| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,383,246 | C→G | 5.8% | G232R (GGC→CGC) | PP_2091 ← | serine/threonine‑protein kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,383,246 | 0 | C | G | 5.8% | 197.4 / 2.3 | 62 | G232R (GGC→CGC) | PP_2091 | serine/threonine‑protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/29); new base G (2/2); total (31/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TATCGCGCACTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCGCCCAGG > NC_002947/2383099‑2383385 | atacgcgCACTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCa > 1:369534/4‑150 (MQ=255) cgcgCACTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAgtt < 1:713864/150‑1 (MQ=255) cgcAATTTGTACAGCAAGGACTGGCGCCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCGGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAgttgt > 2:690457/1‑150 (MQ=255) gcACTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAgttgtt < 1:516334/150‑1 (MQ=255) aCTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCGGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTTCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGCTGTTcc > 2:77934/1‑149 (MQ=255) cTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGa > 2:761417/1‑150 (MQ=255) aCAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑Ca > 1:983053/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CAc < 1:195121/150‑1 (MQ=255) gACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAg < 1:782815/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGgcg > 2:1193626/1‑150 (MQ=255) gcggcTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACATGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CAc > 2:890135/1‑138 (MQ=255) gcggcTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACATGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CAc < 1:890135/138‑1 (MQ=255) gcgcATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGACCCCCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTNTGCCGTNCCCAGTTGTGCGNCTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGt < 1:882154/150‑1 (MQ=255) tttCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGc < 1:532227/150‑1 (MQ=255) ttCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCt < 2:760742/150‑1 (MQ=255) cGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑GACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGa > 1:1137034/1‑150 (MQ=255) gACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTGGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAg > 1:1125019/1‑150 (MQ=255) ccTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑GACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGt < 2:1137034/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCAGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTgg < 1:269974/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTggg > 2:1168986/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTGCCACCTG‑GAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGc > 1:655030/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCCCTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCa < 2:301298/150‑1 (MQ=255) ccGTCGATCACCTGGGCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTCCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTg < 2:495258/150‑1 (MQ=255) tCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGcc > 2:523030/1‑150 (MQ=255) gATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGccac > 2:183582/1‑150 (MQ=255) tCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACGAGTAAAGCGCTCGCGGTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGccacca < 2:369534/150‑1 (MQ=255) tccTGGACTTCGCGCAGGGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAgg < 2:32296/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAgg < 1:509618/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGCCAGTGCccacct < 2:226013/147‑2 (MQ=255) ccTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGCCAGTGCccacct > 1:226013/1‑146 (MQ=255) cTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGgt < 2:1125019/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGgt > 2:1193794/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTc > 2:849447/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCGCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTcgg > 2:465878/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCGGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTcgg < 1:179484/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCAGTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTcgg > 1:1024843/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGACATCGTTGCAGTTGCGCCTGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCGCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTcgg > 2:465893/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCggcggc > 1:994248/1‑150 (MQ=255) cgggccgggcACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTg < 1:1281550/150‑1 (MQ=255) cgggcACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGt < 2:148341/150‑1 (MQ=255) cACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGt < 1:1168986/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGtt < 2:1126237/86‑1 (MQ=255) aCTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGtt > 1:1126237/1‑86 (MQ=255) cTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGttt > 1:1130285/1‑150 (MQ=255) ggCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGc < 2:348255/150‑1 (MQ=255) aTTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTcgc > 2:122970/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTc < 1:1051135/43‑1 (MQ=255) gTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTc > 2:1051135/1‑43 (MQ=255) gcgcCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCt < 1:1193794/150‑1 (MQ=255) gcCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCGGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTGGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTgg > 1:409682/1‑150 (MQ=255) gcCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTgg > 2:439434/1‑150 (MQ=255) cAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGACTTCGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGGCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGAt < 1:156662/150‑1 (MQ=255) gggTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCGCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGAtgt < 1:465878/150‑1 (MQ=255) gggTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCGCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGAtgt < 1:465893/150‑1 (MQ=255) ggTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAg < 1:154515/117‑1 (MQ=255) ggTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAg > 2:154515/1‑117 (MQ=255) tCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGt > 2:340157/1‑150 (MQ=255) cccAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCg > 1:776509/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCGc > 2:549886/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCGc > 1:329752/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCGCCCa < 1:849447/150‑1 (MQ=255) ttGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCGCCCAgg < 1:340157/150‑1 (MQ=255) | TATCGCGCACTTTGTACAGCAAGGACTGGCGGCTGTGCGCATGCAGTGTTTCGACCTGCCAGCCGTCGATCACCTGGCCTTCGCGCAGCGGGCCGGGCACTGGCCATTGTTGCAGTTGCGCCAGGGTATCGCCCAGGTTGGCCGTGCCCAGTTGTTCGACTTG‑CACCAGTAAGGCGCTGGCGTTGTCCTTGCTGCCGCTGAGGTGGGCACTGGCCACCAGGGTGTCGGCGGCCAGTTGCAGGTCAGTTTGCTCGCGCAGCACGGCCTGGATGTGCTGTTCGCCCAGG > NC_002947/2383099‑2383385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |