New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5506637 | 66 (1.200) | 16 (0.370) | 11/214 | 3.1 | 25.2% | intergenic (+48/‑151) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
? | NC_002947 | = 5506650 | 43 (0.990) | intergenic (+61/‑138) | PP_4839/cycA | iron‑regulated membrane protein/D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTATGACGCAAACC > NC_002947/5506501‑5506799 | tGTTCCAGCTGGTGGGTGTGTTGAGTGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGACAACGGTTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGtt < 1:420777/150‑1 (MQ=38) ttCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGt < 1:196025/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTa < 1:900103/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTa < 1:970974/149‑1 (MQ=255) cccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTa > 2:970974/1‑149 (MQ=255) cccGCTGGTGGCGGTTTCGTTGGTGGTGGTGTGGTGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAg < 2:1074649/150‑1 (MQ=39) accGGTGGGGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAg < 2:1030363/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAgg < 2:980375/150‑1 (MQ=255) tggtggGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTTTAGGAGCg < 2:24304/150‑1 (MQ=255) gtggGGGTGCCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCggg < 2:1032823/150‑1 (MQ=255) ggggTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGttt > 1:826627/1‑150 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTAcc > 2:1311502/1‑145 (MQ=255) gATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:1311502/145‑1 (MQ=255) ggtggtggtGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGGGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAGGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 2:769961/150‑1 (MQ=255) tgATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGc < 1:289254/128‑1 (MQ=255) tgATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGc > 2:289254/1‑128 (MQ=255) ggggTGGGTGGGTTGGGGGTGTGGCGCCGCGGGGTCTTGGCCAGCGTTTGGGCCTTGTGGTGCCTGTGGTGGCCTCTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACAA‑G‑GCGGTCAC‑TCGTATGAGCTGGTTTCGCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGc < 2:660742/150‑1 (MQ=9) gggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTa < 1:706207/126‑1 (MQ=255) gggTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:706207/1‑126 (MQ=255) gTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCACTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACACGCTACTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGaa < 2:496914/150‑1 (MQ=255) tAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:573123/134‑1 (MQ=255) tAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 2:573123/1‑134 (MQ=255) gtggtgAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGa > 2:1226881/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATg > 2:137617/1‑150 (MQ=255) ggCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa < 2:98097/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCag > 2:1292110/1‑150 (MQ=255) ccgccgGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCgg > 1:781654/1‑96 (MQ=255) ccgccgGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCgg < 2:781654/96‑1 (MQ=255) cgccgGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTc < 1:1226881/150‑1 (MQ=255) cggggTCTTGGCCACCGCTTGAGCCTTCTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTTTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGa < 2:621917/148‑1 (MQ=255) ccgGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGa < 1:1043206/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCt < 1:137617/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGccc < 2:826627/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGAGCCATGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGccc > 1:232973/1‑150 (MQ=255) gtTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCTGGTTTTCCCTCGAAGAGGCCGGTACAAGCGAAATGCTTATCCGAAAATGCAGAAGCGATCTGTCGCGCGCCGAGCTGGAAcggacgt > 2:613031/1‑145 (MQ=25) ttGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTGGCGCCCCGATCTGGAACGCGCgtg > 1:535667/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCgtg > 2:726262/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGtt > 1:957323/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAGA‑A‑G‑GACCGCGTTCTCGGTCCGGGCGTACCCGGGAAAATGCCGGTACAGGCGAACTGCTGAGCCGGAGATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGtt > 1:24913/1‑150 (MQ=37) gtgCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTtagcc > 1:916513/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa < 1:1077239/104‑1 (MQ=255) cTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCa > 2:1077239/1‑104 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 2:707754/66‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 1:707754/1‑66 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTAc > 2:803296/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGCG‑GTCC‑C‑TCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTAc > 2:1221299/1‑150 (MQ=21) ggTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGa < 2:232973/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCCGAGACGATCTGTCGCGCCCCGAGCTGGAACGCGCGGGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaa > 2:885137/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaa < 1:1292110/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaa < 1:726262/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGttt < 1:773880/38‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGttt > 2:773880/1‑38 (MQ=255) cccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGGACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaa > 2:1184437/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTg < 2:899893/109‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTg > 1:899893/1‑109 (MQ=255) ccGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACaagaag > 2:889224/1‑150 (MQ=255) tACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAg > 2:1248185/1‑150 (MQ=255) aCGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGc < 1:889224/150‑1 (MQ=255) a‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTa < 2:1252407/150‑1 (MQ=255) g‑gACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa > 2:357969/1‑143 (MQ=255) g‑gACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa < 1:357969/143‑1 (MQ=255) cgcgTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa > 1:709859/1‑139 (MQ=255) cgcgTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCa < 2:709859/139‑1 (MQ=255) cgcgTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGATGAGCCGGAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTATGACGc > 2:118286/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTATGACGCAAAcc < 2:24913/150‑1 (MQ=255) | TGTTCCCGCTGGTGGGGGTGTCGATGGTGGTGATGTGGGGGGTGGATAGTTTGGTGGTGAGGCGCCGCCGGGTCTTGGCCAGCGCTTGAGCCTTGTGTTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGA‑G‑G‑GACCGCGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCGAAATGCTGAGCCGAAAATGCAGAGTCGATCTGTCGCGCCCCGATCTGGAACGCGCGTGTTAGCCTAGCCGGCTACCTCTGACAAGAAGACTGCAGCCTATGACGCAAACC > NC_002947/5506501‑5506799 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |