New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4340118 | 38 (0.610) | 17 (0.370) | 11/194 | 3.5 | 43.6% | intergenic (+59/‑272) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 4340134 | 16 (0.350) | intergenic (+75/‑256) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CTTGGCGTGGGCAAGCTGCGTCACCTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4339946‑4340118 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggccctgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGCCCCGCGTATT < NC_002947/4340134‑4339986 CTTGGCGTGGGCAAGCTGCGTCACCTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAG < 2:1299197/150‑1 CTTGGCGTGGGCAAGCTGCGTCACCCGGGGCCGACGCTGAAACACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAG < 2:877292/150‑1 TGGCGTGGGCAAGCTGCGTCACCTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGA < 1:1042094/150‑1 GGGCAAGCTGCGTCACCTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGT < 1:1043370/150‑1 CAAGCTGCGTCACCTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTA < 1:384887/150‑1 CTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTCGCGAGGCCCTGTCGGACCGGGCTGACCCGCGActtcga > 2:738885/1‑144 TGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC < 2:864850/129‑1 TGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGC > 1:864850/1‑129 AAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCC < 1:1260817/125‑1 AAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCC > 2:1260817/1‑125 ACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCA < 2:1385166/150‑1 GCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCCTCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCTCTGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG < 1:443773/150‑1 GCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAACAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG < 1:1034112/150‑1 TATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAAC > 1:101375/1‑146 TATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAAC < 2:101375/146‑1 TATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC < 1:1065114/138‑1 TATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC > 2:1065114/1‑138 TGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG < 1:323206/127‑1 TGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG > 2:323206/1‑127 GTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGG < 2:1296756/126‑1 GTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGG > 1:1296756/1‑126 CCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC > 2:585960/1‑111 CCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGC < 1:585960/111‑1 ACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC < 1:1285098/72‑1 ACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC > 2:1285098/1‑72 CCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCAGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG < 1:211853/105‑1 CCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCAGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG > 2:211853/1‑105 ATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG < 2:523133/73‑1 ATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG > 1:523133/1‑73 GAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACGCGCTTCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGCACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCccc > 2:541674/1‑147 GAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCA < 1:541674/150‑1 GAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG > 2:1253824/1‑50 GAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGG < 1:1253824/50‑1 GGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCttg > 1:1547989/1‑68 GGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCttg < 2:1547989/71‑4 GGTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGTGGCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCC > 1:1207038/1‑150 GTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCA > 1:517559/1‑99 GTTTACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCA < 2:517559/99‑1 ACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTC < 1:985244/133‑1 ACCCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTC > 2:985244/1‑133 CCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGC > 1:738885/1‑150 CCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAG < 1:504445/134‑1 CCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAG > 2:504445/1‑134 CCGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCACTCGATCCCATGGTGGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGC > 2:445088/1‑150 GAATGCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGCCCCG > 1:1400836/1‑150 GCGTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGCCCCGCGTA > 1:574253/1‑150 GTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGCCCCGCGTATT > 2:587942/1‑150 GTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGA < 1:1010381/105‑1 GTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGA > 2:1010381/1‑105 CTTGGCGTGGGCAAGCTGCGTCACCTGGGGCCGCCGCTGAAATACGCGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4339946‑4340118 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggccctgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgTCGGTGGTGTCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCCGCTAAATCAATTGCTTGTGTGTTCTCAGCCATCCATCCCCGGGTCGAACGGGATGCTCTGCACCACCTCCAGCTCATAGCCCGCCAGCCCCGCGTATT < NC_002947/4340134‑4339986 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |