=255) cGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATc > 2:895908/1‑49 (MQ=255) cTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCgctgct < 1:923953/150‑1 (MQ=255) cTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCgctgct < 1:923963/150‑1 (MQ=255) ttGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCGctgctg > 2:291702/1‑150 (MQ=255) gAAAGTCGGCTGCGCGACGAAGCCACAATCAGCGTGTTGATCAACAAAACGAGTATGTCCCAAACGGGGGGGTGCTTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCGCTGCTGCa > 2:787931/1‑150 (MQ=255) | TCGCCCGTCGTGGCCACGATCTCATCCTTGTGGCGCGCGACACATCGCGCATGGAGGCGCTTGCATTACGTCTGCGCGAGGAAAGCCATGTGGCCGTTGAGGTGCTGCCAGCCGACCTGACAAGCTCGGCAGACCTGTCCGTGCTTGAAAGTCGGCTGCGCGACGACGCCAATATCGGCGTGTTGATCAACAACGCGGGTATGGCCCAATCGGGTGGTTTCCTGGACCAGTCCGCTGAAGCTATTGAGCGCCTTGTCACGCTCAACACTACCGCGCTGACGCGGCTCGCTGCTGCA > NC_002947/3387333‑3387628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |