Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,768,100 | C→T | A699A (GCC→GCT) | PP_1577 → | lambda family tail tape meausure protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,768,100 | 0 | C | T | 97.9% | 142.7 / NA | 48 | A699A (GCC→GCT) | PP_1577 | lambda family tail tape meausure protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (21/26); minor base G (0/1); total (21/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGGCGGCACAGGTGGCCATGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGC > NC_002947/1767957‑1768218 | gcggcgGCACAGGTGGCCATGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCt < 1:190787/150‑1 (MQ=255) gTGGCCATGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCAc > 1:944446/1‑150 (MQ=255) gCCATGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACggt > 2:1450091/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACggtgg < 1:207085/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACggtggt > 1:311696/1‑150 (MQ=255) ggccggccTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACggtctcag < 2:50843/150‑6 (MQ=255) ccTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGaaaa < 2:311696/150‑1 (MQ=255) aaCGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCttt > 2:369662/1‑118 (MQ=255) aaCGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCttt < 1:369662/118‑1 (MQ=255) cGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATccc > 2:285414/1‑150 (MQ=255) cGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGAAGTCCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATccc > 2:1238165/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCGATGGTCGGGTTTCGCTGCGTGGGGCCGCCAACTGGTCCTGTCGCTGCCATTGCGGCGGCAGCCGCAACAGGCGTGTTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCga < 2:577942/150‑1 (MQ=255) ggTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGagag > 2:1119275/1‑136 (MQ=255) ggTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGagag < 1:1119275/136‑1 (MQ=255) ggTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGgctgct < 1:285414/150‑1 (MQ=255) tgcggtCGTGGGGCGGGCAAGTGCAGCGGGCGCTGCGATTGCAGCGGCAGCCGCGGCAGGCGTGCTGAGGACGGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGa < 2:534620/145‑1 (MQ=255) cccTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGAt < 1:701276/150‑1 (MQ=255) cTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATgg > 2:1237580/1‑150 (MQ=255) ggggCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcga < 1:1011915/150‑1 (MQ=255) gggCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgag > 1:798720/1‑150 (MQ=255) ggCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagc < 2:798720/150‑1 (MQ=255) ccGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagcga > 2:470620/1‑150 (MQ=255) ccGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGCCGGGCCGATGACTGGGGTTGACTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGAGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagcga < 1:1218234/150‑1 (MQ=255) ttGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTcc < 1:240883/147‑1 (MQ=255) ttGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTcc > 2:240883/1‑147 (MQ=255) tGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAg < 1:228689/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGc < 1:470620/150‑1 (MQ=255) cACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagc > 1:1010685/1‑138 (MQ=255) cACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGgcgagc < 2:1010685/138‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTg > 1:387297/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCTGCGAGAggg > 1:1365296/1‑105 (MQ=255) cgcTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAggg < 2:1365296/105‑1 (MQ=255) gcTGCCATTGCAGCCACAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAg > 1:1572147/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCgg < 1:569231/150‑1 (MQ=255) aTTGCAGCAGCAGACGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCgg > 2:468897/1‑150 (MQ=255) gcagcggcagccGGAGCAGGCGTGCGGAGGACTGGGGTGGGCTCGGCGCTTTCTGGGCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAGCATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGAc < 1:513659/150‑1 (MQ=255) cagccgcagccgCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCCGGCCTTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGAcc > 1:402537/1‑150 (MQ=255) gccgcagccgcaGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTc < 1:429275/150‑1 (MQ=255) cgcagccgcagcAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCAc < 2:1555762/150‑1 (MQ=255) gcagccgcagcAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCAcc > 2:850527/1‑150 (MQ=255) cagccgcagcAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCg < 2:944446/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTAc < 1:850527/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTAc < 1:468897/150‑1 (MQ=255) cagGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGc > 1:488516/1‑150 (MQ=255) tgatgaCTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGAc > 2:542327/1‑125 (MQ=255) tgatgaCTGGGGTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGAc < 1:542327/125‑1 (MQ=255) gTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGctgctg < 1:924009/72‑1 (MQ=255) gTTGGCTCGGCTCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGctgctg > 2:924009/1‑72 (MQ=255) | GCGGCGGCACAGGTGGCCATGGCCGGCCTGAACGCATTCACCGCGATGATCGGGGTTCCCTTCGTGGGGCCGGCAATTGCACCTGGCGCTGCCATTGCAGCCGCAGCCGCAGCAGGCGTGCTGATGACTGGGGTTGGCTCGGCCCTTTCTGGCCAGGCTCACGGTGGTATGGAAAACATCCCGCGAGAGGGTACCTGGCTGCTGGATGGCGGCGAGCGAGTCCTCAGCCCTGCGCAGAACCGGGACCTCACCGGCTACCTGC > NC_002947/1767957‑1768218 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |