Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,158,088 | G→A | 7.6% | R132H (CGT→CAT) | fabG → | 3‑oxoacyl‑ACP reductase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,158,088 | 0 | G | A | 7.6% | 138.8 / 2.8 | 53 | R132H (CGT→CAT) | fabG | 3‑oxoacyl‑ACP reductase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/21); new base A (2/2); total (30/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.55e-01 |
GGCCATCTTGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATCACCGTCAACTCGG > NC_002947/2157942‑2158237 | ggCCATCTTGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTg < 2:481028/150‑1 (MQ=255) cATCTTGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCGACCTGAACAGCCTCTATCGTCTGTCCAGAGTCGTGCCGCGTGGCATGACCAAGACGCGGCgggg > 2:280309/1‑150 (MQ=255) cATCTTGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTgggg > 1:64235/1‑150 (MQ=255) ttGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGt > 2:170327/1‑150 (MQ=255) tGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTa < 1:916837/150‑1 (MQ=255) tCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTatca < 2:666438/150‑1 (MQ=255) aacaaTGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTatcatc > 1:1118607/1‑150 (MQ=255) caaTGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGCAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGTGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGACGTATCATCAg > 1:1225573/1‑150 (MQ=255) tATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTc < 1:280309/150‑1 (MQ=255) cccGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCg > 2:401013/1‑150 (MQ=255) ccGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTggg < 2:868936/122‑1 (MQ=255) ccGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTggg > 1:868936/1‑122 (MQ=255) ccGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGt > 1:240704/1‑150 (MQ=255) gcgACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTg > 2:551488/1‑150 (MQ=255) ccTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCAt > 1:924983/1‑150 (MQ=255) ccTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCAt > 2:894838/1‑150 (MQ=255) tCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATgg < 2:9732/150‑1 (MQ=255) tCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATgg < 1:170327/150‑1 (MQ=255) gacgaGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCTTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGTCTCGGTCGTTGTTGCCATGGTTAACTCAGGTCAGGCCAAc > 2:269973/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTatcatc < 1:271502/96‑1 (MQ=255) tGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTatcatc > 2:271502/1‑96 (MQ=255) tttGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCt > 1:132709/1‑150 (MQ=255) tCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAgg > 1:741807/1‑150 (MQ=255) tCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGTGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCg < 2:1225573/150‑1 (MQ=255) gACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGt < 2:924983/150‑1 (MQ=255) gACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGt < 2:741807/150‑1 (MQ=255) acCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTg > 2:800330/1‑150 (MQ=255) aaCCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGaa > 1:1082956/1‑150 (MQ=255) aCCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAg < 2:1118607/150‑1 (MQ=255) aCCTGAACAGCCTCAACCGTCTGCCCAAGCGCGTGCTGAGTGGCATGACGAAGCCGCGTTGCGGTCGTATGATCAGCCGCGGTCAGGTCGGTGGTGCAACGGGTAACGCAGGTCAAGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCAGTCTGGAAg < 2:240704/150‑1 (MQ=255) ccTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAgg < 1:405859/150‑1 (MQ=255) ccTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGGCGGTTGCAGCcg > 2:732719/1‑150 (MQ=255) tctACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCcgcg > 1:712615/1‑150 (MQ=255) tACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGcc > 2:1256095/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGc > 2:1199489/1‑107 (MQ=255) aaGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGc < 1:1199489/107‑1 (MQ=255) aaGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGaa > 2:151985/1‑150 (MQ=255) gCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTgg < 1:401013/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTgg < 2:712615/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGt > 2:569192/1‑150 (MQ=255) tgcGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTg > 1:680639/1‑57 (MQ=255) tgcGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTg < 2:680639/57‑1 (MQ=255) tgcGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTcgc > 1:340036/1‑150 (MQ=255) gTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTg < 2:1082956/150‑1 (MQ=255) aTGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATc > 2:1275464/1‑150 (MQ=255) aTGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATc > 1:934854/1‑150 (MQ=255) aTGACCAAGGCGCATTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCt > 2:1274050/1‑87 (MQ=255) aTGACCAAGGCGCATTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCt < 1:1274050/87‑1 (MQ=255) aTGACCAAGGCGCATTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCt < 1:1274357/87‑1 (MQ=255) aTGACCAAGGCGCATTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCt > 2:1274357/1‑87 (MQ=255) aCCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATCAcc < 1:118923/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGt > 1:482664/1‑137 (MQ=255) aGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGt < 2:482664/137‑1 (MQ=255) cgTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTCACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATCACCCTCGACTCg < 2:196370/150‑1 (MQ=255) gTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATTGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATCACCGTCAACTCgg < 2:64235/150‑1 (MQ=255) | GGCCATCTTGGTCAACAATGCCGGTATCACCCGCGACAACCTCATGCTGCGCATGAAAGACGACGAGTGGTTTGATGTCATCGACACCAACCTGAACAGCCTCTACCGTCTGTCCAAGGGCGTGCTGCGTGGCATGACCAAGGCGCGTTGGGGTCGTATCATCAGCATCGGCTCGGTCGTTGGTGCCATGGGTAACGCAGGTCAGGCCAACTACGCGGCTGCCAAGGCCGGTCTGGAAGGTTTCAGCCGCGCCCTGGCGCGTGAAGTGGGTTCGCGTGGTATCACCGTCAACTCGG > NC_002947/2157942‑2158237 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |