Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 27,581 | C→T | 6.2% | intergenic (‑428/+18) | PP_0022 ← / ← PP_0023 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 27,581 | 0 | C | T | 6.2% | 187.3 / 2.1 | 66 | intergenic (‑428/+18) | PP_0022/PP_0023 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/33); new base T (2/2); total (31/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
CTCGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCATG > NC_002947/27439‑27728 | ctcGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACCGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAgc < 1:268260/150‑1 (MQ=255) tcgtcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAgctgct > 1:40362/1‑150 (MQ=255) gtcCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCttt > 1:9359/1‑150 (MQ=255) cccGCCCTGAAGCGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCtttt < 2:1055635/149‑1 (MQ=255) cGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCtttttt < 1:586937/150‑1 (MQ=255) cACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCt < 1:37402/150‑1 (MQ=255) gATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTccccc < 1:521658/150‑1 (MQ=255) cGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGagag > 1:1204009/1‑123 (MQ=255) cGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGagag < 2:1204009/123‑1 (MQ=255) gATCCGGAGGGAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTtgt < 1:127182/150‑1 (MQ=255) ggAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTtg > 2:733840/1‑150 (MQ=255) cTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCgag < 1:274635/107‑1 (MQ=255) cTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCgag > 2:274635/1‑107 (MQ=255) cTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGttt < 1:438088/150‑1 (MQ=255) tCAGAACCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTNCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCa < 1:657909/150‑1 (MQ=255) cAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAg > 1:285184/1‑150 (MQ=255) gAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGt > 1:748968/1‑150 (MQ=255) aaTCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTc > 1:106788/1‑150 (MQ=255) aTCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTcc < 2:135288/150‑1 (MQ=255) aTCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTcc > 1:135288/1‑150 (MQ=255) ccaagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGGGCTGCtttt > 1:660705/1‑100 (MQ=255) ccaagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCTCGGGCGCTGCtttt < 2:660705/100‑1 (MQ=255) ccaagcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCt > 2:1140691/1‑150 (MQ=255) agcGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCt < 2:106788/150‑1 (MQ=255) aaGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTccccc > 2:221173/1‑105 (MQ=255) aaGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTccccc < 1:221173/105‑1 (MQ=255) cTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAg < 2:748968/150‑1 (MQ=255) acgacgCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgggg > 1:699062/1‑150 (MQ=255) acgacgCGGGCCGATTGATCAGCGAGCCGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCCGCTCGCGAGATGTGCAGTTTTCTTACTCCGCCTTTTTGTGCTTGGGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCGTTGGCTTTTCAgggg > 2:562954/1‑150 (MQ=255) gcgGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACt > 2:54970/1‑150 (MQ=255) tCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCt > 1:1065816/1‑150 (MQ=255) cGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTAAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGc > 2:37873/1‑150 (MQ=255) gATCAGCGAGACGGTCGGGAGGGTTTGCAAACAGACCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTCCTTACTCCCCCTTTTTGTTCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCtttt < 2:40362/150‑1 (MQ=255) aTCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTc > 1:6331/1‑128 (MQ=255) aTCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTc < 2:6331/128‑1 (MQ=255) aTCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTg > 2:1015543/1‑150 (MQ=255) aGCGAGACTGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTcc < 1:54970/150‑1 (MQ=255) aGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCACTTGAAGGGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTcc > 1:1044162/1‑150 (MQ=255) gCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCg > 1:649585/1‑150 (MQ=255) gaCGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGt > 2:981811/1‑150 (MQ=255) gaCGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTAAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGt < 1:37873/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGcc > 1:1114742/1‑150 (MQ=255) tGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCTGAGTGCCATCtt > 1:264243/1‑150 (MQ=255) gAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTc < 2:285184/150‑1 (MQ=255) aGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTc > 2:423099/1‑89 (MQ=255) aGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTc < 1:423099/89‑1 (MQ=255) gggTTTGCACACAGCCAC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCAt < 2:9359/150‑1 (MQ=255) gTTTGCACACAGCCCCAAAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCAtt > 2:653423/1‑150 (MQ=255) gTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTg < 2:1065816/150‑1 (MQ=255) gCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTgg < 2:264243/150‑1 (MQ=255) gCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTgg < 1:555543/150‑1 (MQ=255) ccc‑AAAAAAACAGCAGCTCCCGCGAGCTGCTTTTTGCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTACAGGTCCGGATGGTCCTTCGGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTCCCCTCTTCATTGGTGCGCTTTGGGc < 1:562954/150‑1 (MQ=255) ccc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTTTTTTTTTTGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTTAGGGGTGACTCTCTGCCTTTTGTTCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTTGGc > 2:122831/1‑150 (MQ=255) cc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgggg < 1:759550/98‑1 (MQ=255) cc‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAgggg > 2:759550/1‑98 (MQ=255) c‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCt < 1:1140691/150‑1 (MQ=255) c‑AAAAAAAAAGAAGCTCACGAGAGCTGCTGGTTTGTTACTCGACCTTGTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCGGGATGGTCTTTCTGCTTTTAAGGGGTGACGAGGTACCTTTTGTCCGGAGTGCTATCTTCATTGTTGCGGTTTTGGCCt > 2:413951/1‑150 (MQ=255) aaaaaaaGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGc < 2:514998/150‑1 (MQ=255) aaaaGCAGCTCTCGGGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg > 1:69529/1‑90 (MQ=255) aaaaGCAGCTCTCGGGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAggg < 2:69529/90‑1 (MQ=255) aaaaGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTg > 1:749761/1‑150 (MQ=255) agcagcTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATg < 2:699062/150‑1 (MQ=255) agcagcTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTGTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATg < 1:122831/150‑1 (MQ=255) agcTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTc < 1:733840/150‑1 (MQ=255) cTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCAt < 1:981811/150‑1 (MQ=255) tCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCATg < 2:1044162/150‑1 (MQ=255) | CTCGTCGTCCGCACTGAAGGGATAACCGATCCGGAGGTAGCTTCAGAATCCATCAAGCCAAGCGGAAGACTCACGACGCGGTCCGATTGATCAGCGAGACGGTCGTGAGGGTTTGCACACAGCCCC‑AAAAAAAAAGCAGCTCCCGAGAGCTGCTTTTTTCTTACTCCCCCTTTTTGTGCTTGTGGGGTTTCAGGTCCGGATGGTCCTTCTGCTTTTCAGGGGTGACTCGCTGCCTTTTGTCCGGAGTGCCATCTTCATTGGTGCGCTTTGGGCCTGGCTTGATGCTCATG > NC_002947/27439‑27728 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |