Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 344,683 | T→A | 7.8% | H308L (CAC→CTC) | mutY ← | A/G‑specific adenine glycosylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 344,683 | 0 | T | A | 7.8% | 180.1 / 5.2 | 63 | H308L (CAC→CTC) | mutY | A/G‑specific adenine glycosylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/30); new base A (2/3); total (30/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
CGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCA > NC_002947/344534‑344828 | cGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTGATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGt < 2:166079/150‑1 (MQ=255) gTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGACGTTATACCAGTGCCAGGCTGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGGCCGGGTCGACGTGCa > 1:926843/1‑150 (MQ=255) tCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCATCTTTTTCACCGGGGCGGTCAGGGCCAGGCGCGTCGGGGTGGCGATGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCAc < 2:220230/150‑1 (MQ=255) tCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCAc < 2:409909/150‑1 (MQ=255) tCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCAc < 1:1012648/150‑1 (MQ=255) aTCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCAAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGa < 2:747957/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACgcg > 1:1170695/1‑148 (MQ=255) ctcCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCt > 2:202375/1‑150 (MQ=255) cTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTTGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGa < 1:471121/150‑1 (MQ=255) tGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGAt > 2:1161073/1‑150 (MQ=255) gATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCTCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGc > 1:844809/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGAGCGCCAGCt > 1:984143/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGGTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGc > 2:1221635/1‑150 (MQ=255) cgcgcgTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCt < 1:96562/150‑1 (MQ=255) gcgcgTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTg > 2:519119/1‑150 (MQ=255) cgTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAg < 1:1251797/150‑1 (MQ=255) cgTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAg < 2:1170695/150‑1 (MQ=255) tCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTa < 1:1247670/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTAt < 1:835702/150‑1 (MQ=255) gcagcTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATgg < 1:501801/149‑1 (MQ=255) gcagcTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGGTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATgg > 2:501801/1‑149 (MQ=255) gcTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAg < 1:984054/106‑1 (MQ=255) gcTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAg > 2:984054/1‑106 (MQ=255) gcTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCa > 1:475985/1‑150 (MQ=255) cGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCAt < 1:1023616/150‑1 (MQ=255) gggCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCAtgg > 2:122388/1‑150 (MQ=255) gcggcgAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCAtggcg > 1:532366/1‑150 (MQ=255) cggcgAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCAtggcgt < 2:475985/150‑1 (MQ=255) cgAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCAtggcgtggc < 2:532366/150‑1 (MQ=255) cccAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGgcca < 1:813707/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAg > 1:814220/1‑116 (MQ=255) ccAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAg < 2:814220/116‑1 (MQ=255) cAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCCCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGgccagc > 2:80946/1‑150 (MQ=255) gcgcGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGaa > 1:245596/1‑111 (MQ=255) gcgcGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGaa < 2:245596/111‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGccagccag < 1:122388/150‑1 (MQ=255) ggggTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAgg < 2:1211711/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGt > 2:217378/1‑150 (MQ=255) gCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTTCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCATGCGCAGGCCGTGc < 2:1227415/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGc > 2:161999/1‑150 (MQ=255) gCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGc < 1:519119/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGc < 1:1161073/150‑1 (MQ=255) gAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTg < 2:1285961/150‑1 (MQ=255) gAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTg < 1:280012/150‑1 (MQ=255) gAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTg < 2:508629/150‑1 (MQ=255) gAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTg < 1:217378/150‑1 (MQ=255) gagCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGgtc > 1:969680/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCa > 2:179068/1‑62 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCa < 1:179068/62‑1 (MQ=255) ctcggccACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGATCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGc > 1:540357/1‑150 (MQ=255) tcGTGCACGTCGACCCGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGGCATGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcg > 2:887172/2‑150 (MQ=255) gCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGACATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCATCCa > 2:266838/1‑150 (MQ=255) acgtcGACCTGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGc < 2:367559/107‑1 (MQ=255) acgtcGACCTGGTCGGCGAGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGc > 1:367559/5‑111 (MQ=255) gCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcgtc > 2:644129/1‑144 (MQ=255) gCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATgtcgtc < 1:644129/144‑1 (MQ=255) ccGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGa < 2:251944/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGa > 1:137386/1‑150 (MQ=255) ggTCGACGTGCACGAGCCCTGGCTCGATCGCCAGCGGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCTTCTCTGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCCAGGTCGTCCAGCTCCGGGAGGc > 2:148175/1‑150 (MQ=255) gACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCca > 2:1281295/1‑150 (MQ=255) cGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAg > 2:37233/1‑106 (MQ=255) cGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAg < 1:37233/106‑1 (MQ=255) gTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCg < 2:52767/137‑1 (MQ=255) gTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCg > 1:52767/1‑137 (MQ=255) | CGGGTCATCGGGCGTCTCCTGCGATCAGTTCGTCGGCCGCGCGTTCAAGCAGCTTTTTCACCGGGGCGGCGAGGCCCAGGCGCGGCGGGGTGGCGAGGTTATACCAGAGCCAGTCGGCCTCGGCCACGTGCTCGCCGACCGGGTCGACGTGCACGAGCCATGGCTCGATCGCCAGCTGGAAGTGGCTGAAGGTATGGGTCAGGCCGTCCATGGCGTGGCGGCCAGCCAGGCGCAGGCCGTGCTGGTAGGCCAGGTCGTCGAGCTGGGCGATGTCGTCCAGCTCCGGGAGGCTCCA > NC_002947/344534‑344828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |