New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1436044 | 114 (1.000) | 10 (0.090) | 8/228 | NT | 8.3% | intergenic (‑74/+79) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | = 1436081 | 114 (1.070) | intergenic (‑111/+42) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCG > NC_002947/1435895‑1436189 | caacgagaccgacgtcctgaccgacgctcagcgcaactatgccgaacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtgggagcgggcgtgCCCGCGaa > 2:2294950‑M1/143‑150 (MQ=255) tCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaca > 1:2998676/1‑150 (MQ=255) aCGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGaa > 1:2700057/1‑150 (MQ=255) aCGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGaa < 2:2947305/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCgg > 1:1921222/1‑150 (MQ=255) ggCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGt < 2:697901/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCAGATCAGCAGCTTGTCTGTGAGGGGGATGGAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGCTTCCGACCCCTGCAGGACCGGGTTCCCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGcc < 2:2199661/150‑1 (MQ=255) cgGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGc < 2:2324195/150‑1 (MQ=255) 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ggAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAgc > 2:2901123/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGt > 2:2849386/1‑91 (MQ=255) gatctCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCTGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTAct > 2:2411671‑M1/6‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTAct > 2:2961745/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc > 2:127967/1‑131 (MQ=255) aCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTActgctg > 1:1478670/1‑150 (MQ=255) CCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGt > 1:2183468‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCACCTGCCGACGAGCGAGTACTCCTGt < 2:1709667‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgcccctcacaggcaacctgctgatcggcca < 1:97706‑M1/150‑144 (MQ=255) ccGCGAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagat < 2:2882257‑M1/103‑97 (MQ=255) ccGCGAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagat > 1:2882257‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgccc > 2:2010603‑M2/1‑44 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgccc < 1:2010603‑M2/124‑81 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc > 2:1069834‑M1/1‑129 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc < 1:1069834‑M1/129‑1 (MQ=255) cgcgAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgcccctcacaggcaacctgctgatcggccag > 2:2550799‑M1/1‑6 (MQ=255) cgcgAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgcccctcacaggcaacctgctgatcggccag > 1:2392513‑M1/1‑6 (MQ=255) CGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTc > 1:2814253‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggaggctacatgcccctcacaggcaacctgctgatcggcctct > 2:723632‑M1/1‑5 (MQ=255) gcgAAtcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggagg < 1:1240693‑M1/112‑108 (MQ=255) GCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCg < 2:2552651‑M1/150‑1 (MQ=255) atcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggagg < 2:825853‑M1/108‑108 (MQ=255) atcaggcgacccggtgcatggcaccggcttcgccggtgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaatcccccccatgcatctgcattagatttccaaggagg > 1:825853‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCG > NC_002947/1435895‑1436189 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |