| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4033402 = | 167 (1.460) | 11 (0.100) | 11/238 | NT | 6.4% | coding (996/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
| ? | NC_002947 | 4033426 = | 158 (1.420) | intergenic (+12/+2) | PP_3555/PP_3556 | transmembrane sensor/membrane protein | |||||
ACCACCACATCTGGGACACCGTGGTGCCCACCTTCATCCATTACAACCTGCCGTTGATGGCGTTCGGCTGGTTGGCAGCGATGACCTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4033519‑4033402‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccgCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGAGTCCGAGGCCGG > NC_002947/4033426‑4033574 ACCACCACATCTGGGACACCGTGGTGCCCACCTTCATCCATTACAACCTGCCGTTGATGGCGTTCGGCTGGTTGGCAGCGATGACCTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGC > 1:241332/1‑116ACCACCACATCTGGGACACCGTGGTGCCCACCTTCATCCATTACAACCTGCCGTTGATGGCGTTCGGCTGGTTGGCAGCGATGACCTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGC < 2:241332/116‑1 CCTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGC < 2:2527683/149‑1 CCTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGC > 1:2527683/1‑149 CTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGT > 1:1774748/1‑127 CTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGT < 2:1774748/127‑1 TTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTT < 2:1212630/142‑1 TTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTT > 1:1212630/1‑142 GCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCANCCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCAC > 1:1267720/1‑132 GCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCAC < 2:1267720/132‑1 GAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCAT < 1:2903200/58‑1 GAGGGCGTCAGCCCTTGCCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCAT > 2:2903200/1‑58 GTCAGCCCTTGCCGCCTTACAGGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTA < 2:2927497/67‑1 CCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGA > 2:1323226/1‑140 CCGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGA < 1:1323226/140‑1 CGCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGAGTCCGAGGCCG > 2:1312620/1‑150 GCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGAGTCCGAGGCCGG > 2:1207753/1‑150 GCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGAGTCCGAGGCCGG < 2:882495/150‑1 GCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGAGTCCGAGGCCGG < 2:893855/150‑1 ACCACCACATCTGGGACACCGTGGTGCCCACCTTCATCCATTACAACCTGCCGTTGATGGCGTTCGGCTGGTTGGCAGCGATGACCTTGTAAGGCGGGGAGGGCGTCAGCCCTTGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4033519‑4033402‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccgCCTTACAAGGTCATCGCTGCCAACCAGCCGAACGCCATCAACGGCAGGTTGTAATGGATGAAGGTGGGCACCACGGTGTCCCAGATGTGGTGGTGCTGGCCATCCACGTTCAGGCCCGAGGTCGGGCCCAGGGTCGAGTCCGAGGCCGG > NC_002947/4033426‑4033574 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |