New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1436037 = | 111 (0.970) | 15 (0.140) | 6/228 | NT | 12.1% | intergenic (‑67/+86) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 1436090 = | 114 (1.070) | intergenic (‑120/+33) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGT > NC_002947/1435893‑1436186 | ttcaacgagaccgacgtcctgaccgacgctcagcgcaactatgccgaacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtgggagcgggcgtgCCcgcg < 1:595056‑M1/6‑1 (MQ=255) tcaaTGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCGGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGAGAaca > 1:2807242/4‑150 (MQ=255) tCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGACTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTGCACCGCGAaca > 1:130902/1‑150 (MQ=255) aCGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGaa < 1:2525564/150‑1 (MQ=255) aCGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGaa > 1:2700057/1‑150 (MQ=255) tGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCgg > 1:1921222/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGt < 2:697901/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAtcaggcgacccggtgcatg > 1:1973990‑M1/1‑131 (MQ=255) cgGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGc < 2:2324195/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCAc > 2:2183468/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCg < 1:774760/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCg < 1:726605/150‑1 (MQ=255) gCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCgg < 1:306412/150‑1 (MQ=255) 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aCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTg < 1:1235771/150‑1 (MQ=255) aCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTg < 1:3069864/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAttcgcgggcacgcccgctcccacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgcccctcacag > 2:672374‑M2/1‑63 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGaa < 1:1800751/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAgc > 2:2901123/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGt < 1:2849386/91‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGt > 2:2849386/1‑91 (MQ=255) gatctCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCTGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTAct > 2:2411671‑M1/6‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgcccctcacaggcaacctgctgat < 2:1973990‑M2/150‑101 (MQ=255) gTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAg < 2:1884161/131‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTAct > 2:2961745/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc > 2:127967/1‑131 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTActgctg > 2:2183703/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTActgctg > 1:1478670/1‑150 (MQ=255) CCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGt > 1:2183468‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCACCTGCCGACGAGCGAGTACTCCTGt < 2:1709667‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGT > NC_002947/1435893‑1436186 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |