| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 745964 | NA (NA) | 9 (0.080) | 7/234 | NT | NA | coding (538/1533 nt) | PP_0637 | transposase |
| ? | NC_002947 | = 745974 | NA (NA) | coding (528/1533 nt) | PP_0637 | transposase | |||||
TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/745811‑745964‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAGC < NC_002947/745974‑745826 TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGATTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCG > 2:1987226/1‑150 CAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGC < 1:981394/150‑1 CAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCCTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGa < 1:1537777/150‑2 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 2:71530/150‑1 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 2:1926595/150‑1 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 2:397892/150‑1 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 1:1689708/150‑1 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 2:2314435/150‑1 GTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG > 2:634545/1‑150 GTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG > 1:2200034/1‑150 GCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGT < 2:887947/146‑1 GCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGT > 1:887947/1‑146 GGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGC < 2:1349625/102‑1 GGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGC > 1:1349625/1‑102 CAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA > 2:2754624/1‑101 CAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 1:2754624/101‑1 CGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG < 2:573697/82‑1 CGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG > 1:573697/1‑82 GATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGA < 1:2910428/98‑1 GATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGA > 2:2910428/1‑98 GTTCAGCACCGTCTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGA < 1:2955362/86‑1 GTTCAGCACCGTCTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGA > 2:2955362/1‑86 CCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATG > 1:2555461/1‑80 CCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATG < 2:2555461/80‑1 TTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG‑CAC‑GCTGGGACTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATC > 1:328340/1‑150 GCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTT < 1:1517173/150‑1 GCCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTT < 2:2594539/150‑1 CCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 1:2511910/1‑150 CCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 2:2535894/1‑150 CCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC < 1:2535894/150‑1 CCAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC < 1:1133271/150‑1 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGACCACTATCA < 2:2818937/150‑1 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA > 1:1942781/1‑150 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA > 1:1374449/1‑150 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGG < 1:1264816/124‑1 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGG > 2:1264816/1‑124 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGA < 2:2263633/96‑1 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGA > 1:2263633/1‑96 CAGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGAGGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTCACGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 1:1457889/150‑1 AGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAG > 1:1445937/1‑150 AGTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAG > 1:898664/1‑150 GTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAGC < 1:1507996/150‑1 GTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGCACTGCCTCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAGC < 1:187928/150‑1 TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/745811‑745964‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagTCCCAGC‑GTG‑CTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAGC < NC_002947/745974‑745826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |