New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1706038 = | 25 (0.700) | 7 (0.200) | 7/260 | 3.0 | 22.6% | coding (61/924 nt) | PP_1500 | lipoprotein |
? | NC_002947 | 1706064 = | 24 (0.700) | coding (87/924 nt) | PP_1500 | lipoprotein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TGAGTGCGCTGTCGGCCTGGATGTGCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTGCCAGCCAAGGCCGGGGTCGAGGTCAAGG > NC_002947/1705915‑1706206 | tGAGTGCGCTGTCGGCCTGGATGTGCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCagcagc < 2:397252/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGATGTGCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATCGAAGCCGACTACGCGAACATGCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTa < 1:778329/150‑1 (MQ=255) gATGTGCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGc < 2:344659/150‑1 (MQ=255) gCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTAcc < 1:261681/139‑1 (MQ=255) gCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTAcc > 2:261681/1‑139 (MQ=255) ccaccTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGc > 1:752027/1‑150 (MQ=255) tCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAAt > 2:115088/1‑150 (MQ=255) aTTGAAGCAGACTACGCGAACATTCTATGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGACTTGGCGGATACAACAGGCTGTTGTTGTAGGCCGAGCGTGTTCACGCTAGCATCGCTGAGCGTGCCAAGCGGGACTACcg > 2:53495/1‑150 (MQ=255) gcgAACATCCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTg > 1:436219/1‑95 (MQ=255) gcgAACATCCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTg < 2:436219/95‑1 (MQ=255) gAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGAt < 1:711651/137‑1 (MQ=255) gAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGAt > 2:711651/1‑137 (MQ=255) gCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCAt > 2:417436/1‑150 (MQ=255) ccgccTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCt > 1:430533/1‑150 (MQ=255) tGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACg < 2:568202/150‑1 (MQ=255) tGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTAACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACg < 1:115088/150‑1 (MQ=255) cTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGGGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCGAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGt > 1:335802/1‑150 (MQ=255) cGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTtg < 2:430533/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTgcca < 1:417436/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTgccag > 1:435071/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCTTCCCGAATGCAGCGTCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTCCCAGCCAAgg > 2:215225/1‑150 (MQ=255) ggcggcTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTGCCAGCCAAGGCCGGGGTCGAg < 1:586514/150‑1 (MQ=255) ggcggcTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACACTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTGCCAGCCAAGGCCGGGGTCGAg < 2:137216/150‑1 (MQ=255) gcagcaGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTGCCAGCCAAGGCCGGGGTCGAGGTCAAgg < 2:752027/150‑1 (MQ=255) | TGAGTGCGCTGTCGGCCTGGATGTGCTTCTCCAACTTCCTCAACCACCTGAGCCTGGATCGCATTGAAGCCGACTACGCGAACATTCTCTGAGCACTGCCGCCTGCTCGTCCTCGGCCTGGCCCTGCTGAGCCTTGGCGGCTGCAGCAGCCTGTTGTTCTACCCCGAGCGTGGTCAGGCCTTCACCCCTGAGCGTGCCAAGCTGGAATACCGCGATGTCACGCTGACCACTGCTGATGGCATCCGCCTTCACGGTTGGTGGCTGCCAGCCAAGGCCGGGGTCGAGGTCAAGG > NC_002947/1705915‑1706206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |