| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,135,936 | G→C | 6.6% | L228V (CTC→GTC) | PP_4521 ← | aerotaxis receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,135,936 | 0 | G | C | 6.6% | 238.2 / 7.4 | 76 | L228V (CTC→GTC) | PP_4521 | aerotaxis receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/38); new base C (3/2); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 | |||||||||||
CTCGCTGCGCTGCCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGACTTGCCATCAG > NC_002947/5135787‑5136083 | ctctctGCGCTGCCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAg < 1:530210/150‑1 (MQ=255) tcGCTGCGCTGCCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGc < 1:1026065/150‑1 (MQ=255) cgctgcgctgCCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAACATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGCACCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCt < 1:1197166/150‑1 (MQ=255) tgcgctgcCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGc > 1:172276/1‑150 (MQ=255) cgctgcCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGCTCGACCTGGcca < 2:256721/150‑2 (MQ=255) gcCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCAGCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCa < 1:416632/150‑1 (MQ=255) ccGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAg > 1:441923/1‑150 (MQ=255) ccGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGCCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAg < 2:923983/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGc < 2:1175192/150‑1 (MQ=255) gAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTgg > 1:569037/1‑150 (MQ=255) aGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTggg < 1:110310/150‑1 (MQ=255) gCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGt > 2:716324/1‑150 (MQ=255) gCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGt > 1:980157/1‑150 (MQ=255) gcCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTgg < 2:365288/140‑1 (MQ=255) gcCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTgg > 1:365288/1‑140 (MQ=255) gcCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGt > 1:881788/1‑145 (MQ=255) gcCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGt < 2:881788/145‑1 (MQ=255) tGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAg < 1:716324/150‑1 (MQ=255) ggCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGc > 2:727546/1‑122 (MQ=255) ggCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGc < 1:727546/122‑1 (MQ=255) gCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTc > 2:764400/1‑150 (MQ=255) cATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCa > 1:892390/1‑150 (MQ=255) ggACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAgcgc < 2:132958/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGccac < 2:525481/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGccac < 2:875755/150‑1 (MQ=255) cGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACg < 2:973572/150‑1 (MQ=255) ggAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGCCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACgg > 2:236086/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTg > 2:501125/1‑150 (MQ=255) aTTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTgg < 1:764400/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGt < 1:501125/150‑1 (MQ=255) cgccgcCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTaaa < 2:980157/150‑1 (MQ=255) cccgcGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCt > 1:395013/1‑150 (MQ=255) tttACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGc > 2:446043/1‑150 (MQ=255) accccgaccccgGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGt < 1:41244/100‑1 (MQ=255) accccgaccccgGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGt > 2:41244/1‑100 (MQ=255) cgGCATCCCCCAGGCGGGTCAGGGCCGTTGGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGc < 2:252499/150‑1 (MQ=255) cgGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGTGATGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTAAGGCCTGGGTTTTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGc > 1:743617/1‑150 (MQ=255) cgGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAAAGATATTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCACCGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGc < 2:743617/150‑1 (MQ=255) tCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGcgacga > 2:8414/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGaa > 2:537764/1‑150 (MQ=255) caccaGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAAt < 1:1094106/150‑1 (MQ=255) accaGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAg > 1:1142677/1‑90 (MQ=255) accaGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAg < 2:1142677/90‑1 (MQ=255) ccaGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATgg < 1:446043/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGtt < 1:676281/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCt < 1:236086/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTg < 1:377780/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTg < 2:729051/141‑1 (MQ=255) ggCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTg > 1:729051/1‑141 (MQ=255) gCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGt < 1:769360/77‑1 (MQ=255) gCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGt > 2:769360/1‑77 (MQ=255) gCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCgg < 2:395013/150‑1 (MQ=255) ttGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTc < 2:172276/150‑1 (MQ=255) gCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGa > 1:512814/1‑150 (MQ=255) gCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGa > 1:512822/1‑150 (MQ=255) cAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGAc > 2:46320/1‑150 (MQ=255) aGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCTGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGAcc > 2:182047/1‑150 (MQ=255) cttcttCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTAcc > 2:127984/1‑150 (MQ=255) cttcttCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTAGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACg < 1:599606/75‑1 (MQ=255) cttcttCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGGCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACg > 2:599606/1‑75 (MQ=255) tcttcGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCaa < 2:569037/150‑1 (MQ=255) ttcGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTa > 1:1226221/1‑54 (MQ=255) ttcGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTa < 2:1226221/54‑1 (MQ=255) ttcGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGACAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGc > 2:1204404/1‑150 (MQ=255) cTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCcagc < 1:648053/150‑1 (MQ=255) ctgaagggCCAGCTCGACCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGc > 2:778045/7‑127 (MQ=255) ctgaagggCCAGCTCGACCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGc < 1:778045/121‑1 (MQ=255) atgGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGa < 2:441923/150‑1 (MQ=255) atgGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGATGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGa < 1:531171/150‑1 (MQ=255) agggCCAGCTCGACCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTTAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGa > 2:775196/3‑150 (MQ=255) gCCAGCTCGACCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGACtt > 1:1206929/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTGAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGACTTg > 2:503043/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAAc > 2:1056337/1‑87 (MQ=255) aGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAAc < 1:1056337/87‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGACTTGCCATCAg > 2:1001059/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCa < 2:858687/119‑1 (MQ=255) aGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCa > 1:858687/1‑119 (MQ=255) | CTCGCTGCGCTGCCGGTCGAGCATCTGCGCCTGGGCATCGGACAAGTCGGAAGATTGCGCCGCCCGCGACTTTACCCCGACCCCGGCATCCACCAGGCGGGTCAGGGCCGTTTGCAGACGGGCTTCTTCGCTGATGATGGCCAGGTCGAGCTGGCCCTTCAGGCCTGGGTTGTCGCTGTAGGTCAGCGCCACCAACGGACTGGTAAAGGCCTTGGGATGCTCAGCCAACGTGCGACGAATGGCCTGGTTCTGCCGGTGCTCGACCCAGTACCAAGCCAGCAGCAGACTTGCCATCAG > NC_002947/5135787‑5136083 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |