| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,353,340 | C→G | 5.4% | P141R (CCG→CGG) | yrpB → | 2‑nitropropane dioxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,353,340 | 0 | C | G | 5.4% | 229.6 / 2.3 | 72 | P141R (CCG→CGG) | yrpB | 2‑nitropropane dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/36); new base G (2/2); total (34/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GCAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCATGT > NC_002947/4353194‑4353489 | gCAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCa < 1:740907/150‑1 (MQ=255)gCAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCa > 2:1225179/1‑150 (MQ=255) gCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGcc < 1:230326/150‑1 (MQ=255) tgggCCTTATTTCAGAGAAGAGGGGGAGGCTTTCCCGCCGCCCACCCCGATGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCGGCAGGCCGaaat < 2:977388/147‑3 (MQ=255) ccTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAActgctg > 2:460412/1‑150 (MQ=255) cTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAg > 1:540749/1‑137 (MQ=255) cTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAg < 2:540749/137‑1 (MQ=255) ttattaCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCCCGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCa > 1:1040609/1‑150 (MQ=255) ttaCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCg > 1:1157046/1‑150 (MQ=255) aCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCggg < 2:214977/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCggg > 1:811947/1‑150 (MQ=255) gCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTaa > 2:974996/1‑150 (MQ=255) aGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGc < 1:516611/150‑1 (MQ=255) gTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGcc < 1:270028/119‑1 (MQ=255) gTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGcc > 2:270028/1‑119 (MQ=255) ccGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAg < 1:239635/116‑1 (MQ=255) ccGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAg > 2:239635/1‑116 (MQ=255) aTTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAActgc > 2:894548/1‑123 (MQ=255) aTTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAActgc < 1:894548/123‑1 (MQ=255) tttCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCaa < 2:631174/150‑1 (MQ=255) cACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGt < 2:1040609/150‑1 (MQ=255) aCGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTa > 1:266949/1‑150 (MQ=255) ggCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCTAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACt < 1:1225179/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCGGCAGGCCGaaatgga > 2:98917/1‑107 (MQ=255) ccACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCGGCAGGCCGAAatgga < 1:98917/112‑3 (MQ=255) ccACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCa > 1:697914/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCa < 2:266949/150‑1 (MQ=255) cACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAg < 1:1203122/150‑1 (MQ=255) cGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGCTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCa < 2:208987/150‑1 (MQ=255) tCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGAcc > 2:948272/1‑150 (MQ=255) aaCCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTg > 1:367444/1‑150 (MQ=255) ccGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGga < 1:790086/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAg < 2:303032/122‑1 (MQ=255) gTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAg > 1:303032/1‑122 (MQ=255) gcgcCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGgaagaa < 2:697914/150‑1 (MQ=255) cgcCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTg < 1:1126740/125‑1 (MQ=255) cgcCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTg > 2:1126740/1‑125 (MQ=255) cgcCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGaagaag < 2:1157046/150‑1 (MQ=255) gcCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGc > 1:1241946/1‑150 (MQ=255) gcCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGc > 2:433285/1‑150 (MQ=255) tCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCct > 1:416528/1‑150 (MQ=255) acgaGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCAc > 2:676578/1‑127 (MQ=255) acgaGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCAc < 1:676578/127‑1 (MQ=255) acgaGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCctggc < 1:1088465/150‑1 (MQ=255) cgaGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCctggct < 1:460412/150‑1 (MQ=255) gaGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCctggctg > 1:889030/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGa > 2:182018/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGa < 2:268555/150‑1 (MQ=255) agagCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAgc < 1:948272/150‑1 (MQ=255) ctgcctgtTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAg > 1:669636/1‑100 (MQ=255) ctgcctgtTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAg < 2:669636/100‑1 (MQ=255) tgctgGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCt > 1:893552/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgcgat > 2:457481/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgcgatg > 1:837237/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgcgatgc < 2:406438/150‑1 (MQ=255) aGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTgcgatgcgat < 1:974996/150‑1 (MQ=255) gcCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCATGCCGAACGTCTTCAGCGCGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCa > 1:353139/1‑150 (MQ=255) ccGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCggg > 1:806799/1‑55 (MQ=255) ccGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCggg < 2:806799/55‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTGCGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATggg < 2:10776/150‑1 (MQ=255) ggtgAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGa < 2:1241946/150‑1 (MQ=255) tgcgCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAg > 1:1281735/4‑150 (MQ=255) ttCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGt > 2:32029/1‑150 (MQ=255) tCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTg < 2:889030/150‑1 (MQ=255) aTTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTc < 1:204282/64‑1 (MQ=255) aTTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTc > 2:204282/1‑64 (MQ=255) tttCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCg < 1:1229165/143‑1 (MQ=255) tttCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCg > 2:1229165/1‑143 (MQ=255) gttCGGCCTGCGGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCa > 2:97456/2‑150 (MQ=255) gCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCAt < 1:866421/124‑1 (MQ=255) gCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCAt > 2:866421/1‑124 (MQ=255) ccTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCgg < 2:811947/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGc < 2:893552/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGc < 2:367444/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCATGt > 1:57884/1‑150 (MQ=255) | GCAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCATTTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCATGT > NC_002947/4353194‑4353489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |